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PCR試驗(yàn)交流
點(diǎn)擊次數(shù)：5571 發(fā)布時(shí)間：2011-6-16
你會讀marker嗎？
zui近在做PCR試驗(yàn)，發(fā)現(xiàn)要了解的東西太多了，很多非常基礎(chǔ)的常識性的知識都很容易出問題，zui近就出現(xiàn)電泳圖中的Marker問題，一起做試驗(yàn)的前輩教我從zui后一條開始數(shù)，zui后一條為11，代表72bp，前面再類推。按此方法比較一直以為自己沒跑出所需條帶，降低條件反復(fù)跑。
然后坐下來總結(jié)經(jīng)驗(yàn)，終于我認(rèn)識到可能是Marker的閱讀問題，并且在試驗(yàn)中我試著用不同的電泳時(shí)間看結(jié)果，發(fā)現(xiàn)有時(shí)候條帶總共是10條，有時(shí)候是9條。我意識到按照zui后一條條帶來定位是不準(zhǔn)確的。并上網(wǎng)查看Marker說明，發(fā)現(xiàn)不同的Marker說明表格顯示有的總共11條，有的總共13條。但是在對照圖片上可以發(fā)現(xiàn)zui后的11號或13號甚至12號條帶往往光有數(shù)據(jù)而不顯示條帶，這說明zui后1條條帶甚至倒數(shù)第二條條帶是很難顯示的。有時(shí)它們在同一個(gè)條帶上標(biāo)記兩個(gè)數(shù)據(jù)，這是因?yàn)槿绻娪緯r(shí)間或膠的濃度影響，有時(shí)無法分辨為兩條。因此，我可以確信，用Marker比較一定要從起始端開始數(shù)，而不能根據(jù)zui末一個(gè)條帶來定位。拿到足夠的證據(jù)，同已經(jīng)做了1年多試驗(yàn)，就要發(fā)表文章的前輩討論，但他仍然堅(jiān)持自己的看法，說是老師教他的。終于我將這個(gè)情況跟技術(shù)員及老板討論，zui終獲得認(rèn)同。這樣看來，這個(gè)問題也不簡單。
另外補(bǔ)充幾條：
1、是應(yīng)該從大條帶端開始數(shù)，原因有二：
小條帶跑得快，時(shí)間長了可能會跑出膠，所以電泳時(shí)要注意好時(shí)間；
在電泳過程中EB是向陰運(yùn)動，所以跑到凝膠下緣的條帶染色很弱甚至不染色，也會看不到！必要時(shí)建議灌制長膠。
2、marker中的小條帶分子量較小，跑的時(shí)間長了容易彌散而導(dǎo)致看不清楚
3、同意上面的說法，zui近也在跑電泳，我每次也是從zui下面數(shù)的，上面的條帶有時(shí)候顏色很淺看不出來！
4、另外還有一些商用Marker，有一個(gè)條帶亮度超過其他條帶（比如為其他的兩倍），比較容易分辨，也可以幫助定位！