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MaxUpII DNA Library Prep Kit for Illumina
MaxUpII DNA Library Prep Kit for Illumina®
——建庫(kù)試劑盒中的王
1、產(chǎn)品概述
Hieff NGS® MaxUpII DNA Library Prep Kit for Illumina®，可用于NGS測(cè)序中DNA樣本文庫(kù)構(gòu)建，采用高質(zhì)量的酶學(xué)組成，改進(jìn)型接頭連接技術(shù)，以及具有強(qiáng)擴(kuò)增效率的高保真酶，顯著提高文庫(kù)轉(zhuǎn)化率與擴(kuò)增效率，Input DNA范圍為500 pg-1 μg，適用包含cfDNA、FFPE在內(nèi)的所有樣本進(jìn)行文庫(kù)構(gòu)建，產(chǎn)品可以應(yīng)用于全基因組測(cè)序、靶向捕獲測(cè)序、Chip-seq等測(cè)序方法中。
2、產(chǎn)品特點(diǎn)
≥ 適用樣本類型廣：包含cfDNA、FFPE在內(nèi)的所有樣本均能獲得優(yōu)異文庫(kù)和測(cè)序質(zhì)量
≥ 應(yīng)用范圍廣：產(chǎn)品可應(yīng)用于全基因組測(cè)序、靶向捕獲測(cè)序、Chip-seq等等
≥ 高品質(zhì)酶學(xué)組成：業(yè)界領(lǐng)現(xiàn)的接頭連接效率，高達(dá)60%、超高保真性和*擴(kuò)增效率
≥ 品質(zhì)穩(wěn)定：嚴(yán)格的批次性能與穩(wěn)定性質(zhì)控
3、操作流程
精簡(jiǎn)的操作步驟，2-2.5小時(shí)快速建庫(kù)
4、產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)
1）文庫(kù)轉(zhuǎn)化效率高達(dá)60%
圖1 Agilent 2100 檢測(cè)350bp平末端DNA//片段單端和雙端連接產(chǎn)物峰
0：350bpDNA//片段峰、1：?jiǎn)味私宇^連接產(chǎn)物峰、2：雙端接頭連接產(chǎn)物峰。測(cè)試基于各公司的標(biāo)準(zhǔn) protocol進(jìn)行。
圖2 接頭連接效率百分比（%）。
對(duì)圖1峰面積進(jìn)行積分后的定量結(jié)果顯示Hieff NGS™ MaxUp II Kit 的雙端連接效率可達(dá)60%
2）擴(kuò)增效率高，兼容不同GC含量樣本
使用具有強(qiáng)擴(kuò)增效率的Super CanaceTM High-Fidelity Mix用于文庫(kù)擴(kuò)增，效率更高。
| 產(chǎn)品名稱 | GC 38% (ng) | GC 50% (ng) | GC 70% (ng) |
| Super Canace® High-Fidelity Mix | 25.6 | 18 | 17.1 |
| K*-HiFi mix | 15.8 | 16.7 | 21.1 |
1 ng GC含量分別為38%、50%、70%的400 bp DNA//片段為起始樣本，12 cycles擴(kuò)增。
3）文庫(kù)產(chǎn)量高
| 樣本 | 100 ng FFPE | 5 ng cfDNA | ||
| 7 cycles (ng) | 10 cycles (ng) | 9 cycles (ng) | 12 cycles (ng) | |
| MaxUP II | 400 | 2000 | 120 | 1200 |
| K* 品牌 | 150 | 1100 | 100 | 1080 |
以FFPE和cfDNA為起始樣本建庫(kù)，相對(duì)同類型試劑盒品牌 K*，在相同擴(kuò)增循環(huán)數(shù)下，獲得更多文庫(kù)產(chǎn)量。
4）數(shù)據(jù)無(wú)偏好性
在不同GC含量樣本中，使用Hieff NGS™ MaxUP II Kit均能獲得堿基質(zhì)量好且覆蓋度均一的測(cè)序數(shù)據(jù)。
| 樣本 | Mapped Reads (%) | Coverage (%) | ||||
| Average | 5× | 10× | 15× | 20× | ||
| 蠟狀芽孢桿菌（GC 34%） | 93.8 | 99.644 | 99.643 | 99.641 | 99.639 | 99.638 |
| 大腸桿菌（GC 51%） | 92.7 | 93.057 | 92.782 | 92.687 | 92.625 | 92.579 |
| 嗜鹽桿菌（GC 65%） | 94.2 | 99.598 | 99.028 | 98.391 | 97.885 | 97.419 |
圖3不同GC含量樣本測(cè)序偏好性圖譜
5、客戶反饋
5.1建庫(kù)產(chǎn)量高
1）杭州某生物公司邁*
洗相同條件下對(duì)比實(shí)驗(yàn)，脫體積32 μL，對(duì)比文庫(kù)產(chǎn)量，翊圣MaxUpII文庫(kù)產(chǎn)量比K*文庫(kù)產(chǎn)量更高
| MaxUp II | K* Hyper | |||||
| Input DNA | 50 ng | 25 ng | 10 ng | 50 ng | 25 ng | 10 ng |
| 循環(huán)數(shù) （cycles） | 7 | 9 | 13 | 7 | 9 | 13 |
| 文庫(kù)濃度 (ng/µL) | 15.4 | 23.8 | 58.2 | 8.76 | 13.5 | 52.4 |
圖4 對(duì)比文庫(kù)質(zhì)量峰圖，翊圣MaxUpII文庫(kù)主峰單一，大小與目的片段的大小一致，K*品牌建庫(kù)試劑盒出現(xiàn)多峰的現(xiàn)象
2）北京某基因技術(shù)有限公司中*
gDNA樣本（NA12878），平行實(shí)驗(yàn)中，翊圣建庫(kù)試劑盒MaxUpII與K*品牌對(duì)比，文庫(kù)質(zhì)量和產(chǎn)量基本一致，在捕獲建庫(kù)中能兼容不同的捕獲試劑！
5.2文庫(kù)對(duì)應(yīng)測(cè)序更為準(zhǔn)確
1）上海某醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)所渥*
圖5 K*品牌與翊圣MaxUpII建庫(kù)試劑盒測(cè)序數(shù)據(jù)對(duì)比柱狀圖
訂購(gòu)信息
| 產(chǎn)品 | 貨號(hào) | 規(guī)格 | 價(jià)格（元） |
| Hieff NGSTM MaxUP II DNA Library Prep Kit for Illumina® | 12200ES08/24/96 | 8/24/96libraries | 2456/6486/23567 |
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