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上海牧榮生物科技有限公司

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用于靶向 DNA 和 RNA 測序的 CleanPlex 擴增子測序技術

閱讀:800      發(fā)布時間:2024-3-8
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CleanPlex ®是一種超可擴展且超靈敏的NGS 擴增子測序技術。它具有高度先進的專有多重 PCR 引物設計算法、極其均勻的多重 PCR 擴增化學物質(zhì) 和 創(chuàng)新的背景清潔化學物質(zhì)。它們共同使得 CleanPlex 即用型和定制 NGS 面板能夠突破傳統(tǒng)的基于擴增子和基于混合捕獲的目標富集技術的限制。


功能亮點:

  • 超高的擴增均勻性和超低的PCR背景噪音(更準確的變異調(diào)用或更低的測序成本)

  • 單管 3 小時工作流程,手動操作時間最少(輕松自動化)

  • 兼容困難樣品(降解的FFPE DNA、FFPE RNA、cfDNA、cfRNA)和主要測序平臺(Illumina、Ion Torrent、Genapsys、MGI DNBSeq)

  • 高的靈敏度(低至單細胞水平直接擴增*)

  • 出色的面板大小可擴展性,單個多重 PCR 池中的擴增子數(shù)可達 20,000 多個

  • 檢測和分析單核苷酸變異(SNV)、小插入和缺失(Indels)、拷貝數(shù)變異(CNV)、基因融合/剪接變異、基因表達水平、腫瘤突變負荷(TMB)、微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(MSI)、內(nèi)部串聯(lián)復制(ITD)等

具體來說,擴增子測序技術提供了一種專注于特定基因或特定感興趣基因組區(qū)域的靶向方法。
全基因組測序(WGS)及其相應的全基因組擴增(WGA)方法更適合研究和發(fā)現(xiàn)類型的應用,而靶向測序或靶向基因測序對于許多快速增長的臨床和工業(yè)應用至關重要,這些應用的成本和速度都受到限制。更重要。

基因組學界面臨的挑戰(zhàn)之一是持續(xù)獲取大量測序原始數(shù)據(jù),這些數(shù)據(jù)尚未全成功地翻譯和解釋,以幫助在更廣泛的范圍內(nèi)推進研究、診斷和治療疾病。即使目前測序成本降低,全基因組測序方法實際上也只能用于基礎研究、群體遺傳學或罕見疾病檢測等特定場景。有針對性的或有針對性的方法將更適合了解疾病進展并指導臨床環(huán)境中的治療選擇或在工業(yè)應用中大規(guī)模篩查 DNA 樣本。此外,就實驗室操作和用于存儲和處理大量數(shù)據(jù)的生物信息學基礎設施而言,對整個基因組或外顯子組進行測序可能非常昂貴。因此,靶向測序對于精準醫(yī)療和研究的持續(xù)進步變得至關重要。

cleanplex DNA 擴增子測序工作流程

圖 2. CleanPlex DNA 靶標富集和文庫制備工作流程

cleanplex RNA 靶標富集文庫制備工作流程

圖 3. CleanPlex RNA 靶標富集和文庫制備工作流程































Paragon Genomics 總部位于舊金山灣區(qū),是一家快速發(fā)展的精準醫(yī)療公司。我們的靶向測序技術CleanPlex® DNACleanPlex® RNA、CleanPlex® UMIOmniFusion™為精準腫瘤學、傳染病檢測、遺傳性疾病檢測、單細胞分析、分子育種和許多其他應用提供全面的解決方案。

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