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化工儀器網(wǎng)>產(chǎn)品展廳>技術(shù)服務(wù)>蛋白質(zhì)相關(guān)服務(wù)>蛋白質(zhì)組綜合服務(wù)> 4D-DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)

4D-DIA定量蛋白質(zhì)組學(xué)

具體成交價以合同協(xié)議為準(zhǔn)
  • 公司名稱 武漢傲星生物科技有限公司
  • 品牌 其他品牌
  • 型號
  • 產(chǎn)地
  • 廠商性質(zhì) 經(jīng)銷商
  • 更新時間 2024/3/11 11:03:50
  • 訪問次數(shù) 197
產(chǎn)品標(biāo)簽

4D-蛋白質(zhì)組學(xué)

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武漢傲星生物科技有限公司是一家專注于為生命科學(xué)研究,醫(yī)學(xué)研究,病理學(xué)研究,藥物研究等提供基礎(chǔ)科研技術(shù)服務(wù)和科研產(chǎn)品的生物技術(shù)服務(wù)公司。由武漢大學(xué)和華中科技大學(xué)醫(yī)學(xué)博士團隊創(chuàng)業(yè)組建。公司技術(shù)均為生命科學(xué)相關(guān)專業(yè)畢業(yè),對科研具有*的認(rèn)知和情懷??商峁嶒瀸嵤ú±韺W(xué)、分子生物學(xué)、免疫學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、動物模型、病毒包裝等生物科研服務(wù))、數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析、論文翻譯及潤色修改,優(yōu)秀碩博畢業(yè)生工作推薦等一體化服務(wù)。擅長神經(jīng)系統(tǒng),糖尿病,皮膚病,內(nèi)分泌等眾多研究方向。旨在為廣大科研工作者提供專業(yè)的科研解決方案和培訓(xùn)計劃。



實驗檢測,試劑耗材

實驗介紹

4D-蛋白質(zhì)組學(xué)是基于新一代timsTOF Pro質(zhì)譜儀,通過捕集離子淌度(TIMS)與同步累積連續(xù)碎裂(PASEF)掃描模式進行差異定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究。該技術(shù)核心是在傳統(tǒng)3D分離(保留時間、質(zhì)荷比、離子強度)基礎(chǔ)上,增加肽段的碰撞截面積(CCS),實現(xiàn)第4維度(離子淌度)的分離檢測。 4D-DIA蛋白質(zhì)組學(xué)是基于timsTOF Pro離子淌度平臺的新一代DIA技術(shù),通過數(shù)據(jù)非依賴采集-同步累積連續(xù)碎裂(diaPASEF)掃描模式進行差異定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析。將DIA技術(shù)與基于timsTOF Pro上的diaPASEF技術(shù)相結(jié)合,具有高掃描速度和高靈敏度優(yōu)勢的同時,外加第四維離子淌度分離,使DIA數(shù)據(jù)在采集時不犧牲窗口循環(huán)速度的同時,降低譜圖復(fù)雜度和提高離子利用率,實現(xiàn)了蛋白質(zhì)組學(xué)在覆蓋深度、靈敏度、通量方面的全面性提升。

實驗流程:

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應(yīng)用方向

? 臨床微量樣本檢測方式,如:外泌體、FFPE石蠟切片、活檢穿刺組織等

? 臨床大隊列樣本分析,如腫瘤、心血管等重大疾病精準(zhǔn)分型

? 作物群體性狀等大規(guī)模樣本研究,如育種品系、脅迫干預(yù)等

? 臨床生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn):DIA接近MRM的定量能力,實現(xiàn)標(biāo)志物篩選與初步驗證過程合二為一

? 生物樣本信息庫構(gòu)建:DIA可實現(xiàn)生物信息的完整保存,為后續(xù)回溯分析提供保障。藥物應(yīng)答、基因敲除/過表達的蛋白表達譜分析

數(shù)據(jù)分析

標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)分析內(nèi)容

鑒定結(jié)果統(tǒng)計與分析

樣本蛋白質(zhì)及肽段鑒定柱狀圖、PCA分布圖、定量差異統(tǒng)計分析

生物信息學(xué)分析

GOGO富集、KEGGKEGG富集分析、PPI互作網(wǎng)絡(luò)與module分析

差異上下調(diào)蛋白KEGG蝴蝶圖、KEGG通路功能歸屬等

高級數(shù)據(jù)分析內(nèi)容

標(biāo)志物篩選

集成機器學(xué)習(xí)、LASSO回歸分析、標(biāo)志物panel、ROC分析

分子分型分析

無監(jiān)督聚類分型分析、蛋白質(zhì)組+轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析、激酶分析

臨床表征與組學(xué)結(jié)果聯(lián)合分析

疾病相關(guān)功能模塊分析

WGCNA共表達分析

生存曲線分析

臨床分型與生存曲線分析

 

技術(shù)優(yōu)勢

? 4D技術(shù)加持,更加適合微量樣本

? 克服標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)在樣本數(shù)量上的限制,靈活方便

? 采用布魯克的timsTOF Pro質(zhì)譜平臺,檢測速度提升近一倍




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