GPF-DIA和Direct DIA：哪個更適合大規(guī)模蛋白定量？檢測技術服務詳情介紹

在大規(guī)模dànbáizhì組學研究中，數(shù)據(jù)獨立采集（DIA, Data-Independent Acquisition）技術因其高通量、高重現(xiàn)性和數(shù)據(jù)完整性，已成為主流。然而，DIA的發(fā)展也催生了多種策略，其中以GPF-DIA（Gas Phase Fractionation DIA）與Direct DIA（直接DIA）zuì為常見。兩者在譜圖庫構建方式、實驗流程與適用場景上存在顯著差異。本文將系統(tǒng)比較這兩種DIA策略，幫助科研人員在不同研究需求下作出科學選擇。

一、什么是GPF-DIA？

GPF-DIA是一種通過氣相分級提升譜圖庫質(zhì)量的DIA策略。研究人員將混合樣本在質(zhì)譜m/z維度進行分段采集（如每次覆蓋一個100–150 m/z的窗口），從而獲得更高的MS/MS覆蓋度。隨后，以這些高覆蓋度數(shù)據(jù)構建實驗樣本特異性的DIA譜圖庫，用于后續(xù)大批量樣本的定量分析。

? GPF-DIA的特點：

• 蛋白鑒定更深：適合發(fā)掘低豐度、差異性蛋白

• 譜圖庫質(zhì)量更高：針對目標樣本構建，具有高度代表性

• 定量準確性更優(yōu)：尤其適合機制研究與生物標志物挖掘

• 實驗成本較高：需額外運行多個氣相分級樣本，增加儀器時間與樣本消耗

二、什么是Direct DIA？

Direct DIA則wánquán跳過譜圖庫構建步驟，直接利用軟件算法（如DIA-NN、Spectronaut）從原始DIA數(shù)據(jù)中進行蛋白鑒定與定量。這種“譜庫自由”方式顯著簡化了實驗流程，并具備良好的通量擴展性。

? Direct DIA的特點：

• 流程更簡潔：無需分級與譜圖庫采集

• 更適合高通量項目：如臨床隊列研究、藥物篩選等

• 對樣本量要求低：適合樣本寶貴或難以批量制備的項目

• 鑒定深度略遜：對極低豐度蛋白的識別能力有限

三、GPF-DIA vs Direct DIA：核心指標對比

四、如何選擇更適合的DIA策略？

選擇DIA策略的核心在于研究目標與資源配置：

• 如果您關注的是蛋白鑒定深度與定量精度，如疾病機制解析、功能蛋白篩選或圖譜構建，GPF-DIA更具優(yōu)勢。

• 若研究更強調(diào)樣本通量、數(shù)據(jù)處理效率與自動化能力，如大型臨床樣本隊列、藥效評估或多時間點干預實驗，Direct DIA是更高效的選擇。

科學地根據(jù)項目需求選用DIA策略，不僅提升數(shù)據(jù)質(zhì)量，也能顯著優(yōu)化成本效益比。百泰派克生物科技提供多樣化DIA策略支持，滿足從基礎科研到臨床轉(zhuǎn)化的廣泛需求。不論您的研究聚焦于生物機制探索，還是臨床應用開發(fā)，我們都可為您提供定制化蛋白組學解決方案。了解更多DIA策略選擇建議或獲取典型項目案例，歡迎聯(lián)系我們！

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優(yōu)勢：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實驗結(jié)果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統(tǒng)準確。

三、單細胞質(zhì)譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。

※服務優(yōu)勢：

1.技術優(yōu)良，*技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右，而流式質(zhì)譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結(jié)合會有新應用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學優(yōu)質(zhì)服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務；

3.業(yè)務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務!

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