蛋白全長測序:高精度、低樣本量的完整序列覆蓋方案檢測技術服務詳情介紹
在生命科學研究與生物醫(yī)藥開發(fā)中,dànbáizhì的結(jié)構(gòu)與功能密切相關,而蛋白的全長序列信息則是解析其功能、突變位點修飾及翻譯后加工等過程的關鍵數(shù)據(jù)基礎。傳統(tǒng)質(zhì)譜方法往往依賴酶解將蛋白“打碎”成肽段進行識別,可能導致序列信息缺失。蛋白全長測序(Full-Length Protein Sequencing, FLPS)通過多酶組合和高精度質(zhì)譜平臺,致力于獲取dànbáizhì的完整序列信息,已成為dànbáizhì組學研究中逐步興起的補充技術路線。
1、什么是蛋白全長測序?為何它如此重要?
蛋白全長測序旨在解析蛋白分子的完整氨基酸序列,涵蓋N端、C端及中間區(qū)域,避免了傳統(tǒng)酶解方法可能遺漏的結(jié)構(gòu)域或修飾位點。這項技術在以下研究場景中展現(xiàn)出bùkětìdài的價值:
(1)抗體序列解析與zhuānlì申報:jīngquè獲取輕鏈與重鏈全序列,支持抗體人源化設計與知識產(chǎn)權(quán)保護
(2)生物藥質(zhì)量控制:識別突變、異構(gòu)體、剪切變體等產(chǎn)品一致性問題
(3)新蛋白功能研究:探索天然蛋白的新型翻譯變體、修飾模式和信號肽保留區(qū)段
2、技術挑戰(zhàn):全長測序為何難以實現(xiàn)?
與基因組測序相比,dànbáizhì全長測序面臨三大難點:
(1)肽段覆蓋不足:傳統(tǒng)酶切法依賴酶解模式,難以全面覆蓋蛋白全長
(2)翻譯后修飾復雜:如磷酸化、糖基化等修飾影響碎片離子特征,干擾序列解析
(3)分子異構(gòu)體共存:同分異構(gòu)體(如異構(gòu)肽)造成數(shù)據(jù)庫搜索歧義,增加序列不確定性
3、高精度蛋白全長測序策略:多酶組合與串聯(lián)質(zhì)譜平臺
為了應對上述挑戰(zhàn),百泰派克生物科技采用了一套集多酶切割策略、多級質(zhì)譜采集(MSn)與de novo解析算法于一體的高覆蓋度測序流程:
(1)多酶切割+多模式建庫
我們綜合使用Trypsin、Chymotrypsin、Glu-C等多種酶切方式,zuì大程度打破結(jié)構(gòu)域限制,提高覆蓋度。同時支持非酶解策略(top-down或middle-down),用于保留蛋白天然修飾狀態(tài)。
(2)高分辨串聯(lián)質(zhì)譜平臺
采用Orbitrap Eclipse、timsTOF等高分辨質(zhì)譜設備,結(jié)合HCD+ETD雙碎裂模式,有效識別PTMs(翻譯后修飾)并提高低豐度肽段檢測靈敏度。
(3)de novo+database雙模式解析
結(jié)合數(shù)據(jù)庫檢索與de novo算法交叉驗證,提升新型突變或未知蛋白序列的準確性與完整性。
(4)低樣本起始量,適配多種樣品類型
百泰派克生物科技的全長蛋白測序服務支持從低至1µg蛋白樣本起始,適配血清、細胞裂解液、純化蛋白、組織勻漿等多種樣品來源。特別適合臨床樣本和zhēnxī樣本的研究需求。
4、總結(jié):從蛋白肽段走向完整序列
蛋白全長測序技術正逐步從探索性研究走向高通量與高重現(xiàn)性的標準化應用。它不僅拓展了dànbáizhì組學的邊界,更為抗體藥物開發(fā)、生物制劑質(zhì)控、以及基礎生命科學研究提供了全新的數(shù)據(jù)維度。在百泰派克生物科技,我們專注于提供高質(zhì)量、可交付全長序列的定制化測序服務,助力科研人員深入解析蛋白功能的每一個氨基酸位點。
百泰派克生物科技特色項目
一、蛋白測序
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務,包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務,對蛋白序列進行分析。
※服務優(yōu)勢:
1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
二、dànbáizhì組學
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務,助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優(yōu)勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;
2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質(zhì)譜分析靈敏度高,實驗結(jié)果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析,分析更系統(tǒng)準確。
三、單細胞質(zhì)譜流式技術分析
百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術分析,采用金屬元素標記物(通常是金屬元素標記的特異抗體)標記細胞表面和內(nèi)部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質(zhì)量譜,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。
※服務優(yōu)勢:
1.技術優(yōu)良,*技術空白
采用金屬標記抗體技術,避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數(shù)量大,成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右,而流式質(zhì)譜技術一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現(xiàn)了數(shù)量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標簽技術與其他技術結(jié)合會有新應用方向。除常規(guī)蛋白外,質(zhì)譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)
百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標。
五、生物藥物表征
百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術,MALDI TOF,高效色譜分離技術,提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務,幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。
百泰派克生物科技七大檢測平臺
百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質(zhì)譜多組學優(yōu)質(zhì)服務商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導原則,通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術服務,支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。
1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎的CRO檢測分析服務;
2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務;
3.業(yè)務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學生物質(zhì)譜整合分析等;
4.七大質(zhì)量控制檢測平臺,滿足您一站式服務需求;
5.服務3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務!