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上海徠同生物科技有限公司

蛋白定量-Label-Free非標(biāo)定量實(shí)驗(yàn)流程介紹

時(shí)間:2022-8-10閱讀:369
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非標(biāo)定量(Label-free)

非標(biāo)記定量(label-free)蛋白質(zhì)組學(xué)按其原理主要分為兩種方法:1) Spectrum counts類的非標(biāo)記定量方法:發(fā)展比較早,已經(jīng)形成多種定量算法,但主要原理都是以MS2的鑒定結(jié)果為定量基礎(chǔ),各種方法的差別在于后期算法在大規(guī)模數(shù)據(jù)上的修正。 2) 以MS1為基礎(chǔ),計(jì)算每個(gè)肽段的信號(hào)強(qiáng)度在LC-MS色譜上的積分,Maxquant是現(xiàn)代高靈敏度質(zhì)譜(High resolution of modern spectrometers)結(jié)果的分析軟件,已經(jīng)漸漸成為蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域內(nèi)的標(biāo)準(zhǔn)解決方案之一。

實(shí)驗(yàn)流程

1. 蛋白提取和酶解

2. label free

3. 質(zhì)樸分析

4. 蛋白定性定量

5. 生信分析

結(jié)果展示

實(shí)驗(yàn)周期及交付標(biāo)準(zhǔn)

1. 實(shí)驗(yàn)周期:6周左右

2. 交付標(biāo)準(zhǔn):蛋白定量結(jié)果、鑒定結(jié)果、質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)、生信分析結(jié)果(GO分析、KEGG分析等等)

需確認(rèn)的信息

1. 樣本的種屬

2. 樣本的類型(組織or細(xì)胞or血液)

3. 樣本的數(shù)量及分組

4. 分析要求



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