微生物菌種保存用的培養(yǎng)基。培養(yǎng)基也是菌種保存中一個重要的部分，采用的培養(yǎng)基碳源比例應該較少一些，營養(yǎng)成分也需要貧乏一些，否則的話就容易產(chǎn)生酸，或者使菌種的代謝活動增強，這樣會減短保存時間。而如果采用的是砂土管保存，那么則需要把砂土清洗干凈，否則這里面就會含有過多的有機物，會影響到細菌的代謝，或者會使菌種產(chǎn)生一些有毒物質。冷凍干燥所使用的大多數(shù)保護劑都會在加熱下分解，所以在滅菌環(huán)節(jié)要格外注意。
    比如說對冷凍干燥環(huán)節(jié)的速度，也會對菌種保存造成影響。如果速度過慢，就會導致菌種的內(nèi)部形成大的冰晶，對細胞的內(nèi)部結構造成損害。真空干燥的程度也會對菌種的保存造成影響。
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  微生物菌種在保存之前的狀態(tài)。絕大多數(shù)的菌種，保存的都應該十它的休眠體，比如說孢子或者是芽孢。而且用來保存的孢子或者是芽孢，應該采用的是新鮮的斜面上生長的非常豐滿的培養(yǎng)物。而菌種培養(yǎng)的時間和溫度都會影響到菌種的保存質量。如果說培養(yǎng)時間太短，那么保存的時候就容易死亡。而培養(yǎng)的時間如果太長，又容易使菌種的性能發(fā)生衰退。一般來說，溫度稍微低于菌種的適宜生長溫度，這樣的條件下效果是的。
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