免疫學研究中的單細胞蛋白質(zhì)組學分析策略檢測技術服務詳情介紹

免疫系統(tǒng)具備高度復雜的動態(tài)調(diào)控能力，廣泛參與抗感染、腫瘤識別、自身免疫、組織修復等過程。研究發(fā)現(xiàn)，免疫細胞在發(fā)育階段、微環(huán)境影響或刺激條件下常表現(xiàn)出顯著的功能異質(zhì)性。近年來，單細胞技術的快速發(fā)展極大推動了免疫研究的分辨率。dànbáizhì作為功能執(zhí)行分子，是真正反映細胞生物學狀態(tài)的關鍵指標。單細胞dànbáizhì組學（Single-cell Proteomics, SCP）因其直接測量蛋白表達、定位與修飾的能力，成為免疫研究中bùkěhuòquē的新興策略。

單細胞dànbáizhì組：解析免疫功能狀態(tài)的核心手段

在免疫學研究中，dànbáizhì層面信息具有以下bùkětìdài的價值：

• 反映細胞活化、遷移、極化等狀態(tài)的直接分子特征；

• 揭示關鍵受體、細胞因子及信號轉(zhuǎn)導蛋白的表達變化；

• 捕捉翻譯后修飾（如磷酸化、泛素化）等動態(tài)調(diào)控事件；

• 銜接轉(zhuǎn)錄與功能之間的“失配”區(qū)域，提高機制解釋力。

基于質(zhì)譜的單細胞蛋白組具備很高的靶標覆蓋范圍和定量一致性，尤其適用于復雜、未知、動態(tài)變化的免疫系統(tǒng)研究。

分析策略一：jīngzhǔn樣本制備與單細胞處理

單細胞dànbáizhì組的起點是高質(zhì)量的單細胞分離與裂解。在免疫學研究中，細胞常來源于組織、外周血或體液，涉及多種細胞亞型。通過流式分選、微流控芯片或自動移液平臺，研究者可jīngquè獲得目標單個免疫細胞。

由于蛋白量極低，樣本處理需特別關注以下策略：

• 使用低吸附材料和微量裂解系統(tǒng)，減少樣本損失；

• 在嚴格溫控和時間控制下進行細胞裂解與變性；

• 全流程保持閉環(huán)操作，防止蛋白降解與非特異吸附。

高保真度的前處理流程，是保證后續(xù)定量準確性的基礎。

分析策略二：多重標簽標記提升定量通量

當前主流的單細胞蛋白組定量方法多采用TMT（Tandem Mass Tag）標記策略。這一策略允許多個單細胞樣本在一個質(zhì)譜運行中共混分析，通過同位素編碼的報告離子實現(xiàn)定量。

關鍵策略包括：

• 為每個單細胞樣本賦予wéiyī標簽，保持樣本獨立性；

• 引入“載體通道”增強信號，實現(xiàn)低豐度蛋白檢測；

• 優(yōu)化標簽比例和反應條件，確保標記效率與定量準確。

TMT策略在維持單細胞分辨率的同時顯著提升了通量，尤其適合用于研究多個免疫狀態(tài)、處理條件或細胞亞群之間的差異。

分析策略三：高靈敏質(zhì)譜采集保障檢測深度

質(zhì)譜平臺的性能決定了可檢出蛋白的數(shù)量與質(zhì)量。針對單細胞蛋白組的低起始量特點，推薦采用高分辨、高靈敏儀器平臺（如Orbitrap或timsTOF系列），并輔以優(yōu)化的采集模式：

• 選擇合適的掃描模式（DDA、DIA或MS3）平衡覆蓋率與定量精度；

• 調(diào)整離子積累時間與碎裂能量，增強低豐度信號捕捉；

• 設定合理的動態(tài)排除與質(zhì)量窗口，避免重復采集干擾。

通過上述策略，可在單細胞水平實現(xiàn)數(shù)百至上千種蛋白的識別與定量，為免疫系統(tǒng)中的微弱表達變化提供數(shù)據(jù)支持。

分析策略四：多層次數(shù)據(jù)處理與功能解析

獲取蛋白表達譜只是dìyī步，真正揭示免疫機制還需深入的數(shù)據(jù)解析。免疫相關的單細胞蛋白組數(shù)據(jù)往往具備如下特點：數(shù)據(jù)稀疏、樣本間變異性強、信號動態(tài)跨度大。因此，數(shù)據(jù)分析策略需具備高度適應性。

建議包括：

• 采用批次歸一化與缺失值*策略，提高跨樣本比較能力；

• 運用聚類分析、降維方法識別細胞亞型和狀態(tài)譜系；

• 結(jié)合通路富集分析揭示激活信號軸與調(diào)控網(wǎng)絡；

• 在必要時整合轉(zhuǎn)錄組、多模態(tài)標記或空間信息，形成立體解讀。

合理的分析流程不僅提升數(shù)據(jù)價值，更有助于構(gòu)建免疫細胞的功能圖譜與動態(tài)軌跡。

單細胞dànbáizhì組學為免疫學研究提供了全新的研究維度，在捕捉功能狀態(tài)、解析細胞異質(zhì)性和識別關鍵調(diào)控通路方面展現(xiàn)出巨大潛力。它正在從技術驗證階段逐步走向系統(tǒng)應用，為揭示免疫系統(tǒng)運行機制與干預策略帶來深刻變革。百泰派克生物科技持續(xù)關注單細胞蛋白組技術在免疫研究中的前沿應用，提供標準化實驗平臺與定制化數(shù)據(jù)分析支持，助力科研人員深入探索免疫調(diào)控的本質(zhì)。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優(yōu)勢：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實驗結(jié)果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統(tǒng)準確。

三、單細胞質(zhì)譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。

※服務優(yōu)勢：

1.技術優(yōu)良，*技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右，而流式質(zhì)譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結(jié)合會有新應用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學優(yōu)質(zhì)服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務；

3.業(yè)務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務!

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