從定性到定量,質(zhì)譜在PTM研究中的全能表
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- 公司名稱 北京百泰派克生物科技有限公司
- 品牌 百泰派克
- 型號
- 產(chǎn)地 中國
- 廠商性質(zhì) 其他
- 更新時間 2025/6/15 10:03:53
- 訪問次數(shù) 100
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業(yè)務(wù)范圍主要圍繞蛋白和小分子代謝物檢測兩大板塊,從事蛋白質(zhì)和小分子代謝物的理化性質(zhì)分析及結(jié)構(gòu)解析等相關(guān)技術(shù)服務(wù),為客戶提供高性價比、高效率的技術(shù)服務(wù)。
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從定性到定量,質(zhì)譜在PTM研究中的全能表現(xiàn)檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹
dànbáizhì翻譯后修飾(Post-Translational Modifications, PTMs)是生命活動調(diào)控的關(guān)鍵環(huán)節(jié),廣泛參與信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、代謝調(diào)控、表觀遺傳、免疫應(yīng)答等生物過程。隨著dànbáizhì組學(xué)技術(shù)的持續(xù)演進(jìn),質(zhì)譜(Mass Spectrometry, MS)作為解析PTM的重要技術(shù)手段,已從zuì初的定性檢測跨越到如今的高通量、可重復(fù)的定量分析,展現(xiàn)出qiánsuǒwèiyǒu的全能表現(xiàn)。
一、PTM研究為何離不開質(zhì)譜?
PTM研究的核心挑戰(zhàn),在于其種類多、豐度低、動態(tài)性強(qiáng)。如磷酸化、乙酰化、泛素化、甲基化、糖基化等常見修飾,通常在特定位點上以微量形式出現(xiàn),且易受外界刺激影響而發(fā)生快速變化。常規(guī)的蛋白檢測手段在通量和位點解析方面存在局限,難以滿足系統(tǒng)性、高分辨率的修飾研究需求。而質(zhì)譜技術(shù)具備如下優(yōu)勢,使其在PTM研究中展現(xiàn)出bùkětìdài的能力:
高靈敏度:可檢測低豐度修飾肽段
高特異性:可定位具體修飾位點
高通量:可并行分析成千上萬種修飾事件
高動態(tài)范圍:適配多種樣本背景及處理條件
二、從定性到定量:質(zhì)譜在PTM研究的三重能力
1、jīngzhǔn識別:修飾位點的高置信度鑒定
在PTM研究的起步階段,科學(xué)家往往關(guān)注“是否發(fā)生了修飾”、“修飾位點在哪里”。此時,質(zhì)譜的作用主要體現(xiàn)在修飾肽段的鑒定與位點定位。通過酶解、富集和高分辨率質(zhì)譜掃描,可識別多種類型修飾并結(jié)合數(shù)據(jù)庫搜索工具判定其jīngquè位置。優(yōu)化的富集策略(如TiO?或抗體富集)配合串聯(lián)質(zhì)譜(MS/MS)可有效提高修飾肽段的檢測效率,尤其在研究磷酸化、乙?;鹊拓S度修飾時表現(xiàn)出顯著優(yōu)勢。
2、相對定量:比較不同條件下的修飾水平
PTM不僅“有沒有”重要,“多不多”更關(guān)鍵。在深入機(jī)制研究、藥物篩選或疾病模型構(gòu)建中,相對定量是揭示PTM動態(tài)變化的核心。常用的相對定量策略包括:
標(biāo)記法(如TMT/iTRAQ):多樣本并行、重復(fù)性好,適合系統(tǒng)性研究
無標(biāo)記法(Label-Free):實驗流程簡潔、成本較低,適合探索性分析
通過對不同條件下的修飾肽段強(qiáng)度進(jìn)行統(tǒng)計分析,科學(xué)家可jīngquè描繪信號通路激活、轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控或表觀狀態(tài)轉(zhuǎn)換過程中的PTM波動軌跡。
3、juéduì定量:構(gòu)建PTM定量標(biāo)準(zhǔn)圖譜
在藥物開發(fā)、生物標(biāo)志物驗證等場景中,僅靠相對比較已難滿足jīngquè需求,juéduì定量逐漸成為PTM研究的關(guān)鍵方向。此類分析通常借助合成肽標(biāo)準(zhǔn)品,通過并行反應(yīng)監(jiān)測(PRM)或多反應(yīng)監(jiān)測(MRM)等定向質(zhì)譜策略,獲得特定修飾肽段的真實含量。
三、常見PTM類型的質(zhì)譜解析策略
不同類型的修飾在化學(xué)結(jié)構(gòu)、豐度水平和富集手段上各具特色,因而在質(zhì)譜方案上也需“因材施策”。
通過前期樣本處理優(yōu)化、富集條件控制、掃描方式調(diào)整以及zhuānyè級數(shù)據(jù)解析,質(zhì)譜可jīngzhǔn應(yīng)對各類PTM研究需求。
四、打通數(shù)據(jù)孤島:整合型PTM組學(xué)分析趨勢
隨著系統(tǒng)生物學(xué)的快速發(fā)展,單一PTM維度已難以滿足復(fù)雜生命過程的全貌解析。越來越多研究團(tuán)隊開始采用多PTM協(xié)同分析策略,整合磷酸化、乙?;c泛素化等多種修飾數(shù)據(jù),探索其協(xié)同調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。此外,將PTM組學(xué)與dànbáizhì表達(dá)量、互作組、轉(zhuǎn)錄組、代謝組等多組學(xué)數(shù)據(jù)聯(lián)動分析,可進(jìn)一步提升生物學(xué)解釋力,加速功能機(jī)制發(fā)現(xiàn)。
在dànbáizhì翻譯后修飾研究的全過程中,從早期的修飾識別、到條件間的差異比較、再到靶點的定量驗證,質(zhì)譜始終扮演著核心角色。其靈敏度、通量和可定量特性,使其成為基礎(chǔ)研究和jīngzhǔn醫(yī)學(xué)研究中的“金標(biāo)準(zhǔn)”工具。百泰派克生物科技聚焦質(zhì)譜技術(shù)在PTM研究中的深度應(yīng)用,提供包括修飾類型篩選、樣本預(yù)處理、定量策略選擇、數(shù)據(jù)挖掘與生物學(xué)注釋在內(nèi)的整體解決方案,協(xié)助科研工作者全面挖掘PTM調(diào)控機(jī)制,加速科研突破。