如何選擇合適的蛋白質測序技術？檢測技術服務詳情介紹

dànbáizhì測序是研究dànbáizhì結構與功能的核心技術，廣泛應用于靶點發(fā)現、機制解析、生物標志物篩選、抗體表征等生物醫(yī)學研究和藥物開發(fā)領域。然而，隨著質譜技術和化學測序手段的不斷發(fā)展，市面上可選的dànbáizhì測序技術越來越多，不同技術的適用場景、分辨率、成本和通量也有所差異。那么，面對眾多測序方案，科研人員應如何科學選擇zuì適合的dànbáizhì測序技術？本文將從技術原理、核心優(yōu)勢、典型應用和選擇建議四個方面進行系統(tǒng)解析，助力您做出高效決策。

一、dànbáizhì測序技術的主流類型

dànbáizhì測序主要分為兩大類：基于質譜的分析型測序（Bottom-up / Top-down） 和基于Edman降解的化學測序，以及新興的單分子測序方法。目前常用的包括：

1、Bottom-up dànbáizhì質譜測序（肽段級）

（1）原理：將dànbáizhì酶解為肽段，通過LC-MS/MS分析肽段序列

（2）優(yōu)點：高通量、高靈敏度、適用于復雜樣本

（3）限制：肽段映射存在不wánquán覆蓋風險，PTM信息可能丟失

2、Top-down dànbáizhì測序（全長級）

（1）原理：對完整蛋白進行質譜裂解，直接讀取片段結構

（2）優(yōu)點：可保留修飾信息，適用于單一蛋白、蛋白異構體解析

（3）限制：對蛋白純度和質譜分辨率要求jígāo

3、Edman降解（經典化學測序）

（1）原理：氨基末端逐個循環(huán)切除并鑒定氨基酸殘基

（2）優(yōu)點：序列準確率高，適合小分子肽段

（3）限制：序列長度有限，一般不超過30個氨基酸；對N端封閉蛋白無效

4、單分子dànbáizhì測序（正在發(fā)展中）

（1）原理：通過納米孔、熒光或光學方法直接讀取單分子氨基酸序列

（2）優(yōu)點：理論上可實現單細胞分辨率

（3）限制：仍處于研發(fā)或早期商業(yè)化階段，成本高、精度待優(yōu)化

二、不同應用場景下的dànbáizhì測序技術推薦

根據研究目標的不同，dànbáizhì測序技術的選擇也應有所側重。以下是常見科研或藥物開發(fā)場景下的推薦策略：

1、抗體表征與確認序列

（1）推薦技術：Top-down質譜 或Edman降解結合質譜

（2）原因：需要識別抗體的可變區(qū)（CDR）序列和輕重鏈組合，且要求序列準確性高

（3）百泰派克解決方案：支持原液抗體、雜交瘤上清或純化產物的抗體全序列分析，結合酶切優(yōu)化與高分辨Orbitrap測序，準確度>98%

2、新蛋白/未知蛋白的初步鑒定

（1）推薦技術：Bottom-up質譜測序（de novo + database search）

（2）原因：無需已知序列，適合物種數據庫缺乏或全新蛋白探索

（3）百泰派克支持：搭建多酶酶解 + 多段母離子篩選 + 數據庫+反向數據庫的混合算法，提升未知蛋白識別能力

3、蛋白翻譯后修飾（PTM）位點測序

（1）推薦技術：Bottom-up + ETD/HCD串聯(lián)質譜

（2）原因：需解析磷酸化、乙?；⑻腔刃揎椢稽c的jīngquè位置

（3）百泰派克優(yōu)勢：支持多種PTM富集策略，配合二級碎裂優(yōu)化策略提高鑒定覆蓋率

4、蛋白藥一致性/穩(wěn)定性研究

（1）推薦技術：Top-down測序 + 高分辨同分異構體解析

（2）原因：可用于批次一致性驗證、突變體鑒定、降解產物分析

（3）百泰派克平臺：具備 >240,000分辨率的Orbitrap Eclipse系統(tǒng)，可實現蛋白異構體水平解析

三、技術選型建議：如何快速做出決策？

在選擇dànbáizhì測序技術時，可重點參考以下5個維度：

如果無法明確判斷，建議選擇具備多平臺、多技術整合能力的第三方機構，如百泰派克生物科技，進行項目評估與策略設計。

百泰派克生物科技的dànbáizhì測序服務特色

百泰派克生物科技構建了完整的dànbáizhì測序平臺，覆蓋從低通量到高通量、從標準酶解到gāojí修飾識別的全流程技術能力：

* 高分辨質譜平臺：Orbitrap Eclipse、timsTOF Pro 2

• 多重酶解策略：Trypsin、Glu-C、Chymotrypsin 等組合

• 高置信序列重建算法：支持 de novo + 數據庫混合建庫

• 抗體測序專線服務：支持雜交瘤細胞、原液抗體、表達產物全流程表征

• 專家級數據解讀報告：涵蓋序列圖譜、置信評分、比對結果、可視化圖例

我們致力于為高?？蒲袌F隊、生物醫(yī)藥企業(yè)提供個性化、一站式的dànbáizhì測序解決方案。無論是探索性發(fā)現，還是產品級一致性分析，我們都能助您高效推進科研與開發(fā)進程。

dànbáizhì測序技術正以qiánsuǒwèiyǒu的速度革新，并不斷拓展其在jīngzhǔn醫(yī)學、抗體藥物開發(fā)和基礎研究中的應用邊界。選擇合適的技術方案，不僅影響數據質量，也直接關系到項目進展速度和研究深度。如果您正面臨技術選型難題，歡迎聯(lián)系百泰派克生物科技的項目經理，我們將為您提供免費的技術評估建議與項目設計支持，讓您的每一次測序投資更具價值。

百泰派克生物科技特色項目

一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。

※服務優(yōu)勢：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、dànbáizhì組學

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫(yī)學及高通量修飾組學等研究工作。

※服務優(yōu)勢：

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析，發(fā)現新的生物標記物;

2.體內體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質譜分析靈敏度高，實驗結果重復度高;

4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統(tǒng)準確。

三、單細胞質譜流式技術分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統(tǒng)進行單細胞質譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質量譜，zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。

※服務優(yōu)勢：

1.技術優(yōu)良，*技術空白

采用金屬標記抗體技術，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題?？稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。

2.分析數量大，成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右，而流式質譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現了數量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應用前景大

①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規(guī)蛋白外，質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現

百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發(fā)現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質生物藥物分析服務，幫助生物醫(yī)藥生產商提高生物藥物品質。

百泰派克生物科技七大檢測平臺

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質譜多組學優(yōu)質服務商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證，建立了完備的質量體系，數據冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產放行。

1.公司采用ISO9001質量控制體系，zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務；

2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質量研究服務；

3.業(yè)務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等；

4.七大質量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；

5.服務3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質的生物質譜分析服務!

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