SWATH-MS無標(biāo)記蛋白質(zhì)定量技術(shù)解析檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

在后基因組時(shí)代，系統(tǒng)性地識(shí)別和定量dànbáizhì成為理解生物過程和疾病機(jī)制的關(guān)鍵步驟。dànbáizhì組學(xué)發(fā)展迅速，從二維凝膠電泳到高分辨率質(zhì)譜技術(shù)的興起，定量策略也逐漸演化為更jīngzhǔn、可重復(fù)性更高的形式。其中，SWATH-MS（Sequential Window Acquisition of All Theoretical Mass Spectra）作為一種無標(biāo)記定量方法，正成為dànbáizhì組定量分析的重要工具。

一、SWATH-MS技術(shù)概述

SWATH-MS是基于數(shù)據(jù)獨(dú)立采集（DIA, Data-Independent Acquisition）的質(zhì)譜方法，它將質(zhì)譜分析過程劃分為一系列特定的m/z窗口，對(duì)每個(gè)窗口內(nèi)的所有離子進(jìn)行并行碎裂。在SWATH-MS中，質(zhì)譜儀按照預(yù)設(shè)m/z區(qū)間順序掃描樣本中所有的前體離子，每個(gè)窗口內(nèi)的所有離子幾乎同時(shí)被碎裂并記錄。這一策略大大提高了數(shù)據(jù)采集的全面性與重現(xiàn)性，使得對(duì)復(fù)雜生物樣本中dànbáizhì的全面無偏識(shí)別與定量成為可能。

二、SWATH-MS的工作原理詳解

SWATH-MS的核心流程可分為以下幾個(gè)關(guān)鍵步驟：

1、m/z窗口的劃分與采集

儀器將整個(gè)m/z范圍劃分為若干個(gè)固定寬度的窗口（例如25 m/z寬度），在質(zhì)譜采集過程中，每個(gè)窗口中的所有離子被碎裂。與DDA相比，SWATH不依賴實(shí)時(shí)離子選擇，而是系統(tǒng)性地對(duì)所有窗口進(jìn)行采集，因此被稱為無偏全掃描模式。

2、全掃描MS/MS數(shù)據(jù)的獲取

每個(gè)m/z窗口的所有前體離子碎裂產(chǎn)生大量MS/MS譜圖，記錄了特定時(shí)間段內(nèi)的碎片離子信息。由于信息密度高且復(fù)雜，原始數(shù)據(jù)需要借助已有的光譜庫進(jìn)行解析。

3、參考光譜庫進(jìn)行識(shí)別與定量

SWATH-MS的dànbáizhì識(shí)別依賴于事先構(gòu)建的光譜庫（通常來自DDA數(shù)據(jù)），通過匹配保留時(shí)間、碎片離子m/z和強(qiáng)度等特征，實(shí)現(xiàn)目標(biāo)肽段的識(shí)別與定量。這一過程需要借助zhuānyè軟件，如OpenSWATH、Spectronaut、DIA-NN等。

三、SWATH-MS的優(yōu)勢(shì)分析

1、無需標(biāo)記，降低實(shí)驗(yàn)成本與復(fù)雜性

SWATH-MS不依賴于iTRAQ、TMT等同位素標(biāo)記策略，避免了標(biāo)記效率偏差與樣本通量限制。尤其適用于臨床樣本、動(dòng)物組織等不易進(jìn)行標(biāo)記的材料。

2、高重現(xiàn)性，適合大規(guī)模隊(duì)列研究

由于其基于固定掃描窗口的全覆蓋式采集，SWATH-MS在重復(fù)性方面表現(xiàn)優(yōu)異。其跨批次、一致性強(qiáng)的數(shù)據(jù)特性，非常適合應(yīng)用于疾病隊(duì)列研究、生物標(biāo)志物篩選等需要高穩(wěn)定性的場(chǎng)景。

3、定量動(dòng)態(tài)范圍廣，識(shí)別低豐度蛋白

SWATH-MS通過對(duì)所有前體離子的全面掃描，顯著提升了低豐度蛋白的檢出率。結(jié)合高分辨質(zhì)譜儀器，可以實(shí)現(xiàn)較廣泛的動(dòng)態(tài)范圍覆蓋，有助于深入解析信號(hào)通路中關(guān)鍵但不易被檢測(cè)的蛋白因子。

4、可重分析性強(qiáng)，利于數(shù)據(jù)挖掘

SWATH-MS數(shù)據(jù)保留了所有碎片離子的原始信息，后期可基于新的光譜庫重復(fù)進(jìn)行數(shù)據(jù)解析。這種“可重用性”在生物信息分析與數(shù)據(jù)庫建設(shè)中具有重要意義。

四、SWATH-MS在科研與轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用

SWATH-MS的應(yīng)用場(chǎng)景正在迅速擴(kuò)展，涵蓋從基礎(chǔ)研究到臨床轉(zhuǎn)化的多個(gè)領(lǐng)域。

1、生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)

在腫瘤、神經(jīng)退行性疾病、代謝疾病等研究中，SWATH-MS憑借其高通量和定量準(zhǔn)確性，廣泛用于尋找疾病特異性蛋白表達(dá)模式。例如，在癌癥dànbáizhì組研究中，SWATH-MS成功鑒定出多個(gè)與復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)的差異蛋白。

2、藥物作用機(jī)制研究

SWATH-MS可用于比較藥物處理前后樣本的dànbáizhì表達(dá)譜，幫助揭示藥物作用靶點(diǎn)及信號(hào)通路變化。其高重現(xiàn)性的特點(diǎn)特別適合劑量梯度與時(shí)間梯度實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)。

3、跨物種蛋白表達(dá)比較

在模式生物（如小鼠、斑馬魚）與人類組織的dànbáizhì表達(dá)譜對(duì)比中，SWATH-MS提供了穩(wěn)定而全面的數(shù)據(jù)支持，為功能保守性研究提供重要線索。

4、多組學(xué)集成分析

SWATH-MS可與轉(zhuǎn)錄組、代謝組數(shù)據(jù)協(xié)同分析，構(gòu)建多層次調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。例如在免疫研究中，通過整合dànbáizhì組與轉(zhuǎn)錄組信息，可以發(fā)現(xiàn)炎癥反應(yīng)中蛋白翻譯后修飾的關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)。

SWATH-MS作為無標(biāo)記、數(shù)據(jù)獨(dú)立采集的dànbáizhì定量技術(shù)，已逐步發(fā)展為dànbáizhì組學(xué)研究的中堅(jiān)力量。在科研需求日益精細(xì)化的當(dāng)下，SWATH-MS不僅是技術(shù)選擇，更是驅(qū)動(dòng)科學(xué)發(fā)現(xiàn)與臨床轉(zhuǎn)化的引擎。歡迎關(guān)注百泰派克生物科技。我們致力于提供高質(zhì)量、高覆蓋率的SWATH定量蛋白組學(xué)服務(wù)，為您的科學(xué)研究注入新動(dòng)力。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù)，包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù)，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.技術(shù)優(yōu)良，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭?xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù)；

2.獲國家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái)，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

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