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T7高收率RNA合成試劑盒優(yōu)化轉(zhuǎn)錄反應體系

來源:上?;菡\生物科技有限公司   2024年08月26日 16:10  

T7高收率RNA合成試劑盒優(yōu)化轉(zhuǎn)錄反應體系,利用T7 RNA聚合酶,以T7啟動子序列為模板的線性雙鏈DNA,以NTPs為底物控制啟動子下游DNA序列,高效合成單鏈RNA。在轉(zhuǎn)錄過程中,修飾過的核苷酸可以加入底物中制備生物素或染料標記RNA。T7 Co-transcription RNA Synthesis Kit 進行了轉(zhuǎn)錄反應體系的優(yōu)化,試劑盒使用T7 RNA聚合酶并以含有T7啟動子序列的線型雙鏈DNA為模板,以NTPs為底物,對啟動子下游的DNA序列進行轉(zhuǎn)錄,高效合成單鏈RNA。轉(zhuǎn)錄時可在底物中加入修飾的核苷酸,制備生物素或染料標記的RNA。

產(chǎn)品信息:

貨號規(guī)格產(chǎn)品名稱
HC10111-HC301150TT7 Co-transcription RNA Synthesis Kit (HC3011), 50 reactions
HC10111-HC311150TT7 Co-transcription RNA Synthesis Kit (HC3111),50 reactions
HC10111-HC3011250TT7 Co-transcription RNA Synthesis Kit (HC30112), 50 reactions
HC10111-HC3011650TT7 Co-transcription RNA synthesis kit (HC30116),50 reactions
HC10111-HC401150TT7 Co-transcription RNA synthesis kit (HC4011),50 reactions
HC10111-HC501150TT7 Co-transcription RNA synthesis kit (HC5011),50 reactions
HC10111-HC701150TT7 Co-transcription RNA synthesis kit (HC7011), 50 reactions
HC10111-HC801150TT7 Co-transcription RNA synthesis kit (HC8011),50 reactions
HC10111-HC901150TT7 Co-transcription RNA synthesis kit (HC9011),50 reactions


產(chǎn)品組分:

T7 RNA Polymerase Mix、10xTranscription Buffer、ATP/CTP/GTP/N1-Me-PUTP、CAP GAG、質(zhì)粒DNA模板

試劑盒中帽類似物可進行選擇,惠誠生物可提供帽類似物:CAP GAG、CAP GAG (3'OMe)、CAP GAU、CAP GAG(m6A)以及新型帽類似物CAP4、CAP5、CAP7、CAP8、CAP 等

以下成分以EasyCаp™ GAG  m7G(5')ppp(5')(2'OMeA)pG 100mM Ammonium solution, GMP grade 貨號:CAP3011為例:

編號

名稱
10111-AT7 RNA Polymerase Mix
10111-B10×Transcription Buffer

10111-C

ATP(100mM)
10111-DCTP(100mM)
10111-EGTP(100mM)
10111-FN1-Me-pUTP(100mM)
10111-GCAP GAG(100mM)
10111-HControl DNA Template(500ng/μL)












常見問題解答:

1. 轉(zhuǎn)錄產(chǎn)量低

模板的質(zhì)量與成品率密切相關。試驗組的產(chǎn)量顯著低于對照組,可能的原因有:①實驗模板含有抑制成分;模板有問題。

建議:①重新純化模板;②確定模板定量及其完整性;③延長反應時間;④增加模板輸入量;⑤嘗試其他啟動子和RNA聚合酶。

2. 短轉(zhuǎn)錄產(chǎn)量低

短轉(zhuǎn)錄起始片段會抑制該反應。當轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物小于100 nt時,延長反應時間至4-8 hs或增加模板量至2 μg均可提高RNA產(chǎn)量。

3.RNA轉(zhuǎn)錄長度大于預期

如果電泳顯示產(chǎn)物條帶大于預期條帶,可能的原因是:①質(zhì)粒模板可能沒有完(空)全線性化;②感覺鏈3’端結(jié)構(gòu)突出;③RNA具有未完(空)全變性的二級結(jié)構(gòu)。

建議:①檢查模板是否完(空)全線性化,必要時進行額外線性化;②選擇合適的限制性內(nèi)切酶,避免3'外翻,或使用Klenow Fragment /T4 DNA聚合酶完成轉(zhuǎn)錄后再繼續(xù);③用變性凝膠檢測RNA產(chǎn)物。

4. RNA轉(zhuǎn)錄長度低于預期

如果電泳顯示產(chǎn)物條帶小于預期大小,可能的原因是:①模板中含有類似于T7 RNA聚合酶的終止序列;②模板中GC含量較高。

建議:①降低反應溫度(如30℃)。有時降低溫度可以增加轉(zhuǎn)錄長度,但會降低產(chǎn)量。或者嘗試不同的RNA聚合酶進行轉(zhuǎn)錄;②若模板GC含量較高,可采用42℃轉(zhuǎn)錄,或添加SSB以增加產(chǎn)量和轉(zhuǎn)錄長度。

5. 轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的電泳跟蹤

電泳過程中出現(xiàn)拖尾現(xiàn)象。可能原因:①實驗操作過程中被RNase污染;②RNase污染DNA模板。

建議:①使用不含RNase的移液針尖和EP管,佩戴一次性乳膠手套和口罩,所有試劑均使用不含RNase的H2O制備。②重新純化模板DNA。


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