回答這個問題可以從細菌的菌體大小、人眼及顯微鏡的分辨率等方面來討論。

1、細菌的菌體大小一般是微米級別的，以大腸桿菌為例：長度約為1um，寬度約為0.5um。

2、分辨率是指能被清晰區(qū)分的兩個物點的zui小間距。

顯微鏡的分辨率是指顯微鏡放大成像后，所能清晰區(qū)分的兩個物點的zui小間距。

儀器的分辨率是指儀器提供被測對像微細結(jié)構(gòu)信息的能力。分辨率越高則提供的信息越細致。超出放大極限的放大倍數(shù)被稱為無效放大，無效放大不能夠提供更多的細微結(jié)構(gòu)的信息。

3、人眼的分辨率是0.1mm，即在光線充足、距離為1英尺的條件下，一般人眼能分辨的兩點間zui小距離為0.1mm。

4、綜上所述：要想看到細菌的存在，則放大倍數(shù)至少要有：0.1mm ÷  0.5um = 1000 ÷ 5 =200 倍。不過 在此放大倍率下，看到的細菌（大腸桿菌）只是一個小點，要想看清其更加細微的結(jié)構(gòu)信息，必須提高顯微鏡的放大倍率。

5、普通光學(xué)顯微鏡的 分辨率受可見光波長的限制（390~770nm,），一般不會超過1000倍，這是普通光學(xué)顯微鏡的放大極值。超過1000倍的放大無法提供更細微的結(jié)構(gòu)信息，屬于無效放大的范圍。

6、電子顯微鏡的放大倍數(shù)可以達到80萬倍，其基本原理與普通光學(xué)顯微鏡相同，是通過高壓產(chǎn)生了短波長的電子波。

放大400倍（10x、40x）就可以勉強看見細菌了，不過只有針尖大小，就像是一個個小點。一般我們還是放大到1000倍（10x、100x）觀察，這個時候細菌的外型還是看得挺清楚的，經(jīng)過特殊染色鞭毛也能看清楚。放大1000倍就要用油鏡了。所謂油鏡，就是在物鏡鏡頭和蓋玻片中間滴一滴香柏油，香柏油的光線折射率比空氣要高，這樣才可以使用更大的放大倍數(shù)。 

10x、40x表明這個鏡頭放大10倍、40倍。目鏡的放大倍數(shù)與物鏡的放大倍數(shù)相乘就得出這個顯微鏡總的放大倍數(shù)。中學(xué)用的顯微鏡的目鏡、物鏡都是可以換的，目鏡一般是5x、10x。一點的顯微鏡的目鏡一般都只有10x，看過大腸桿菌（E.coli）、金黃色葡萄球菌、枯草芽胞桿菌、巨大芽胞桿菌（用來看芽胞的）。

綜上所述，使用放大倍數(shù)能達到1000倍或者更高倍數(shù)的生物顯微鏡是的選擇。