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如何看懂質(zhì)粒圖譜和質(zhì)粒上各個(gè)元件

來(lái)源:上海邦景實(shí)業(yè)有限公司   2017年01月04日 16:33  

如何看懂質(zhì)粒圖譜和質(zhì)粒上各個(gè)元件具體作用是什么。

看載體圖譜大部分可以根據(jù)以下幾步來(lái)理解:

*步:首先看Ori的位置,了解載體的類型(原核/真核/穿梭載體)Ori的箭頭指復(fù)制方向,其他元件標(biāo)注的箭頭多指轉(zhuǎn)錄方向(正向)。

所謂穿梭載體是指一類人工構(gòu)建的具有兩種不同復(fù)制起點(diǎn)和選擇標(biāo)記,因而可以在兩種不同類群宿主中存活和復(fù)制的質(zhì)粒載體。此概念不僅用于不同的微生物菌群之間,也可以推廣到真核生物表達(dá)載體的構(gòu)建,如用于枯草的pBE2、酵母的pPIC9K、哺乳動(dòng)物表達(dá)載體pMT2 和用于植物細(xì)胞的Ti 質(zhì)粒。這些穿梭載體不僅可以在大腸桿菌中復(fù)制擴(kuò)增,也可以在相應(yīng)的枯草、酵母、動(dòng)物或植物細(xì)胞中擴(kuò)增和表達(dá)。這樣利于對(duì)質(zhì)粒的分子生物學(xué)操作和大量制備。

第二步:再看篩選標(biāo)記,如抗性,決定使用什么篩選標(biāo)記。

(1)Ampr 水解β-內(nèi)酰胺環(huán),解除氨芐的毒性。
(2)tetr 可以阻止四環(huán)素進(jìn)入細(xì)胞。
(3)camr 生成氯霉素羥乙?;苌?,使之失去毒性。
(4)neor(kanr) 氨基糖苷磷酸轉(zhuǎn)移酶 使G418(長(zhǎng)那霉素衍生物)失活
(5)hygr 使潮霉素β失活。

第三步:看多克隆位點(diǎn)(MCS)。
它具有多個(gè)限制酶的單一切點(diǎn)。便于外源基因的插入。如果在這些位點(diǎn)外有外源基因的插入,會(huì)導(dǎo)致某種標(biāo)志基因的失活,而便于篩選。決定能不能放目的基因以及如何放置目的基因。

第四步:再看外源DNA插入片段大小。
一般來(lái)說(shuō),外源DNA的片段越長(zhǎng),越難插入,越不穩(wěn)定,轉(zhuǎn)化效率越低。

第五步:是否含有表達(dá)系統(tǒng)元件,即啟動(dòng)子-核糖體結(jié)合位點(diǎn)-克隆位點(diǎn)-轉(zhuǎn)錄終止信號(hào)。這是用來(lái)區(qū)別克隆載體與表達(dá)載體。克隆載體中加入一些與表達(dá)調(diào)控有關(guān)的元件即成為表達(dá)載體。選用哪種載體,還是要以實(shí)驗(yàn)?zāi)康臑闇?zhǔn)。
要把一個(gè)有用的目的基因通過(guò)基因工程手段送到生物細(xì)胞(受體細(xì)胞),需要運(yùn)載工具攜帶外源基因進(jìn)入受體細(xì)胞,這種運(yùn)載工具就叫做載體。載體有克隆載體,看懂質(zhì)粒圖譜是將目的基因裝入載體前必須要做的功課,只有看懂質(zhì)粒圖譜才知道如何將目的基因裝入載體及所要用的載體的大致用途。

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