Taq DNA聚合酶有幾種,除了普通擴(kuò)增用的Taq DNA聚合酶外，還有以下幾種特意性Taq DNA聚合酶。
a，保真性的一個(gè)通用標(biāo)準(zhǔn)是錯(cuò)配率，錯(cuò)配率越低保真性越好。普通 Taq 酶的錯(cuò)配率在 10 -5 堿基 / 循環(huán)數(shù)，而高保真 Taq 酶錯(cuò)配率可降到 10 -6 數(shù)量級，大大降低了出錯(cuò)的可能性；它適合對 PCR 保真性要求較高的實(shí)驗(yàn)，如基因篩選、測序、突變檢測等等。高保真 Taq 酶的保真原理是：高保真 Taq 酶具有 3‘ 到 5’ 核酸外切酶的活性。目前市面上主要有兩類產(chǎn)品：一類是混合型的高保真酶，將帶有 Proofreading 活性的酶與普通 Taq 酶（用于提高擴(kuò)增效率）混合起來；另一類是單一型的高保真酶。
b，熱啟動Taq酶（高特異Taq酶）：在 PCR *個(gè)循環(huán)變性之前，有一個(gè)升溫的過程，引物和模板會有一些非特異性配對，如果這時(shí) Taq 酶發(fā)揮活性，就很容易產(chǎn)生非特異性擴(kuò)增，由于循環(huán)初期模板量非常少，產(chǎn)生的非特異性條帶經(jīng)過后面的指數(shù)擴(kuò)增，就會嚴(yán)重干擾目的片段的擴(kuò)增，甚至導(dǎo)致特異性條帶不能擴(kuò)出；而熱啟動 Taq 酶是必需經(jīng)過高溫才能激活的酶，因此在初始循環(huán)的變性之前它沒有活性，不會產(chǎn)生非特異性擴(kuò)增，這就大大提高了 PCR 擴(kuò)增的特異性。
c，高耐熱Taq酶： 對于有些模板變性溫度較高，需要時(shí)間較長，可能要求高耐熱性 Taq 酶，如 NEB 公司的 Vent 和 Deep Vent DNA 聚合酶系列，兩者都是從海底火山口分離出來后克隆的，是普通 Taq 酶耐熱性的三倍以上，前者在 95°C 半衰期近 7 小時(shí)， 100°C 近 2 小時(shí)；而后者分別為 23 小時(shí)和 8 小時(shí)。
d，超長片段擴(kuò)增Taq酶:對于作基因組圖譜、測序及分子遺傳學(xué)研究的科研人員，可能會用到超長片段的擴(kuò)增， Clontech 公司的 Advantage Genomic 系列混有 Tth DNA 聚合酶， Proofreading 酶和熱啟動抗體，對復(fù)雜模板可擴(kuò)增 10kb 片段，簡單模板可達(dá) 40kb 。