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單克隆抗體從頭測序檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹


單克隆抗體分子在藥物研發(fā)、診斷試劑開發(fā)中扮演了關(guān)鍵的角色??贵w分子本身的一級結(jié)構(gòu),特別是其CDR區(qū)域的氨基酸序列是發(fā)揮其生物學(xué)功能的核心,對其完整序列準(zhǔn)確快速的分析具有十分重要的意義。例如對市場上已有的抗體產(chǎn)品直接進(jìn)行序列分析是開發(fā)抗體藥物,抗體診斷試劑和其它抗體產(chǎn)品的捷徑;許多商業(yè)可得的抗體對于藥物靶點(diǎn)有中和活性,通過單抗序列測定得到該抗體的一級序列,可以以此為基礎(chǔ)可進(jìn)行抗體親和力提升和人源化來開發(fā)抗體藥物;在進(jìn)行抗體仿制藥物研發(fā)過程中,原研藥本身準(zhǔn)確的一級結(jié)構(gòu)信息是進(jìn)行抗體仿制藥研發(fā)的基礎(chǔ)和前提。
百泰派克公司基于優(yōu)良的高分辨率質(zhì)譜儀Obitrap Fusion Lumos,結(jié)合豐富的生物信息學(xué)分析經(jīng)驗(yàn),建立了全新一代抗體測序平臺,實(shí)現(xiàn)對抗體一級結(jié)構(gòu)快速準(zhǔn)確的分析。該平臺適用于不同亞型抗體(例如IgG和IgM)和不同類型抗體(熒光偶聯(lián)抗體,固定化抗體,不同物種的抗體)的序列分析。


單克隆抗體從頭測序檢測技術(shù)服務(wù)



單克隆抗體從頭測序服務(wù)流程


單克隆抗體從頭測序服務(wù)優(yōu)勢:

1. 單抗輕重鏈肽段全序列覆蓋
在進(jìn)行抗體序列測定過程中百泰派克會選擇5種不同的蛋白酶進(jìn)行酶切,利用不同酶切肽段之間的互補(bǔ)性實(shí)現(xiàn)抗體分子輕重鏈100%全序列的拼接。而對于抗體核心區(qū)域CDR序列在進(jìn)行序列分析過程中要求至少被鑒定到10次,以此來充分保證測序結(jié)果的準(zhǔn)確性(如下圖所示)。


單克隆抗體從頭測序檢測技術(shù)服務(wù)



單克隆抗體從頭測序2


2. 優(yōu)良的數(shù)據(jù)處理算法
百泰派克基于發(fā)表在Nature Biotechnology和專業(yè)的蛋白組學(xué)雜志JPR上的文獻(xiàn),結(jié)合現(xiàn)有的專業(yè)進(jìn)行抗體序列分析的軟件PEAKS Mass Spectrometry Software,開發(fā)了自己的質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)計算方法,采用寬進(jìn)窄出的原則,在不遺漏任何有效數(shù)據(jù)信息的同時實(shí)現(xiàn)了抗體序列的準(zhǔn)確鑒定。

3. 高精度和準(zhǔn)確性
百泰派克在測序過程中會使用目前分辨率和高靈敏度Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀;與老一代的質(zhì)譜儀(例如Obitrap Elite、Q Exactive等)相比,Lumos在提高了一級二級質(zhì)譜掃描速度的同時保證肽段分子量的準(zhǔn)確性;一級質(zhì)譜掃描速度的提高,有助于同一個肽段可以更多次的被鑒定到,提高了結(jié)果的可信性;二級質(zhì)譜掃描速度的提高可以更好的進(jìn)行片段碎裂(如下圖所示),從而保證結(jié)果的準(zhǔn)確性,并可以通過二級碎裂片段的特征峰實(shí)現(xiàn)Liangansuan和異Liangansuan的準(zhǔn)確判定。


單克隆抗體從頭測序檢測技術(shù)服務(wù)



單克隆抗體從頭測序3


4. 可對多種亞型和不同類型的抗體進(jìn)行測序
我們建立的技術(shù)平臺不受小基團(tuán)(如FITC、Biotin、Alexa)的影響,雖然較大的蛋白基團(tuán)會給測序帶來難度,但若提供較高濃度的蛋白仍可成功測序。

5. 嚴(yán)謹(jǐn)?shù)男蛄蓄A(yù)測和嚴(yán)格的序列驗(yàn)證
我們對測序的結(jié)果會首優(yōu)良行序列的預(yù)測,標(biāo)明抗體的CDR區(qū)域(如下圖所示);同時,我們還會以測定的序列建立新的數(shù)據(jù)庫,采用Sequence Confirmation的模式對采集到的質(zhì)譜數(shù)據(jù)再次進(jìn)行分析,只有wán quán匹配的結(jié)果我們才會提供給客戶。


單克隆抗體從頭測序檢測技術(shù)服務(wù)



單克隆抗體從頭測序4


中/英文項(xiàng)目報告

在技術(shù)報告中,百泰派克生物科技會為您提供詳細(xì)的中英文雙語版技術(shù)報告,報告包括:

1. 實(shí)驗(yàn)步驟(中英文)
2. 相關(guān)的質(zhì)譜參數(shù)(中英文)
3. 質(zhì)譜圖片
4. 原始數(shù)據(jù)
5. 肽段序列信息
6. 抗體序列信息


相關(guān)服務(wù)

從頭測序
蛋白從頭測序
多肽從頭測序
基于質(zhì)譜的序列分析
基于Edman降解的蛋白質(zhì)N端測序
基于PCR擴(kuò)增的單克隆抗體測序服務(wù)
基于Top down自上而下法的蛋白質(zhì)測序
蛋白測序
多肽測序
抗體測序


單克隆抗體從頭測序檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹


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