STRING 蛋白質(zhì)組學(xué)檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

STRING 蛋白質(zhì)組學(xué)是一種基于STRING數(shù)據(jù)庫的蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)分析方法。蛋白質(zhì)在細(xì)胞內(nèi)通常不會(huì)獨(dú)立發(fā)揮作用，而是通過復(fù)雜的相互作用網(wǎng)絡(luò)執(zhí)行生物功能。STRING 蛋白質(zhì)組學(xué)利用海量實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)、計(jì)算預(yù)測(cè)和生物信息學(xué)方法系統(tǒng)性地分析蛋白質(zhì)之間的相互作用，揭示蛋白質(zhì)功能網(wǎng)絡(luò)、信號(hào)通路及潛在的生物學(xué)機(jī)制。這一技術(shù)在基礎(chǔ)研究、疾病機(jī)制解析、新藥研發(fā)及jīngzhǔn醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域具有重要價(jià)值。STRING 蛋白質(zhì)組學(xué)依賴于 STRING 數(shù)據(jù)庫，這是目前全球zuì全面的蛋白質(zhì)相互作用數(shù)據(jù)庫之一，整合了多種來源的信息。一是來自高通量蛋白質(zhì)組學(xué)實(shí)驗(yàn)、親和純化、酵母雙雜交、共免疫沉淀等技術(shù)的直接實(shí)驗(yàn)證據(jù)。二是基于序列同源性、結(jié)構(gòu)分析和機(jī)器學(xué)習(xí)模型預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)相互作用。三是從大量文獻(xiàn)中提取蛋白質(zhì)功能關(guān)系，構(gòu)建蛋白質(zhì)交互網(wǎng)絡(luò)。四是分析不同條件下基因的共表達(dá)情況，推測(cè)功能相關(guān)性。五是基于基因組學(xué)數(shù)據(jù)（如基因共線性、基因融合事件）預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)可能的相互作用關(guān)系。通過綜合以上信息，STRING 蛋白質(zhì)組學(xué)能夠提供蛋白質(zhì)相互作用的置信評(píng)分，幫助研究人員篩選關(guān)鍵蛋白并解析其在生物通路中的作用。

STRING 蛋白質(zhì)組學(xué)的研究流程通常包括以下幾個(gè)關(guān)鍵步驟：

1、蛋白質(zhì)鑒定：使用高分辨率質(zhì)譜技術(shù)（如數(shù)據(jù)非依賴分析 DIA）檢測(cè)樣本中的蛋白質(zhì)并定量其表達(dá)水平。

2、數(shù)據(jù)篩選：通過數(shù)據(jù)質(zhì)控去除低置信度的蛋白，確保分析結(jié)果的可靠性。

3、STRING 數(shù)據(jù)庫查詢：將鑒定的蛋白列表輸入 STRING 平臺(tái)，構(gòu)建蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)（Protein-Protein Interaction, PPI）。

4、網(wǎng)絡(luò)分析：通過生物信息學(xué)工具計(jì)算蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)的拓?fù)涮匦?，例如中心蛋白（hub proteins）、功能模塊和信號(hào)通路富集分析。

5、功能注釋：結(jié)合基因本體（GO）分析、KEGG 通路富集分析等手段，解析蛋白質(zhì)在生物過程中扮演的角色。

這yìliú程能夠幫助研究人員從大規(guī)模蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)中提取關(guān)鍵信息，揭示潛在的生物學(xué)機(jī)制，并指導(dǎo)后續(xù)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)。

相比于傳統(tǒng)的單個(gè)蛋白質(zhì)分析方法，STRING 蛋白質(zhì)組學(xué)具有以下優(yōu)勢(shì)：

1、大規(guī)模數(shù)據(jù)整合：結(jié)合多種數(shù)據(jù)來源，提高相互作用預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性。

2、高通量分析：能夠快速分析數(shù)百至數(shù)千個(gè)蛋白質(zhì)的相互作用，提高研究效率。

3、生物學(xué)背景支持：數(shù)據(jù)庫不斷更新，提供zuì新的生物學(xué)信息，確保分析結(jié)果的可靠性。

4、可視化能力強(qiáng)：STRING 具有強(qiáng)大的網(wǎng)絡(luò)可視化功能，便于研究人員直觀理解蛋白質(zhì)功能關(guān)系。

百泰派克生物科技致力于提供高質(zhì)量的蛋白質(zhì)組學(xué)研究服務(wù)。我們的蛋白質(zhì)組學(xué)分析服務(wù)涵蓋蛋白質(zhì)鑒定、相互作用分析、功能注釋及數(shù)據(jù)可視化，致力于幫助研究人員快速解析蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)蛋白質(zhì)序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù)，包括對(duì)蛋白質(zhì)的氨基酸組成分析，N端測(cè)序，C端測(cè)序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白質(zhì)N端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的蛋白質(zhì)，提供基于從頭測(cè)序法的蛋白質(zhì)從頭測(cè)序服務(wù)，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、蛋白質(zhì)組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供定量蛋白質(zhì)組學(xué)、靶向蛋白質(zhì)組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種蛋白質(zhì)組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種蛋白質(zhì)標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.技術(shù)優(yōu)良，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細(xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從蛋白質(zhì)、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù)；

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋蛋白質(zhì)組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái)，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

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