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模塊式植物表型成像分析系統(tǒng)

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   北京易科泰生態(tài)技術(shù)有限公司成立于2002年,為中關(guān)村高新技術(shù)企業(yè),致力于生態(tài)-農(nóng)業(yè)-健康研究監(jiān)測技術(shù)推廣、研發(fā)與服務(wù),特別是在光譜成像技術(shù)(高光譜成像技術(shù)、葉綠素熒光成像技術(shù)、紅外熱成像技術(shù)、無人機遙感等)、植物表型分析技術(shù)、呼吸與能量代謝測量技術(shù)等方面,與專業(yè)企業(yè)PSI、Specim、Sable等合作,致力于植物科學、土壤與地球科學、動物能量代謝、水體與藻類及生態(tài)環(huán)境領(lǐng)域先進儀器技術(shù)的引進推廣和技術(shù)研發(fā)集成,為植物/作物表型分析、生態(tài)修復及生態(tài)保護、能量代謝測量等提供規(guī)劃設(shè)計、技術(shù)方案與系統(tǒng)集成、技術(shù)咨詢與科技服務(wù)。公司技術(shù)團隊80%以上具備碩士或碩士以上學位,并與*研究生院、中科院植物研究所、中科院動物所、中科院地理科學與資源研究所、中國農(nóng)科院、中國林科院、中國環(huán)科院、中國水科院、清華大學、中國農(nóng)業(yè)大學、北京林業(yè)大學、北京大學、中國海洋大學、陜西師范大學、內(nèi)蒙古大學等建立了長期的技術(shù)合作交流關(guān)系。


   公司下設(shè)有葉綠素熒光技術(shù)與植物表型業(yè)務(wù)部、EcoTech®實驗室、光譜成像與無人機遙感事業(yè)部及無人機遙感研究中心(與陜西師范大學合作建立)、動物能量代謝實驗室、內(nèi)蒙古阿拉善蒙古牛生態(tài)牧業(yè)研究院及青島分公司。實驗室擁有葉綠素熒光成像、葉綠素熒光儀、水體藻類熒光儀、SPECIM高光譜儀、WORKSWELL紅外熱成像儀、EasyChem全自動化學分析儀、MicroMac1000水質(zhì)在線監(jiān)測系統(tǒng)、ACE土壤呼吸自動監(jiān)測系統(tǒng)、SoilBox便攜式土壤氣體通量測量系統(tǒng)、動物呼吸測量系統(tǒng)、LCpro 光合作用測量儀、Hood土壤入滲儀、年輪分析儀等各種儀器設(shè)備,可以進行實驗研究分析、實驗培訓等,歡迎與易科泰生態(tài)研究室開展合作研究。


   易科泰公司與歐洲PSI公司(葉綠素熒光技術(shù)與表型分析技術(shù))、美國SABLE公司(動物能量代謝技術(shù))、歐洲SPECIM公司(高光譜成像技術(shù))、歐洲WORKSWELL公司(紅外熱成像技術(shù))、歐洲ATOMTRACE公司(LIBS元素分析技術(shù))、歐洲BCN無人機遙感中心、歐洲ITRAX公司(樣芯密度掃描與元素分析)、美國VERIS公司、英國ADC公司、德國UGT公司、歐洲SYSTEA公司等著名生態(tài)儀器技術(shù)領(lǐng)域的研發(fā)機構(gòu)和廠商建立了密切的合作關(guān)系,在FluorCam葉綠素熒光成像與熒光測量技術(shù)、PlantScreen植物表型分析技術(shù)、高光譜成像技術(shù)、紅外熱成像技術(shù)、光合作用與植物生理生態(tài)研究監(jiān)測、土壤呼吸與碳通量研究監(jiān)測、動物呼吸代謝測量、水質(zhì)分析與藻類研究監(jiān)測、CoreScanner樣芯密度CT與元素分析技術(shù)、LIBS元素分析技術(shù)、無人機生態(tài)遙感技術(shù)等生態(tài)儀器技術(shù)及其系統(tǒng)方案集成有著豐富的經(jīng)驗,成為我國農(nóng)業(yè)、林業(yè)、地球科學、生態(tài)環(huán)境研究等領(lǐng)域科技進步的重要研究技術(shù)支持力量。由公司研制生產(chǎn)的EcoDrone®無人機遙感平臺、SoilTron®多功能小型蒸滲儀技術(shù)、SoilBox®土壤呼吸測量技術(shù)、PhenoPlot®輕便型作物表型分析系統(tǒng)、SCG-N土壤剖面CO2/O2梯度監(jiān)測系統(tǒng)、植物生理生態(tài)監(jiān)測技術(shù)、動物能量代謝測量技術(shù)等,在中科院修購項目、*學科群項目、CERN網(wǎng)絡(luò)(生態(tài)系統(tǒng)監(jiān)測網(wǎng)絡(luò))等項目中發(fā)揮重要作用。


   “工欲善其事,必先利其器”,易科泰公司將秉承“利其器,善其事”的經(jīng)營理念,為國內(nèi)生態(tài)-農(nóng)業(yè)-健康研究與發(fā)展提供優(yōu)秀的技術(shù)方案和服務(wù)。


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土壤與植物生理生態(tài)研究監(jiān)測、環(huán)境氣象監(jiān)測、水文水質(zhì)及地下水監(jiān)測、水土保持研究監(jiān)測、荒漠化監(jiān)測、精準農(nóng)業(yè)以及動物生態(tài)研究等儀器技術(shù)的引進推廣和系統(tǒng)集成,并為生態(tài)環(huán)境實驗研究和規(guī)劃設(shè)計提供技術(shù)方案和分析測量。

產(chǎn)地類別 進口

    太陽輻射照射到植物葉片上,其中的藍色波段和紅色波段大部分被葉片吸收進行光合作用,另一部分(包括綠色波段、紅外波段等)以反射光的形式返回到大氣中,少量以熒光的形式發(fā)射到大氣中,還有部分則以熱的形式耗散。通過對葉片反射光成像測量分析(RGB彩色成像、多光譜或高光譜成像等)、多光譜熒光成像測量分析及葉片溫度測量分析(紅外熱成像),可以全面分析植物的性狀特征包括外部形態(tài)顏色、光合作用效率、氣孔動態(tài)、次級代謝等形態(tài)與生理生態(tài)特征,使植物表型數(shù)字化、生理生態(tài)及功能可視化。

    模塊式植物表型成像分析系統(tǒng)由植物多光譜熒光成像單元、紅外熱成像單元、RGB彩色成像單元等組成,可全面分析植物葉片及冠層的形態(tài)結(jié)構(gòu)、顏色、光合作用、生理狀態(tài)、氣孔動態(tài)、生化色素分布、脅迫生理等,是目前市場上配置最靈活、功能*、性價比最高的植物表型與生理生態(tài)觀測分析系統(tǒng)。

 

中圖:西葫蘆感染病原菌成像分析,其中(a)為RGB彩色成像、(b)為紅外熱成像、(c)為F520綠色熒光成像、(d)為F520/F680綠紅熒光比值成像;下圖:向日葵幼苗列當寄生后的多光譜熒光成像

主要功能特點與技術(shù)指標:

  • 植物多光譜熒光成像技術(shù),可以對具有4個特征性波峰的植物熒光光譜進行成像分析,進而可全面分析植物初級代謝(光合效率)、次級代謝、生理生態(tài)、脅迫與抗性篩選等
  • 可選配UV紫外光、白色LED光源(用于模擬自然光源)、青色LED光源(用于氣孔功能研究)、綠色LED光源、紅色LED光源、藍色LED光源等不同激發(fā)光源
  • 可對UV紫外光激發(fā)的4個波峰的熒光進行成像分析,包括蘭光440nm(F440)、綠光520nm(F520)、紅光690nm(F690)和遠紅外740nm(F740),其中F440和F520統(tǒng)稱為BGF,由表皮及葉肉細胞壁和葉脈發(fā)出,F(xiàn)690和F740為葉綠素熒光Chl-F
  • 紅外熱成像分析單元可測量分析葉片溫度的異質(zhì)性分布,并通過選區(qū)(ROI)工具得到不同區(qū)域的最高溫度、最低溫度、平均溫度、溫度分布頻率直方圖等,依次進一步分析氣孔導度、水分脅迫等
  • 40倍RGB成像可以對植物形態(tài)及顏色進行分析,既可明察秋毫到氣孔分布,又可大視野宏觀成像分析
  • 配置靈活、使用方便,可選配不同單元組合
  • 適于植物葉片、植物幼苗及小型全株植物,紅外熱成像可應(yīng)用于植物冠層或多株植物成像分析
  • 應(yīng)用于作物遺傳育種、遺傳組學與表型組學研究、植物生理生態(tài)學、植物脅迫生理、抗性篩選等領(lǐng)域

技術(shù)指標:

  • 紅外熱成像單元:
    • 非制冷紅外焦平面檢測器(uncooled VOx microbolometer),已經(jīng)過歐盟標注校準,可直接測量溫度,包括每個像素點的溫度等
    • 分辨率:640x512像素
    • 光譜范圍:7.5~13.5μm
    • 溫度測量范圍:-25~150°C
    • 靈敏度:≤0.03(30mK)@ 30
    • 幀頻:9Hz或30Hz,最大60Hz
    • 數(shù)據(jù)傳輸:USB-3或千兆以太網(wǎng)
    • 19mm光學鏡頭,視野32x26,可選配13mm鏡頭或35mm鏡頭
    • 具備視頻模式和快照模式
    • 具備14種調(diào)色板供任意選擇,可多樣化設(shè)置熱成像假彩色
    • 具備差值功能,可內(nèi)查圖像形成平滑影像以避免像素化
    • 可通過軟件設(shè)置大氣溫度、濕度、距離等參數(shù)
    • 具備等溫模式功能,包括以上、一下、之間、及以下與以上四種等溫模式
    • 結(jié)果在線報告功能,自動顯示熱影像、時距圖及影像參數(shù)如發(fā)射率、反射溫度、大氣溫度、濕度、外部光距離、傳播等
    • 影像處理軟件具備ROI選區(qū)功能,包括點、線、折線、矩形等,并可進行分區(qū)處理,每個ROI即時顯示最小溫度、最高溫度、平均溫度等
    • 熱掃描功能及熱剖面功能:可在線可視化顯示線型ROI溫度值、溫度剖面圖
    • 所有ROI工具的溫度值均可顯示在時距圖中
    • 防護級:IP65
    • 工作溫度:-15°C+50°C 
    • 支持GPS信息,可將位置信息顯示在谷歌地圖上
  • 植物多光譜熒光成像
    • 成像面積20x20cm
    • 紫外光激發(fā)多光譜熒光成像包括F440、F520、F690、F740四個波段的熒光成像
    • 高分辨率CCD鏡頭,20fps、1360x1024像素,有效像素大小為6.45μm,高速USB 2.0 (480Mbits/sec),可像素疊加(binning)以提高靈敏度(2x2,3x3,4x4);具備視頻模式和快照模式
    • 自動測量分析功能(無人值守):可預設(shè)1個或2個試驗程序,系統(tǒng)可自動測量儲存
    • 激發(fā)光源包括紫外光、藍色光源、紅橙色光源,通過紫外激發(fā)熒光與紅光LED激發(fā)熒光,可以分析植物類黃酮相對含量等
    • 成像分析軟件具Live(實況測試)、Protocol(實驗程序選擇)、Pre-processing(成像預處理)、Result(成像分析結(jié)果)等功能菜單
    • 成像預處理可以自動選區(qū)或手動選擇不同形狀、不同數(shù)量、不同位置的區(qū)域(Region of interest,ROI),成像分析結(jié)果包括高時間解析度熒光動態(tài)圖、直方圖、不同參數(shù)成像圖、不同ROI的熒光參數(shù)列表等
    • Protocol實驗程序可自由編輯,也可利用Protocol菜單中的向?qū)С绦蚰0婵蛻糇杂蓜?chuàng)建新的實驗程序
    • 多種Protocols供選配和自動運行,包括Fv/Fm、Kautsky誘導效應(yīng)、葉綠素熒光淬滅曲線、光響應(yīng)曲線等
    • 具備系統(tǒng)自動重復運行功能,可無人值守自動循環(huán)完成選定的實驗程序,重復次數(shù)及間隔時間客戶自定義,成像測量數(shù)據(jù)自動按時間日期存入計算機
    • 高度可調(diào),以適應(yīng)不同高度植株成像分析,最大植株高度50cm,可根據(jù)客戶需求定制不同高度

3. NDVI與PAR吸收成像模塊:630nmLED紅色光源和740nm LED紅外光源,可對PAR(光合有效輻射)吸收及植物光譜反射指數(shù)NDVI成像分析

 

4. 可對綠色熒光蛋白GFP進行成像分析,可選配YFP成像分析

5. RGB成像:科研級RGB成像鏡頭,分辨率2592x1944像素,信噪比54dB,1-40x放大,最小視野6.1x7.9mm(40x),最大視野20.8x25.4;可分析葉面積、長度、寬度、周長、比值、綠度指數(shù)、顏色分級分析、頻率直方圖等

 

應(yīng)用案例與近期代表性參考文獻:

 

西葫蘆感染軟腐病菌(Dickeya dadantii)RGB彩色成像、多光譜熒光成像及紅外熱成像分析(引自Maria L. Perez-Bueno等,Multicolor Fluorescence Imaging as a Candidate for Disease Detection in Plant Phenotyping. Frontiers in Plant Science, 2016)

  • Monica Pineda etc. Detection of Bacterial Infection in Melon Plants by Classification Methods Based on Imaging Data. Frontiers in Plant Science
  • Monica Pineda et. Use of multicolour fluorescence imaging for diagnosis of bacterial and fungal infection on zucchini by implementing machine learning. Functional Plant Biology, 2017
  • Carmen M. Ortiz-Bustos etc. Fluorescence Imaging in the Red and Far-Red Region during Growth of Sunflower Plantlets. Diagnosis of the Early Infection by the Parasite Orobanche Cumana. Frontiers in Plant Science, 2016
  • Maria Luisa Perez-Bueno etc. Spatial and temporal dynamics of primary and secondary metabolism in Phaseolus vulgaris challenged by Pseudomonas syringae. Physiologia Plantarum, 2015


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