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上海生科所揭示全新長非編碼RNA機(jī)制—士鋒生物資訊

點(diǎn)擊次數(shù):1375 發(fā)布時間:2012-11-19

上海生科所揭示全新長非編碼RNA機(jī)制

10月26日,學(xué)術(shù)期刊《分子細(xì)胞》(Molecular Cell)以封面文章形式發(fā)表了中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所陳玲玲研究組的研究論文。該研究揭示了一類全新內(nèi)含子來源的長非編碼RNA的產(chǎn)生機(jī)制,及其參與剪接調(diào)控的重要功能。

幾乎所有哺乳動物細(xì)胞的基因都由外顯子和內(nèi)含子組成。一般認(rèn)為,外顯子片段通過轉(zhuǎn)錄剪接成為具有功能的RNA,而內(nèi)含子序列在剪接后被核酸酶快速降解,因此沒有生物學(xué)功能。而生化與細(xì)胞所的這項(xiàng)研究成果證實(shí),內(nèi)含子來源的非編碼RNA序列既可以在剪接后穩(wěn)定存在,又可以在細(xì)胞中發(fā)揮重要的調(diào)控作用。

該研究具體闡明了一類雙末端都含有小核仁RNA(snoRNA)的內(nèi)含子序列在剪接發(fā)生過程中,可以形成一類新型長非編碼RNA,命名為sno-lncRNAs。在人類疾病Prader-Willi syndrome(PWS綜合癥、小胖威利癥,主要表現(xiàn)為神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育和生長發(fā)育障礙)緊密關(guān)聯(lián)區(qū)域存在五個sno-lncRNAs,它們在人源胚胎干細(xì)胞中表達(dá)量*,且異常穩(wěn)定。功能研究表明,這些sno-lncRNAs加工成熟后均聚集于其轉(zhuǎn)錄位點(diǎn)附近,形成一種全新的細(xì)胞核亞定位;它們同時還含有多個剪接調(diào)控因子Fox2蛋白的特異結(jié)合位點(diǎn),從而可以像“海綿”一樣吸附細(xì)胞核內(nèi)的Fox2,調(diào)節(jié)Fox2在細(xì)胞核內(nèi)的分布,進(jìn)而影響Fox2對特異mRNA底物的選擇性剪接調(diào)控。

上海生科所揭示全新長非編碼RNA機(jī)制

值得一提的是,PWS綜合癥的病理機(jī)制至今不詳,而這些sno-lncRNAs在PWS綜合癥病人中*缺失,從而提示這些新的RNA分子可能與PWS綜合癥的病理發(fā)生相關(guān)。該工作也為進(jìn)一步了解PWS綜合癥的病理機(jī)制提供了新的研究思路。

該工作主要由生化與細(xì)胞所研究生殷慶飛等與計(jì)算生物所楊力研究員以及美國康涅狄格大學(xué)健康中心Gordon Carmichael教授合作完成。這一研究成果揭示了哺乳動物細(xì)胞中存在著內(nèi)含子來源的、具有重要生物學(xué)功能的新型長非編碼RNA(sno-lncRNAs),從而豐富了人們對真核細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組表達(dá)調(diào)控多樣性的認(rèn)識。

該研究工作還入選當(dāng)期Molecular Cell雜志的研究亮點(diǎn)(Issue Highlight),獲得來自美國耶魯大學(xué)研究者的專評。專評指出,“這些全新類型長非編碼RNA的發(fā)現(xiàn)為人們認(rèn)識PWS綜合癥的病理提供新的機(jī)制”。Nature Reviews Molecular Cell Biology也以“非編碼RNA家族中的新成員”為題,亮點(diǎn)評論了該項(xiàng)成果。

該工作得到了科技部、中科院戰(zhàn)略性先導(dǎo)科技專項(xiàng)和上海市科委的經(jīng)費(fèi)支持。

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