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質(zhì)粒構(gòu)建的心得分享

時間:2024/2/20閱讀:974
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質(zhì)粒是我們?nèi)粘?shí)驗中比較常用的載體,其可以自主生長,也能通過比較容易的方法進(jìn)行大量擴(kuò)增,但往往單一的質(zhì)粒不能滿足實(shí)驗需求,需通過一系列方法進(jìn)行質(zhì)粒重組,我目前比較常用的方法也就是比較陳舊的酶切重組質(zhì)粒的方式,簡易實(shí)驗過程如下圖:

1708396293214.png

在這個過程中,有幾個小Tips:

1.原載體的酶切位點(diǎn)由文獻(xiàn)、載體說明書或者導(dǎo)師建議得來,選擇正確的酶切位點(diǎn)是重組質(zhì)粒開始的第一步,常見的酶切體系如下:

image.png

上述體系適用于大多數(shù)酶切,不是特別難切開的載體1μl內(nèi)切酶足夠,酶切前計算好量,先加ddH2O,最后加內(nèi)切酶。


2.酶切完成后,需要跑瓊脂糖膠鑒定酶切效果,配膠時注意選擇合適的膠濃度,原則是分子量越大,膠濃度越小。跑膠完成后紫外燈下一般會有兩段即為成功:載體和切下來的片段,根據(jù)結(jié)果進(jìn)行膠回收,注意切下來的片段不回收,膠回收完成后測濃度備用。


3.插入片段根據(jù)自己的實(shí)驗選擇,通常插入片段可以通過PCR而來,或者是一段由三方公司合成的序列,在連接開始前也需要用同樣的兩個內(nèi)切酶切出缺口。常見連接體系如下:


圖片
16℃連接4h以上或過夜。

其中,加入載體和插入片段的量由說明書得來,加樣前計算好量,先加ddH2O,最后加連接酶,由于連接體系較小,一般使用pcr管進(jìn)行。

4、為確保連接的順利進(jìn)行,務(wù)必保證連接酶和連接酶緩沖液配套使用,即使用同一廠家的,不能混用。

5、上述過程中涉及到的不管是內(nèi)切酶還是連接酶,都是比較昂貴的,使用時要用冰盒,用完及時放回-20℃冰箱。
6、進(jìn)行轉(zhuǎn)化時,根據(jù)載體說明書選擇合適的感受肽細(xì)胞,同時仔細(xì)閱讀感受肽細(xì)胞說明書,看清涂板體積、涂板后的培養(yǎng)時間、培養(yǎng)溫度等。
7、挑取單克隆時,推薦至少選擇兩個及以上。
8、搖菌時,注意擰松菌管的蓋子,傾斜放入恒溫(一般為37℃)搖床,搖菌時間12-16h為宜。
9、搖菌完成后進(jìn)行質(zhì)粒提取,測濃度后送測序,注意這里會有部分說明書推薦選擇新的內(nèi)切酶酶切后跑瓊脂糖膠進(jìn)行鑒定,這也是一種鑒定方式,可以根據(jù)酶切片段的大小來判斷重組是否正確,但是,最終確定還是推薦進(jìn)行測序,因為我們無法保證在整個過程中堿基不會發(fā)生突變,可以根據(jù)上述方式選擇酶切片段大小正確的質(zhì)粒進(jìn)行測序。

測序的準(zhǔn)確性對于后續(xù)慢病毒感染是非常重要的,因此測序公司的選擇十分重要,尤其出現(xiàn)一些比較難測的結(jié)構(gòu)如shRNA的發(fā)卡結(jié)構(gòu)等,測序技術(shù)不成熟的話會一直報重疊峰或者測不通的情況。

安培生物致力成為推動生命科學(xué)進(jìn)步值得信賴的合作者

  

  深圳/湛江安培生物科技有限公司,是一家具有核心的技術(shù)實(shí)力、先進(jìn)的經(jīng)營管理水平和完善的市場銷售體系的生物高科技企業(yè)。總部設(shè)在廣東,服務(wù)面向全國。安培生物集進(jìn)口試劑、實(shí)驗室耗材銷售、技術(shù)服務(wù)與合約開發(fā)為一體的專業(yè)化高科技公司,旨在為生命科學(xué)的發(fā)展提供較好的產(chǎn)品與服務(wù)。本公司建立了涵蓋分子生物學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、免疫學(xué)、信號傳導(dǎo)和神經(jīng)科學(xué)等領(lǐng)域的產(chǎn)品供應(yīng)線,在各個領(lǐng)域內(nèi)向用戶提供較高的水平和質(zhì)量穩(wěn)定的產(chǎn)品,安培生物致力于為廣大的科研機(jī)構(gòu)、高等院校等客戶提供各種產(chǎn)品、技術(shù)支持與服務(wù)。


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