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液相色譜質(zhì)譜是指樣品中各組分經(jīng)液相色譜儀分離后先后經(jīng)適用的接口導入質(zhì)譜儀中，被離子源電離成具有一定質(zhì)荷比的碎片離子，由質(zhì)量分析器分離而被檢測，后由計算機處理得到碎片離子組成的單一組分的質(zhì)譜圖，再由質(zhì)譜圖鑒定出該組分的結(jié)構(gòu)組成。液相色譜和質(zhì)譜聯(lián)機的關(guān)鍵是選用適合的接口，即要將大氣壓條件下的色譜分離和氣化與質(zhì)譜高真空條件下的電離連接。
液相色譜質(zhì)譜的連接技術(shù)主要有大氣壓離子化技術(shù)，如電噴霧電離、大氣壓化學電離、大氣壓光電離和基體輔助激光解吸電離技術(shù)等。其中ESI和APCI接口是現(xiàn)有液相色譜質(zhì)譜用儀器中為普遍的接口。接口技術(shù)的成功開發(fā)使液相色譜質(zhì)譜用儀在生物、醫(yī)藥、化工、農(nóng)業(yè)和環(huán)境等領(lǐng)域中得以廣泛應用。液相色譜質(zhì)譜用結(jié)合了液相色譜儀有效分離熱不穩(wěn)性及高沸點化合物的分離能力與質(zhì)譜儀很強的組分鑒定能力，其應用范圍極廣。
但液相色譜質(zhì)譜用的缺點是試樣組分在進入離子源前必須去除溶劑，故沸點與溶劑相近或低的組分不能檢測；由于溶劑很難揮發(fā)干凈，本底效應較高，不利于分辨；沒有商品化的譜庫可對比查詢，只能自建譜庫或自己解析譜圖。液相色譜質(zhì)譜用儀主要用于非揮發(fā)性化合物、極性化合物、熱不穩(wěn)定化合物和大相對分子質(zhì)量化合物（包括蛋白、多肽、多聚物等）等的分析測定。在土壤科學研究中主要應用于農(nóng)藥獸藥的殘留物、環(huán)境污染物及化感物質(zhì)等有機物的定性和定量分析。
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