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HORIBA用戶簡訊|牛津大學開創(chuàng)單細胞水平微生物代謝研究新方法
供稿:Sophie
編輯:Joanna
微生物在生態(tài)系統(tǒng)中扮演重要角色。研究微生物的技術(shù)手段多樣,卻各有利弊:測序技術(shù)、質(zhì)譜和核磁共振結(jié)合技術(shù)多用于整體分析,能夠獲取微生物系統(tǒng)發(fā)育和宏基因組學特征信息,但掩蓋了微生物群體中的高度多樣性;二代質(zhì)譜可以分析單個細胞,但對細胞有破壞且費用高昂。相比于以上的方法,基于穩(wěn)定同位素的拉曼單細胞光譜方法可以實現(xiàn)對單細胞的無損標記。
在此背景下,英國牛津大學工程科學系提出了新設(shè)想,即利用拉曼單細胞光譜結(jié)合氘同位素標記的方法研究氘化碳源在單細胞中的同化吸收。
英國牛津大學
(圖片轉(zhuǎn)自網(wǎng)絡(luò))
相比于對C標記,對碳源中的H氘化這種方式,成本低,還能標記復雜底物。實驗利用HORIBA共聚焦拉曼光譜儀獲得單細胞光譜(SCRS),在2070-2300 cm-1譜段發(fā)現(xiàn)可區(qū)分的C-D振動帶,且C-D帶的強度與碳源氘化的程度成正比。實驗證明了拉曼-氘同位素標記不僅可以指示微生物利用氘化碳源的代謝活動,還可以通過分析光譜揭示不同的代謝途徑。
單細胞拉曼光譜圖(SCRS)
利用低成本和多功能的氘化底物,拉曼-氘同位素標記在單細胞水平上探索代謝途徑和功能上很有潛力 。
更多研究詳細信息可查閱:Analytical Chemistry,DOI: 10.1021/acs.analchem.7b03461或掃描二維碼查看英文原文。
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