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Vitae NGS-M解放雙手,快速高成功率構(gòu)建文庫(kù)

來(lái)源:睿科集團(tuán)股份有限公司   2023年04月07日 15:31  
 產(chǎn)品介紹


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Vitae NGS-M自動(dòng)化文庫(kù)構(gòu)建工作站

尺寸:1200mm*750mm*1085mm

 

Vitae NGS-M自動(dòng)化文庫(kù)構(gòu)建工作站是一款適用于遺傳病篩查、腫瘤早篩、腫瘤檢測(cè)、病原微生物檢測(cè)、NIPT等領(lǐng)域,滿足中通量(1-32個(gè)樣本/run)的建庫(kù)需求,可自動(dòng)化完成文庫(kù)構(gòu)建和靶向捕獲流程的文庫(kù)構(gòu)建工作站。

 

手工建庫(kù)挑戰(zhàn)


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目前,隨著高通量測(cè)序在遺傳病篩查、腫瘤早篩、腫瘤檢測(cè)、病原微生物檢測(cè)、NIPT等臨床診斷中的普遍應(yīng)用,將測(cè)序前繁瑣的文庫(kù)構(gòu)建進(jìn)行自動(dòng)化和標(biāo)準(zhǔn)化是一個(gè)必然趨勢(shì),文庫(kù)構(gòu)建工作實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化,可以有效保證文庫(kù)質(zhì)量的均一性,避免文庫(kù)的重復(fù)構(gòu)建,節(jié)省人力成本和經(jīng)濟(jì)成本。

Vitae NGS-M 自動(dòng)化文庫(kù)構(gòu)建工作站適用于中通量(1-32個(gè)樣本/run)的建庫(kù)需求,自動(dòng)化完成文庫(kù)構(gòu)建和靶向捕獲流程。

 

產(chǎn)品特點(diǎn)

 

8通道移液頭

兼具單通道功能,可以實(shí)現(xiàn)反應(yīng)Mix的配置和分裝;

32通道移液頭

一次可處理最多32個(gè)樣品,用于實(shí)驗(yàn)流程中的吹吸混勻,磁珠純化過(guò)程中的吸廢等;

通量高

18個(gè)SBS標(biāo)準(zhǔn)盤(pán)位

除功能模塊,另有9個(gè)SBS標(biāo)準(zhǔn)盤(pán)位放置試劑和耗材,大大提高實(shí)驗(yàn)通量;

安全穩(wěn)定

搭載紫外消毒燈

可選配正、負(fù)壓HEPA過(guò)濾裝置

建庫(kù)產(chǎn)出穩(wěn)定,質(zhì)控符合測(cè)序要求

一鍵啟動(dòng)

可將驗(yàn)證后的實(shí)驗(yàn)流程進(jìn)行儲(chǔ)存

按鍵式啟動(dòng)文庫(kù)制備

實(shí)現(xiàn)標(biāo)準(zhǔn)化、經(jīng)驗(yàn)證的NGS自動(dòng)化建庫(kù)流程;

操作靈活

整合抓板手用于對(duì)標(biāo)準(zhǔn)SBS板子的轉(zhuǎn)移;

高度集成

整合桌面式PCR擴(kuò)增循環(huán)儀

自帶封膜及熱蓋功能,實(shí)現(xiàn)全自動(dòng)化;

功能一體

包含建庫(kù)所需PCR板加熱模塊、PCR板制冷模塊、定制試劑冷槽、PCR板磁吸附模塊、PCR板振蕩模塊、PCR儀等模塊;

 

應(yīng)用舉例


下面以DNA建庫(kù)、靶向捕獲為例,展示可在Vitae NGS-M上實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化的流程:

(一)DNA建庫(kù)

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(二)靶向捕獲

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建庫(kù)質(zhì)量實(shí)驗(yàn)結(jié)果


文庫(kù)濃度&文庫(kù)分布


Vitae NGS-M 自動(dòng)化文庫(kù)構(gòu)建工作站第一輪、第二輪建庫(kù)和手工建庫(kù)抽檢6個(gè)樣本,使用Qubit3.0和Agilent 4200檢測(cè)結(jié)果如下:

6個(gè)樣本和文庫(kù)的基本信息

 

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6個(gè)文庫(kù)片段大小分布

 

小結(jié):

a、文庫(kù)濃度均達(dá)到測(cè)序需求;

b、文庫(kù)插入片段大小分布正常(350bp),與預(yù)期一致。

 

文庫(kù)測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)控

 

 

6個(gè)文庫(kù)測(cè)序數(shù)據(jù)表

 

 

 

 

6個(gè)文庫(kù)堿基含量分布圖

小結(jié):

a、文庫(kù)GC含量及GC分布正常;

b、文庫(kù)比對(duì)率及覆蓋度正常。

 

通道均一性


Vitae NGS-M 自動(dòng)化文庫(kù)構(gòu)建工作站第三輪建庫(kù)8個(gè)文庫(kù),電泳圖如下:

 

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圖3:Vitae NGS-M第三輪建庫(kù)文庫(kù)電泳圖

 

小結(jié):

機(jī)器8通道具有較好的均一性。

 

總結(jié)

相比手工建庫(kù),Vitae NGS-M自動(dòng)化建庫(kù)效率更高、數(shù)據(jù)表現(xiàn)更穩(wěn)定,可生成高度均一的文庫(kù)。

面對(duì)繁瑣的樣本制備步驟,??芕itae NGS-M 自動(dòng)化文庫(kù)構(gòu)建工作站可實(shí)現(xiàn)文庫(kù)構(gòu)建自動(dòng)化,解放雙手,提高效率,讓研究員投入更有意義、價(jià)值的研究中去。

 

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