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應(yīng)用賽默飛Orbitrap對TMT 標(biāo)記樣本進(jìn)行MS2 定量

閱讀:448      發(fā)布時(shí)間:2017-08-21
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前言
目前,蛋白質(zhì)組學(xué)研究已經(jīng)由傳統(tǒng)的大規(guī)模鑒定逐步轉(zhuǎn)
向了靶向蛋白質(zhì)組學(xué),研究內(nèi)容已經(jīng)由蛋白質(zhì)鑒定擴(kuò)
展到了蛋白質(zhì)相對和定量,蛋白質(zhì)相對定量方法中
應(yīng)用zui普遍的為標(biāo)記定量,包括:ICAT,DIART,ICPL,
TMT,iTRAQ 等等,其中又以 TMT 以及 iTRAQ 的應(yīng)用zui為
廣泛。
傳統(tǒng)的 TMT 以及 iTRAQ 標(biāo)記實(shí)驗(yàn)均使用 MS2 碎片報(bào)告離
子來進(jìn)行定量,但是 Steven P Gygi 等人發(fā)現(xiàn)該方法由于母
離子篩選過程易受到基質(zhì)干擾,因而定量結(jié)果與真實(shí)值
相比偏低,而使用 MS3 碎片報(bào)告離子來進(jìn)行定量,則可
以很好的解決這一問題,


使用儀器:液相色譜儀 Thermo Scientific Easy-nLC 1000

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賽默飛色譜及質(zhì)譜

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