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新的基因測試方法一天內(nèi)檢測出肺結(jié)核

2017-3-23  閱讀(211)

在一項(xiàng)新的研究中,研究人員證實(shí)一種用于檢測病人痰液中肺結(jié)核細(xì)菌的不到24小時(shí)基因測試方法(sub-24 hour genetic test)能夠替換標(biāo)準(zhǔn)的肺結(jié)核(TB)診斷方法。

當(dāng)前要獲得一名肺結(jié)核患者的全部診斷信息需要長達(dá)兩個(gè)月的時(shí)間,這是因?yàn)榉谓Y(jié)核菌在實(shí)驗(yàn)室中非常緩慢地生長。多年來,科學(xué)家們一直尋求通過直接檢測痰液樣品中的肺結(jié)核菌DNA來繞過這個(gè)耗費(fèi)時(shí)間的步驟。然而,鑒于痰液中的大多數(shù)細(xì)胞是人細(xì)胞,很難在干擾信號(hào)(人細(xì)胞和其他的細(xì)菌)中發(fā)現(xiàn)靶信號(hào)(即肺結(jié)核菌DNA),而且更難發(fā)現(xiàn)一種可能在*既實(shí)惠又實(shí)用的方法。

在來自英國牛津大學(xué)的研究人員領(lǐng)導(dǎo)下,這種新的基因測試方法利用簡單且又相對實(shí)惠的材料快速地處理痰液,從而偏好地分離肺結(jié)核菌,隨后對這種細(xì)菌DNA進(jìn)行測序和分析。這些牛津大學(xué)研究人員是與來自英國諾丁漢大學(xué)、孟買醫(yī)學(xué)研究基金會(huì)和英格蘭公共衛(wèi)生部門的研究人員合作開展這項(xiàng)研究的。

在此之前,DNA測序需要大量的儀器和一個(gè)設(shè)備完善的實(shí)驗(yàn)室,這就限制了它在這個(gè)領(lǐng)域的潛在應(yīng)用。在這項(xiàng)新的研究中,這些研究人員也證實(shí)利用一種新的實(shí)時(shí)手持式測序設(shè)備(牛津納米孔技術(shù)公司開發(fā)出的MInION),他們利用一種可能在世界上任何地方使用的過程,也能夠獲得相同的結(jié)果。在一個(gè)例子中,他們獲得測試結(jié)果所需的周轉(zhuǎn)時(shí)間是12.5小時(shí)。

利用DNA測序,這種方法不僅能夠檢測耐藥性的肺結(jié)核菌(對病人而言是至關(guān)重要的信息),而且它也能夠追蹤肺結(jié)核菌菌株在地理上的擴(kuò)散。這種擴(kuò)散信息對公共健康工作者而言是非常有價(jià)值的。

肺結(jié)核是世界上傳染病死亡的主要原因之一。2015年,*有1.04千萬肺結(jié)核病例,其中110萬死亡病例直接由肺結(jié)核引起。

牛津大學(xué)惠康基金會(huì)人類遺傳學(xué)中心研究員Zamin Iqbal博士說,“控制肺結(jié)核的一個(gè)重大挑戰(zhàn)之一是在不需要高科技實(shí)驗(yàn)室的情形下,開展快速的和全面的測試。我們證實(shí)在提取病人痰液樣品24小時(shí)內(nèi),獲得用于臨床管理和追蹤疾病擴(kuò)散所需的所有信息是可行的。再者,通過利用一種手持式設(shè)備實(shí)現(xiàn)這一點(diǎn),我們?yōu)樵谝巴鈱Ψ谓Y(jié)核菌進(jìn)行診斷測試打開大門。”

論文共同作者Antonina Votintseva博士說,“盡管基因組測序日益增加地用于分析肺結(jié)核菌,但是限制因素仍然是需要在實(shí)驗(yàn)室中花費(fèi)數(shù)周時(shí)間培養(yǎng)肺結(jié)核菌。通過開發(fā)一種簡單且又實(shí)惠的方法來提取痰液中的肺結(jié)核菌DNA,因而將周轉(zhuǎn)時(shí)間降低到24小時(shí)以下,我們在開發(fā)全面的現(xiàn)場即時(shí)診斷方法的目標(biāo)上邁出了一大步。”

“當(dāng)然還要開展更多的研究---我們的目標(biāo)是在病人離開診所之前給出測試結(jié)果,這就有巨大的潛力降低肺結(jié)核傳播和耐藥性。”

惠康基金會(huì)創(chuàng)新主任Stephen Caddick博士說,“常規(guī)的肺結(jié)核測試方法需要數(shù)周的時(shí)間提供結(jié)果。Iqbal博士和他的團(tuán)隊(duì)通過開發(fā)一種低成本的DNA提取方法而取得重大突破:這種方法能夠直接對病人樣品中的肺結(jié)核菌進(jìn)行全基因組測試,從而在不到一天的時(shí)間里提供測試結(jié)果。利用這種技術(shù)鑒定出可能對抗生素治療產(chǎn)生耐藥性的肺結(jié)核菌菌株的能力可能在抵抗耐藥性感染中是非常有價(jià)值的,特別是中低收入國家。”



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