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北京百奧創(chuàng)新科技有限公司

單細胞的分離制備與提取擴增

時間:2021-12-3 閱讀:2441
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  細胞是生物學(xué)的基本單位,研究人員正更加努力地嘗試將它們進行單個分離、研究和比較。更大更復(fù)雜的人類細胞基因組。隨著測序成本的大幅度下降,破譯來自單細胞的30億堿基的基因組并逐個細胞比較序列正在變?yōu)楝F(xiàn)實。
 
  目前,最常見的單細胞測序的應(yīng)用是在腫瘤研究上。來自美國和英國的研究人員近日利用單細胞基因組擴增、測序和裝配,從海洋樣本中鑒定出一個單細胞細菌。
 
  單細胞測序方法即single cell sequencing(SNS),能準確定量一個單細胞核中基因拷貝數(shù)目。由于癌細胞中基因組部分被刪除,或者擴增,從而引起關(guān)鍵基因的缺失,或者表達過量,干擾正常細胞生長,因此利用這種方法就能分析基因拷貝數(shù)目,從而診斷。
 
  單細胞的分離:
 
  單細胞測序的第一步是將目的細胞從樣本中分離出,目前主要的技術(shù)包括梯度稀釋法、顯微操作技術(shù)、熒光激活細胞分選、 微流控技術(shù)和激光捕獲顯微切割。
 
  單個細胞中的DNA和RNA含量無法達到測序要求,需要對其進行擴增:
 
  目前分為單細胞全基因組擴增和單細胞轉(zhuǎn)錄組擴增。單細胞全基因組擴增(WGA)是通過將單個細胞溶解得到微量基因組 DNA 進行高效地擴增,獲得高覆蓋度的單細胞基因。常用的技術(shù)為有多重置換擴增技術(shù)(MDA)。MDA 技術(shù)是在恒溫下利用具有強模板結(jié)合的 phi29DNA 聚合酶和六聚物進行鏈置換擴增反應(yīng)。其優(yōu)點是樣本無需純化,操作簡單,產(chǎn)生的 DNA 片段長,錯誤率低,有著良好的 DNA 擴增覆蓋效果,缺點是起始模板量低時擴增偏差性大。

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