普通的PCR儀

把一次PCR擴增只能運行一個特定退火溫度的PCR儀，叫傳統(tǒng)的PCR儀，也叫普通PCR儀。

它是由主機，加熱模塊，PCR管，熱蓋，控制軟件組成。根據(jù)DNA的片段高溫解鏈，降溫配對聚合原理，通過循環(huán)改變加熱模塊的溫度，微量不易于分辨的的DNA的片段進行擴增成大量的DNA的片段，從而對其進行分析鑒定。根據(jù)需要可結(jié)合電泳儀，水平電泳槽，一起應用。如果要做不同的退火溫度需要多次運行。主要是做簡單的，對目的基因退火溫度的擴增。

該儀器主要應用于醫(yī)學臨床檢驗，食品檢測，科研機構，高等院校教學對遺傳變異，基因表達等進行研究。

梯度PCR儀

把一次性PCR擴增可以設置一系列不同的退火溫度條件（溫度梯度），通常12鐘溫度梯度，這樣的儀器就叫梯度PCR儀。

工作模式和原理同普通PCR儀一樣，它出了又普通PCR儀的功能外還多了一個梯度退火功能。DNA的片段的擴增對溫度的控制精度要求特別高，不同的DNA的片段其退火溫度不一樣，通過計算DNA的片段中的CG堿基的含量只能初步的判斷出較為優(yōu)退火溫度在+5℃范圍內(nèi)，如果用普通PCR儀進行研究，需重復擴增很多次，然后做電泳進行分析來確定較為優(yōu)退火溫度。而梯度PCR儀則只需要一次就可以完成，在節(jié)省了時間的同時提高了實驗的可靠性和準確性。主要用于研究未知DNA退火溫度的擴增，這樣節(jié)約成本的同時也節(jié)約了時間和經(jīng)費。在不設置梯度的情況下，梯度PCR儀也可以做普通PCR擴增。

該儀器主要應用于科研，教學機構，醫(yī)學臨床研究，高等院校，病毒分析，疾控中心等。

原位PCR儀

它是由主機，加熱模塊，玻片，熱蓋，控制軟件組成。主要是應用對細胞或組織內(nèi)的DNA的片段進行原位擴增分析-即定位分析，如病源基因在細胞的位置或目的基因在細胞內(nèi)的作用位置等。是保持細胞或組織的完整性，使PCR反應體系滲透到組織和細胞中，在細胞的靶DNA所在的位置上進行基因擴增，不但可以檢測到靶DNA，又能標出靶序列在細胞內(nèi)的位置，于分子和細胞水平上研究疾病的發(fā)病機理和臨床過程及病理的轉(zhuǎn)變有重大的實用價值。它無需將細胞破碎提取DNA，細胞內(nèi)有DNA酶的作用擴增受到一定的影響，使用不是很普遍。

該儀器主要應用于醫(yī)學臨床研究，如癌細胞等。

實時熒光定量PCR儀

在普通PCR儀的基礎上增加一個熒光信號采集系統(tǒng)和計算機分析處理系統(tǒng)，就成了熒光定量PCR儀。

其PCR擴增原理和普通PCR儀擴增原理相同，只是PCR擴增時加入的引物是利用同位素、熒光素等進行標記，使用引物和熒光探針同時與模板特異性結(jié)合擴增。擴增的結(jié)果通過熒光信號采集系統(tǒng)實時采集信號連接輸送到計算機分析處理系統(tǒng)得出量化的實時結(jié)果輸出。把這PCR儀叫做實時熒光定量PCR儀。熒光定量PCR儀有單通道，雙通道，和多通道。當只用一種熒光探針標記的時候，選用單通道，有多熒光標記的時候用多通道。單通道也可以檢測多熒光的標記的目的基因表達產(chǎn)物，因為一次只能檢測一種目的基因的擴增量，需多次擴增才能檢測完不同的目的基因片段的量。多色多通道檢測是當今的主流趨勢--儀器的激發(fā)通道越多，儀器適用的熒光素種類越多，儀器適用范圍就越寬；多通道指可同時檢測一個樣品中的多種熒光，儀器就可以同時檢測單管內(nèi)多模版或者內(nèi)標+樣品，通道越多，儀器適用范圍越寬、性能就更強大，價格也較為為昂貴。

該儀器主要應用于醫(yī)學臨床檢測，生物醫(yī)藥研發(fā)，食品行業(yè)，科研院校等機構。如動物疾病檢測：禽流感、新城疫、口蹄疫、豬瘟、沙門菌、大腸埃希菌、胸膜肺炎放線桿菌、寄生蟲病等、炭疽芽孢桿菌。食品安全：食源微生物、食品過敏源、轉(zhuǎn)基因、乳品企業(yè)阪崎腸桿菌等檢測?？茖W研究：醫(yī)學、農(nóng)牧、生物相關分子生物學定量研究、大學及研究所等。