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DS在多肽藥物領域的解決方案 基于胰島素肽的設計和篩選

來源:北京創(chuàng)騰科技有限公司   2019年10月29日 15:49  

實施效果

來源:計算模擬平臺

通過 Discovery Studio 軟件設計指導了變構肽配體(Altered peptide ligands,APLs)用于治療I型糖尿病。

 

方案詳情

case3_fig1.png

 

I型糖尿病在人類和非肥胖糖尿病小鼠中均是一種自身免疫系統(tǒng)缺陷的疾病,有研究表明其主要由于 CD8+ T 細胞介導的β細胞損傷,使之不能正常分泌胰島素。變構肽配體(Altered peptide ligands,APLs)可以有效抑制抗原-特異性T細胞失效,凋亡或轉移。因此開發(fā)有效的 APLs 用于I型糖尿病的治療很有必要。本文通過分子模擬技術對變構肽配體進行了設計和優(yōu)化。

文章作者基于已知的變構肽配體與受體的復合物結構,首先通過 Discovery Studio突變了復合物結構中的關鍵氨基酸殘基,確定了變構肽的關鍵改造位置,并設計了8個變構肽配體。然后結合DS_Loop refinement 和分子動力學程序 Standard Dynamics Cascade 對8個變構肽配體的復合物進行了結構模擬和優(yōu)化,并基于MM-PBSA 方法預測了它們與受體之間的結合能,根據(jù)預測結果(表1)選擇其中四個肽進行了合成和生物活性測試,其中變構肽 H6F 活性較好。針對 H6F 進行了后續(xù)的試驗研究,試驗結果表明變構肽配體 H6F 有希望成為一個治療I類糖尿病的藥物。

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