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單系統(tǒng)全自動(dòng)離子色譜儀非常廣泛，離子色譜儀的工作過程是：輸液泵將流動(dòng)相以穩(wěn)定的流速(或壓力)輸送至分析體系，在色譜柱之前通過進(jìn)樣器將樣品導(dǎo)入，流動(dòng)相將樣品帶入色譜柱，在色譜柱中各組分被分離，并依次隨流動(dòng)相流至檢測(cè)器，單系統(tǒng)全自動(dòng)離子色譜儀則在電導(dǎo)檢測(cè)器之前增加一個(gè)抑制系統(tǒng)，即用另一個(gè)高壓輸液泵將再生液輸送到抑制器，在抑制器中，流動(dòng)相的背景電導(dǎo)被降低，然后將流出物導(dǎo)入電導(dǎo)檢測(cè)池，檢測(cè)到的信號(hào)送至數(shù)據(jù)系統(tǒng)記錄、處理或保存。
單系統(tǒng)全自動(dòng)離子色譜儀的抑制系統(tǒng)，對(duì)于抑制型(雙柱型)離子色譜系統(tǒng)，抑制系統(tǒng)是重要的一個(gè)部分，也是離子色譜有別于液相色譜的較重要特點(diǎn)。離子色譜的分離系統(tǒng)，分離系統(tǒng)是離子色譜的核心和基礎(chǔ)。離子色譜儀的“心臟”，要求它柱效高，選擇性好，分析速度快等。離子色譜是一種液固色譜，為液相色譜的一種，但柱填料和分離機(jī)理有其自身特點(diǎn)，離子色譜柱的研究也是離子色譜領(lǐng)域的一個(gè)熱門課題。離子色譜柱填料的粒度一般在5～25μm之間，比液相色譜的柱填料略大，因此其壓力比液相色譜的要小，一般為單分散，而且呈球狀。
單系統(tǒng)全自動(dòng)離子色譜儀的分離過程,在色譜柱中,填充了無數(shù)的離子交換劑作為離子分離的固定相,固定相上吸附了很多陽離子.充滿色譜柱的流動(dòng)相為某種鹽的溶液,在沒有樣品進(jìn)入時(shí),薄層層析板流動(dòng)相中的陰離子和固定相的陽離子保持平衡.樣品中含有兩種待分離陰離子,比表面積測(cè)定儀基中體積較大的A與固定相的正電荷作用力較大,而體積較小的B作用力小.在樣品進(jìn)入色譜柱后,陰離子A、B與流動(dòng)相陰離子一同前進(jìn)，三種離子不斷的交替占據(jù)與固定相陽離子相吸的位置,樣品陰離子A與正電荷的作用力較大因而移動(dòng)較慢,固相萃取而B移動(dòng)較快,從而實(shí)現(xiàn)了分離.單系統(tǒng)全自動(dòng)離子色譜儀是液相色譜儀的一種,其有別于傳統(tǒng)離子交換色譜柱色譜的主要是樹脂具有很高的交聯(lián)度和較低的交換容量，進(jìn)樣體積很小，用柱塞泵輸送淋洗液通常對(duì)淋出液進(jìn)行在線自動(dòng)連續(xù)電導(dǎo)檢測(cè).
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