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抗體藥物開發(fā)指南:全長(zhǎng)測(cè)序能解決CDR區(qū)

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百泰派克生物科技-生物藥物表征,生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Biotech Pack Scientific Co., Ltd. 簡(jiǎn)稱BTP)從事以生物質(zhì)譜為依托的生物藥物表征,大分子物質(zhì)(包括蛋白質(zhì)、多肽、代謝物)質(zhì)譜分析以及小分子物質(zhì)檢測(cè)服務(wù)。

l 公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,專業(yè)提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù);

l 獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可,為客戶提供符合藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);

l 業(yè)務(wù)范圍覆蓋蛋白質(zhì)組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等;

l 7大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái),滿足您一站式服務(wù)需求;

l 服務(wù)3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;

l 致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!






業(yè)務(wù)范圍主要圍繞蛋白和小分子代謝物檢測(cè)兩大板塊,從事蛋白質(zhì)和小分子代謝物的理化性質(zhì)分析及結(jié)構(gòu)解析等相關(guān)技術(shù)服務(wù),為客戶提供高性價(jià)比、高效率的技術(shù)服務(wù)。

價(jià)格 詢價(jià)

抗體藥物開發(fā)指南:全長(zhǎng)測(cè)序能解決CDR區(qū)識(shí)別中的哪些難題?檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

在抗體藥物研發(fā)中,CDR(互補(bǔ)決定區(qū))序列的jīngzhǔn識(shí)別至關(guān)重要。CDR決定了抗體的抗原特異性,是親和力工程、候選篩選與zhuānlì布局的關(guān)鍵依據(jù)。然而,由于CDR序列本身的多樣性和結(jié)構(gòu)復(fù)雜性,其準(zhǔn)確解析長(zhǎng)期面臨技術(shù)瓶頸。


隨著質(zhì)譜技術(shù)和序列重建算法的不斷進(jìn)步,基于dànbáizhì水平的全長(zhǎng)抗體測(cè)序技術(shù),正成為突破CDR識(shí)別難題的手段,為抗體開發(fā)提供更高分辨率的結(jié)構(gòu)信息。


一、為什么CDR區(qū)識(shí)別如此關(guān)鍵?

抗體的可變區(qū)由三個(gè)CDR區(qū)(CDR1、CDR2、CDR3)和四個(gè)框架區(qū)(FR)組成。其中,CDR3因其高度多樣性,zuì能決定抗體的結(jié)合特異性,也是zuì難準(zhǔn)確解析的區(qū)域。CDR識(shí)別對(duì)于以下環(huán)節(jié)至關(guān)重要:


  • 抗體親和力改造:CDR結(jié)構(gòu)決定抗原結(jié)合位點(diǎn)的構(gòu)象。

  • 候選抗體篩選與比對(duì):需高保真度地識(shí)別CDR序列差異。

  • 知識(shí)產(chǎn)權(quán)保護(hù):CDR序列常作為抗體zhuānlì的核心內(nèi)容。

  • 免疫原性評(píng)估:需識(shí)別潛在的T細(xì)胞表位,多集中于CDR區(qū)。


二、傳統(tǒng)CDR識(shí)別方法的局限性

過去,CDR識(shí)別多依賴于基因工程構(gòu)建的抗體文庫(kù),通過Sanger測(cè)序或PCR擴(kuò)增獲得VH/VL序列。這些方法存在顯著短板:


  • 模板依賴:需已知抗體基因信息或表達(dá)載體序列。

  • 信息缺失:難以覆蓋抗體修飾區(qū)、序列突變或拼接異構(gòu)體。

  • 無法反映真實(shí)蛋白產(chǎn)物:核酸序列不能還原翻譯后修飾(PTMs)。


尤其對(duì)于來自雜交瘤或動(dòng)物血清的天然抗體樣本,缺乏模板信息的情況下,傳統(tǒng)方法難以實(shí)現(xiàn)CDR的完整解析與jīngzhǔn定位。


三、抗體全長(zhǎng)測(cè)序如何破解CDR識(shí)別難題?

基于質(zhì)譜和高通量測(cè)序技術(shù)的全長(zhǎng)抗體測(cè)序(Top-Down / Bottom-Up + De Novo Assembly),可以從dànbáizhì水平直接讀取完整抗體鏈的氨基酸序列,具有以下優(yōu)勢(shì):

1、從真實(shí)產(chǎn)物出發(fā),避免模板依賴

通過質(zhì)譜對(duì)純化后的抗體蛋白直接進(jìn)行裂解、酶解與片段分析,不依賴DNA模板,即便是來源未知的雜交瘤或臨床樣本,也能jīngzhǔn解析。


2、高精度解析CDR區(qū)

通過搭配多種酶(Trypsin, Chymotrypsin, Lys-C等)產(chǎn)生重疊肽段,并結(jié)合De Novo算法重建序列,CDR1~3的區(qū)域覆蓋率顯著提高。在復(fù)雜背景下,仍能實(shí)現(xiàn)多肽拼接并準(zhǔn)確定位CDR區(qū)。


3、識(shí)別翻譯后修飾與序列變異

全長(zhǎng)測(cè)序可檢測(cè)如半guāngānsuān異構(gòu)、糖基化、異源輕鏈拼接等修飾,有助于識(shí)別非典型CDR區(qū)變化,增強(qiáng)對(duì)功能結(jié)構(gòu)的解析能力。


4、抗體同源異構(gòu)體分辨能力強(qiáng)

對(duì)于有多個(gè)相似抗體的表達(dá)體系(如多克隆抗體、雙特異抗體),高分辨率的質(zhì)譜策略可解析不同CDR組合,支持抗體庫(kù)篩選和優(yōu)化。


四、百泰派克生物科技:加速您的抗體藥物開發(fā)進(jìn)程

在百泰派克生物科技,我們集成高分辨率Orbitrap-MS系統(tǒng)與多酶裂解策略,結(jié)合自研的序列拼接算法,可實(shí)現(xiàn):


  • 全長(zhǎng)IgG抗體的序列還原(>95%覆蓋率)

  • jīngquè解析VH/VL鏈與CDR1-3區(qū)域

  • 識(shí)別低豐度突變與罕見修飾

  • 提供適用于IND申報(bào)的抗體序列報(bào)告


結(jié)語:更快、更準(zhǔn)、更可靠的CDR識(shí)別之路

抗體藥物的成功開發(fā),始于對(duì)其分子本質(zhì)的jīngzhǔn認(rèn)知。全長(zhǎng)抗體測(cè)序技術(shù),尤其在CDR識(shí)別方面展現(xiàn)出qiánsuǒwèiyǒu的解析力和通用性。通過質(zhì)譜級(jí)別的數(shù)據(jù)支持,研究者不僅可以獲取全面、可信的抗體序列信息,更能為親和力優(yōu)化、臨床轉(zhuǎn)化與zhuānlì保護(hù)打下堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。如果您正面臨抗體結(jié)構(gòu)解析或CDR區(qū)確認(rèn)的挑戰(zhàn),歡迎聯(lián)系百泰派克生物科技,我們將以zhuānyè、快速、可靠的測(cè)序方案,助您一臂之力。


百泰派克生物科技特色項(xiàng)目


一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)dànbáizhì序列進(jìn)行分析,提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù),包括對(duì)dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測(cè)序法的dànbáizhì從頭測(cè)序服務(wù),對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。


※服務(wù)優(yōu)勢(shì):

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。



二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù),助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。


※服務(wù)優(yōu)勢(shì):

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法,適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高,實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白,線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析,分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。



三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,采用金屬元素標(biāo)記物(通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體)標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子,然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。


※服務(wù)優(yōu)勢(shì):

1.技術(shù)優(yōu)良,*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù),避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題??稍趩渭?xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征,百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大,成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右,而流式質(zhì)譜技術(shù)一次(單樣本)就可分析至少10^5的細(xì)胞,實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高,且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景;

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外,質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾;

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。



四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析,可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標(biāo)。



五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),MALDI TOF,高效色譜分離技術(shù),提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù),幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。



百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

抗體藥物開發(fā)指南:全長(zhǎng)測(cè)序能解決CDR區(qū)




百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則,通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設(shè)備定期計(jì)量/期間核查,軟件審計(jì)追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù),支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù);

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等;

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái),滿足您一站式服務(wù)需求;

5.服務(wù)3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!



抗體藥物開發(fā)指南:全長(zhǎng)測(cè)序能解決CDR區(qū)識(shí)別中的哪些難題?檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹



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