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上海易匯生物科技有限公司

337839 Qiagen qBiomarker SYBR Fluor Mastermix 用戶指南

時(shí)間:2025-4-23閱讀:148

337839 Qiagen qBiomarker SYBR Fluor Mastermix 用戶指南

——高效、靈敏的實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qPCR)解決方案

一、產(chǎn)品概述

337839 Qiagen qBiomarker SYBR Fluor Mastermix 是德國(guó)凱杰(QIAGEN)公司推出的高靈敏度實(shí)時(shí)熒光定量PCR預(yù)混液,專為基于SYBR Green染料的qPCR實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)。該產(chǎn)品包含優(yōu)化配方的反應(yīng)緩沖液、高保真HotStart DNA聚合酶、dNTPs及SYBR Green I染料,適用于基因表達(dá)分析、SNP分型、病原體檢測(cè)等應(yīng)用場(chǎng)景。

核心參數(shù)

  • 貨號(hào):337839

  • 規(guī)格:25 mL(可滿足250次20 μL反應(yīng))

  • 保存條件:-20℃避光保存,避免反復(fù)凍融

  • 有效期:24個(gè)月(未開(kāi)封)

  • 適用儀器:兼容Bio-Rad、Applied Biosystems、Eppendorf等主流qPCR儀

二、技術(shù)優(yōu)勢(shì)

  1. 高靈敏度與特異性

    • HotStart技術(shù):化學(xué)修飾的DNA聚合酶在95℃高溫下激活,有效抑制非特異性擴(kuò)增,減少引物二聚體形成。

    • SYBR Green I優(yōu)化:染料與雙鏈DNA結(jié)合效率高,熒光信號(hào)強(qiáng),適用于低豐度模板的檢測(cè)(可檢測(cè)至單拷貝基因)。

  2. 寬動(dòng)態(tài)范圍與高重復(fù)性

    • 線性范圍:覆蓋7個(gè)數(shù)量級(jí)(101–10?拷貝),適用于絕對(duì)定量與相對(duì)定量分析。

    • 批間差異:CV值<5%(基于NIST標(biāo)準(zhǔn)品驗(yàn)證),確保實(shí)驗(yàn)結(jié)果可靠性。

  3. 便捷性與兼容性

    • 即用型配方:無(wú)需額外添加MgCl?、dNTPs或染料,簡(jiǎn)化實(shí)驗(yàn)流程。

    • ROX校正選項(xiàng):部分型號(hào)預(yù)混ROX染料,適用于需要ROX校正的儀器(如ABI 7500 Fast)。

三、操作指南

(一)實(shí)驗(yàn)前準(zhǔn)備
  1. 試劑與耗材

    • qBiomarker SYBR Fluor Mastermix(貨號(hào)337839)

    • 引物(終濃度100-900 nM,建議使用QIAGEN OligoPerfect Primer Design工具設(shè)計(jì))

    • cDNA模板(1-100 ng/反應(yīng),根據(jù)目標(biāo)基因豐度調(diào)整)

    • 無(wú)核酸酶水(Nuclease-Free Water)

    • 八聯(lián)管或96孔板(建議使用白色不透明板以減少熒光信號(hào)損失)

  2. 儀器設(shè)置

    • 預(yù)變性:95℃ 5分鐘

    • 40個(gè)循環(huán):95℃ 10秒 → 60℃ 30秒(退火溫度根據(jù)引物Tm值調(diào)整)

    • 熔解曲線分析:60℃→95℃,每0.5℃采集一次熒光信號(hào)

    • 溫度程序

    • 熒光通道:選擇SYBR Green通道(如ABI儀器為FAM/SYBR通道)。

(二)實(shí)驗(yàn)操作
  1. 反應(yīng)體系配制(以20 μL體系為例):


    成分體積(μL)
    qBiomarker Mastermix10
    正向引物(10 μM)0.4
    反向引物(10 μM)0.4
    cDNA模板2
    無(wú)核酸酶水7.2


  2. 加樣與離心

    • 使用多通道移液器加樣,避免氣泡產(chǎn)生。

    • 離心(2000 × g,1分鐘)確保液體沉至管底。

  3. 上機(jī)運(yùn)行

    • 將八聯(lián)管或96孔板放入qPCR儀,運(yùn)行預(yù)設(shè)程序。

    • 實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)熒光信號(hào),保存原始數(shù)據(jù)(Ct值、熔解曲線)。

(三)數(shù)據(jù)分析
  1. Ct值判斷

    • 推薦Ct值范圍:15-30(Ct>35需驗(yàn)證擴(kuò)增特異性)。

    • 陰性對(duì)照(NTC)Ct值應(yīng)無(wú)擴(kuò)增(Ct>40或未檢測(cè)到)。

  2. 熔解曲線分析

    • 單一峰型(Tm值±0.5℃)表明特異性擴(kuò)增。

    • 多峰或肩峰提示引物二聚體或非特異性擴(kuò)增,需優(yōu)化引物或反應(yīng)條件。

  3. 定量方法

    • 絕對(duì)定量:使用標(biāo)準(zhǔn)曲線法,構(gòu)建已知濃度模板的Ct值與拷貝數(shù)關(guān)系。

    • 相對(duì)定量:采用2?ΔΔCt法,以內(nèi)參基因(如GAPDH)歸一化。

四、使用技巧與高效操作

  1. 引物優(yōu)化

    • 使用QIAGEN OligoAnalyzer工具評(píng)估引物二聚體形成風(fēng)險(xiǎn)。

    • 梯度PCR確定最佳退火溫度(Tm±5℃)。

  2. 模板質(zhì)量控制

    • 使用Nanodrop檢測(cè)RNA純度(OD260/280 1.9-2.1,OD260/230 >2.0)。

    • 瓊脂糖凝膠電泳確認(rèn)RNA完整性(真核生物應(yīng)可見(jiàn)28S、18S、5S三條帶)。

  3. 儀器校準(zhǔn)

    • 定期使用NIST標(biāo)準(zhǔn)品驗(yàn)證儀器熒光檢測(cè)準(zhǔn)確性。

    • 確保ROX校正功能正常(如適用)。

五、注意事項(xiàng)

  1. 安全規(guī)范

    • 避免反復(fù)凍融,分裝后保存。

    • 操作時(shí)佩戴手套,避免交叉污染。

  2. 操作細(xì)節(jié)

    • 移液精度:使用校準(zhǔn)后的移液器,誤差<±1%。

    • 加樣順序:先加Mastermix,再加引物和模板,最后加無(wú)核酸酶水。

  3. 故障排除

    • 無(wú)擴(kuò)增信號(hào):檢查引物質(zhì)量、模板濃度及反轉(zhuǎn)錄效率。

    • Ct值偏大:優(yōu)化退火溫度、延長(zhǎng)延伸時(shí)間或提高模板投入量。

六、用戶評(píng)價(jià)與支持

  • 用戶反饋

    • “qBiomarker Mastermix顯著降低了Ct值,提高了低豐度基因的檢測(cè)靈敏度。"

    • “熔解曲線分析功能幫助我們快速識(shí)別非特異性擴(kuò)增,優(yōu)化了實(shí)驗(yàn)條件。"



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