化學(xué)蛋白組學(xué)分析：方法、優(yōu)勢(shì)與挑戰(zhàn)檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

在生命科學(xué)研究不斷深入的jīntiān，dànbáizhì功能的jīngzhǔn解析成為理解生命現(xiàn)象和疾病機(jī)制的關(guān)鍵路徑。而蛋白組學(xué)手段在解析dànbáizhì修飾、動(dòng)態(tài)變化和相互作用方面存在一定局限?；瘜W(xué)蛋白組學(xué)分析（chemical proteomics analysis），作為融合了有機(jī)化學(xué)、dànbáizhì組學(xué)與質(zhì)譜技術(shù)的新興交叉學(xué)科，正在重塑dànbáizhì功能研究的新范式。本文將系統(tǒng)介紹化學(xué)蛋白組學(xué)的核心方法、應(yīng)用優(yōu)勢(shì)及當(dāng)前面臨的挑戰(zhàn)，并探討百泰派克生物科技在該領(lǐng)域的技術(shù)布局與服務(wù)能力。

一、什么是化學(xué)蛋白組學(xué)分析？

化學(xué)蛋白組學(xué)是一種以小分子探針或化學(xué)修飾劑為工具，通過標(biāo)記、富集和質(zhì)譜檢測(cè)，大規(guī)模識(shí)別與功能性dànbáizhì、修飾位點(diǎn)及其相互作用的策略。其本質(zhì)是利用特定的化學(xué)反應(yīng)，靶向dànbáizhì的活性位點(diǎn)、結(jié)構(gòu)域或共價(jià)修飾位置，從而實(shí)現(xiàn)功能選擇性的dànbáizhì捕獲。這類方法特別適合分析：

* 活性蛋白酶組（活性位點(diǎn)標(biāo)記）

• 特定翻譯后修飾（如羥基化、硫酸化）

• 藥物-蛋白相互作用靶標(biāo)（靶向篩選）

二、化學(xué)蛋白組學(xué)方法：化學(xué)探針+富集+定量質(zhì)譜

1、活性位點(diǎn)標(biāo)記（Activity-Based Protein Profiling, ABPP）

ABPP 是化學(xué)蛋白組學(xué)中zuì具代表性的方法。它依賴小分子探針與dànbáizhì活性位點(diǎn)的共價(jià)結(jié)合，配合富集標(biāo)簽（如shēngwùsù）進(jìn)行親和純化，再通過LC-MS/MS進(jìn)行鑒定和定量。

2、藥物親和標(biāo)記（Drug Affinity Responsive Target Stability, DARTS）

DARTS 利用小分子藥物與靶標(biāo)蛋白結(jié)合后增強(qiáng)其抗蛋白酶降解能力的特性，通過質(zhì)譜比較降解前后蛋白豐度，篩選真實(shí)作用靶點(diǎn)。

3、Click Chemistry（點(diǎn)擊化學(xué)標(biāo)記）

Click Chemistry 是通過非天然氨基酸或修飾基團(tuán)的引入，利用點(diǎn)擊反應(yīng)（如銅催化的疊氮-炔反應(yīng)）將報(bào)告分子jīngzhǔn標(biāo)記到目標(biāo)蛋白，適合研究翻譯后修飾或空間結(jié)構(gòu)鄰近關(guān)系。

三、化學(xué)蛋白組學(xué)的dútè優(yōu)勢(shì)

1、功能選擇性強(qiáng)

與傳統(tǒng)質(zhì)譜依賴表達(dá)量不同，化學(xué)蛋白組學(xué)強(qiáng)調(diào)“功能性”篩選。這意味著能夠區(qū)分“活躍態(tài)”和“非活躍態(tài)”的蛋白，特別適合藥物機(jī)制研究。

2、適配復(fù)雜生物樣本

化學(xué)修飾和親和富集步驟極大提升了信噪比，可在細(xì)胞裂解液、組織勻漿、甚至體液樣本中富集低豐度功能蛋白，實(shí)現(xiàn)更高的檢測(cè)靈敏度。

3、與代謝組/轉(zhuǎn)錄組高度兼容

由于探針可以設(shè)計(jì)為代謝中間體、受體激動(dòng)劑等，化學(xué)蛋白組學(xué)可自然地與代謝組、藥物代謝動(dòng)力學(xué)研究協(xié)同，形成功能組學(xué)整合平臺(tái)。

四、當(dāng)前面臨的挑戰(zhàn)與技術(shù)瓶頸

盡管化學(xué)蛋白組學(xué)具有巨大潛力，但其發(fā)展仍面臨若干技術(shù)瓶頸：

1、探針設(shè)計(jì)與特異性問題

開發(fā)具高選擇性、高反應(yīng)性、低背景的小分子探針是該領(lǐng)域的關(guān)鍵挑戰(zhàn)。非特異性結(jié)合或靶標(biāo)漂移可能導(dǎo)致假陽(yáng)性。

2、數(shù)據(jù)解析復(fù)雜度高

與定量蛋白組學(xué)相比，化學(xué)修飾數(shù)據(jù)更依賴位點(diǎn)級(jí)別的信息解讀。因此，需要更jīngzhǔn的譜圖解釋算法與數(shù)據(jù)庫(kù)匹配策略。

3、標(biāo)準(zhǔn)化流程匱乏

由于大部分實(shí)驗(yàn)方案依賴定制化探針和手工操作，化學(xué)蛋白組學(xué)在臨床轉(zhuǎn)化中的可重復(fù)性和標(biāo)準(zhǔn)化仍需提升。

百泰派克生物科技在化學(xué)蛋白組學(xué)領(lǐng)域的服務(wù)布局

作為專注于多組學(xué)整合分析的科研服務(wù)提供商，百泰派克生物科技已建立起一整套化學(xué)蛋白組學(xué)+質(zhì)譜檢測(cè)+數(shù)據(jù)解析的閉環(huán)服務(wù)平臺(tái)。我們提供以下特色服務(wù)：

（1）ABPP-Labeling服務(wù)：結(jié)合shēngwùsù/熒光標(biāo)記、Streptavidin磁珠富集與Orbitrap平臺(tái)鑒定，適配多種酶類系統(tǒng)。

（2）靶標(biāo)捕獲與驗(yàn)證：基于小分子藥物或天然產(chǎn)物，通過DARTS等方案篩選真實(shí)靶標(biāo)。

（3）數(shù)據(jù)深度解讀與網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建：結(jié)合蛋白功能注釋、通路富集與蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析，助力客戶挖掘生物機(jī)制。

我們始終堅(jiān)持以科研驅(qū)動(dòng)為核心，為客戶提供從實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、樣本處理、質(zhì)譜分析到結(jié)果解讀的一站式解決方案。隨著探針化學(xué)與質(zhì)譜技術(shù)的不斷突破，化學(xué)蛋白組學(xué)將從單一功能篩選，逐步擴(kuò)展為藥物開發(fā)、疾病標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)乃至jīngzhǔn醫(yī)學(xué)的支撐平臺(tái)。百泰派克生物科技將繼續(xù)布局該領(lǐng)域的前沿技術(shù)，助力生命科學(xué)研究者解鎖dànbáizhì世界的更多未知。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù)，包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù)，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.技術(shù)優(yōu)良，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭?xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù)；

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái)，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

化學(xué)蛋白組學(xué)分析：方法、優(yōu)勢(shì)與挑戰(zhàn)檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹