由于農(nóng)藥的品種繁多，各種農(nóng)藥的化學(xué)結(jié)構(gòu)各異，同時(shí)中藥中自身的化學(xué)成分性質(zhì)若于農(nóng)藥相近，會對檢測造成干擾。中藥材中農(nóng)藥的殘留屬于痕量級，所有這些決定了中藥材中農(nóng)藥殘留的檢測難度很大，因此檢測方法也是不斷發(fā)展的，到目前為止，用于中藥材中農(nóng)藥殘留量檢測的方法有以下幾種：

①、氣相色譜法（GC）：此法是農(nóng)藥殘留檢測的主要分析手段，在有機(jī)磷和有機(jī)氯農(nóng)藥的檢測中仍占據(jù)優(yōu)勢。

②、液相色譜法（HLPC）：此法適用于分析熱不穩(wěn)定及強(qiáng)極性農(nóng)藥及其代謝產(chǎn)物，且可以與柱前提取、純化、柱后熒光衍生化反應(yīng)及MS聯(lián)用，易實(shí)現(xiàn)分析自動(dòng)化。現(xiàn)常用于氨基甲酸酯類化合物的分析測定

③、薄層色譜法（TLC）：主要用于定性分析，方法簡單，可同時(shí)分析多個(gè)樣品，常用于復(fù)雜混合物的分離和篩選

④、酶聯(lián)免疫吸附法:此法可準(zhǔn)確定性定量，適用于現(xiàn)場分析，缺點(diǎn)是由于制備抗體比較困難，因此會出現(xiàn)假陽性或假陰性的結(jié)果

⑤、活體生物測定法：此法可定量，用于現(xiàn)場分析，缺點(diǎn)是農(nóng)藥濃度和發(fā)光強(qiáng)度的線性不夠準(zhǔn)確，只能半定量

⑥、原子吸收光譜法：此法適用于無機(jī)鹽農(nóng)藥的檢測