蛋白質(zhì)相互作用圖檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

dànbáizhì相互作用圖是用于展示dànbáizhì之間相互作用關(guān)系的圖形表示方法。dànbáizhì相互作用（Protein-Protein Interaction Network, PPI網(wǎng)絡(luò)）是現(xiàn)代生物信息學(xué)和系統(tǒng)生物學(xué)研究中的工具。dànbáizhì是細(xì)胞中執(zhí)行大多數(shù)功能的分子機(jī)器，它們通過相互作用形成復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò)，參與細(xì)胞的生命活動(dòng)，從信號傳導(dǎo)到代謝途徑再到基因表達(dá)調(diào)控，幾乎無處不在。dànbáizhì相互作用圖旨在描繪這些復(fù)雜的相互作用網(wǎng)絡(luò)，通過圖形化的方式展現(xiàn)每個(gè)dànbáizhì之間的互動(dòng)關(guān)系。通過相互作用圖，可以發(fā)現(xiàn)與已知功能dànbáizhì相互作用的未知dànbáizhì，從而揭示dànbáizhì功能。例如，若一個(gè)未知蛋白與參與細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的多個(gè)蛋白相互作用，那么它可能也在該信號通路中發(fā)揮作用。此外，dànbáizhì相互作用圖能夠幫助我們直觀地了解這些過程中dànbáizhì之間的復(fù)雜關(guān)系，以及它們?nèi)绾蜗嗷f(xié)作來完成特定的生物學(xué)功能。許多疾病的發(fā)生與dànbáizhì相互作用網(wǎng)絡(luò)的失調(diào)密切相關(guān)。通過比較正常細(xì)胞和疾病細(xì)胞中的dànbáizhì相互作用圖，可以識別出發(fā)生改變的相互作用，這些變化可能是疾病發(fā)生、發(fā)展的關(guān)鍵因素，為疾病的診斷、治療和藥物研發(fā)提供線索。在功能基因組學(xué)中，dànbáizhì相互作用圖有助于預(yù)測未知dànbáizhì的功能。通過與已知功能dànbáizhì的相互作用，推測未知dànbáizhì可能扮演的角色?？傊?，dànbáizhì相互作用圖不僅是揭示生命活動(dòng)背后復(fù)雜機(jī)制的窗口，也是推動(dòng)生物醫(yī)藥行業(yè)不斷前進(jìn)的助力。

一、dànbáizhì相互作用圖構(gòu)建方法

1.實(shí)驗(yàn)方法

（1）酵母雙雜交系統(tǒng)

基于轉(zhuǎn)錄因子的特性，可檢測dànbáizhì之間的直接相互作用。將目標(biāo)蛋白分別與轉(zhuǎn)錄因子的兩個(gè)結(jié)構(gòu)域融合表達(dá)，如果兩個(gè)目標(biāo)蛋白相互作用，就會(huì)使轉(zhuǎn)錄因子的兩個(gè)結(jié)構(gòu)域靠近，從而激活報(bào)告基因的表達(dá)。

（2）親和純化質(zhì)譜技術(shù)

利用特異性抗體或親和標(biāo)簽來純化與目標(biāo)蛋白相互作用的dànbáizhì復(fù)合物，然后通過質(zhì)譜分析鑒定復(fù)合物中的dànbáizhì成分，從而確定dànbáizhì之間的相互作用關(guān)系。

（3）共分餾質(zhì)譜技術(shù)

通過對細(xì)胞裂解物進(jìn)行分級分離，基于dànbáizhì在細(xì)胞內(nèi)的共定位或共表達(dá)特性，將相互作用的dànbáizhì復(fù)合物一起分離出來，再結(jié)合質(zhì)譜分析確定相互作用的dànbáizhì。

（4）熒光共振能量轉(zhuǎn)移技術(shù)

當(dāng)兩個(gè)熒光蛋白標(biāo)記的dànbáizhì相互靠近到一定距離時(shí)，會(huì)發(fā)生能量轉(zhuǎn)移，通過檢測這種能量轉(zhuǎn)移現(xiàn)象來判斷dànbáizhì之間是否存在相互作用。

2.dànbáizhì相互作用圖計(jì)算方法

（1）基于序列相似性的預(yù)測

利用已知相互作用dànbáizhì的序列信息，尋找具有相似序列的其他dànbáizhì，推測它們可能具有相似的相互作用模式。

（2）基于結(jié)構(gòu)的預(yù)測

如果已知dànbáizhì的三維結(jié)構(gòu)，可以通過分析dànbáizhì表面的形狀、電荷分布等特征，預(yù)測其可能與哪些dànbáizhì發(fā)生相互作用。

（3）基于機(jī)器學(xué)習(xí)的預(yù)測

利用大量已知的dànbáizhì相互作用數(shù)據(jù)對機(jī)器學(xué)習(xí)模型進(jìn)行訓(xùn)練，然后使用訓(xùn)練好的模型預(yù)測未知dànbáizhì之間的相互作用。

二、dànbáizhì相互作用圖類型

（1）二元相互作用圖：以節(jié)點(diǎn)表示dànbáizhì，邊表示dànbáizhì之間的相互作用，簡單直觀地展示dànbáizhì兩兩之間的相互作用關(guān)系。

（2）網(wǎng)絡(luò)相互作用圖：更復(fù)雜的表示形式，其中節(jié)點(diǎn)代表dànbáizhì，邊代表相互作用，可展示多個(gè)dànbáizhì之間的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)關(guān)系，包括dànbáizhì復(fù)合物的形成、信號通路中的dànbáizhì級聯(lián)反應(yīng)等。這種圖可以通過節(jié)點(diǎn)的大小、顏色、形狀以及邊的粗細(xì)、顏色等屬性來表示dànbáizhì的不同特征和相互作用的強(qiáng)度等信息。

（3）差異相互作用圖：用于比較不同條件下（如正常組織與疾病組織、不同發(fā)育階段等）dànbáizhì相互作用的變化。在圖中可以突出顯示在不同條件下發(fā)生變化的相互作用，例如新增的相互作用、消失的相互作用或相互作用強(qiáng)度發(fā)生改變的情況，有助于發(fā)現(xiàn)與特定條件相關(guān)的關(guān)鍵dànbáizhì和相互作用。

百泰派克生物科技提供優(yōu)良的dànbáizhì相互作用服務(wù)，助力科研工作者高效揭示dànbáizhì網(wǎng)絡(luò)的奧秘。我們zhuānyè的團(tuán)隊(duì)和jiānduān的技術(shù)手段保證了數(shù)據(jù)的高質(zhì)量和結(jié)果的高可靠性，為您的研究提供堅(jiān)實(shí)的支持。歡迎與我們合作，共同探索生命科學(xué)的未知領(lǐng)域。

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù)，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù)，對蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學(xué)、bǎxiàngdàn白zhìzǔxué、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢：

1.技術(shù)優(yōu)良，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭?xì)胞層面上對多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù)；

2.獲國家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

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