熒光定量技術(shù)服務(wù)
一、項(xiàng)目簡介
Real Time PCR法是實(shí)時監(jiān)測解析PCR擴(kuò)增量的方法。因其無需電泳,大大減低了實(shí)驗(yàn)污染的機(jī)率,且具有快速、可對檢測靶基因定量而倍受青睞。實(shí)時熒光定量PCR避免了傳統(tǒng)PCR以終產(chǎn)物檢測定量產(chǎn)生的偏差,提高實(shí)驗(yàn)的重復(fù)性。該技術(shù)已被廣泛用于檢測細(xì)胞、細(xì)菌等mRNA表達(dá)量的變化;比較不同組織的mRNA表達(dá)差異;驗(yàn)證基因芯片,siRNA干擾的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。我們?yōu)槟峁┤讓?shí)時熒光定量PCR技術(shù)及解析服務(wù):您只需提供組織或細(xì)胞標(biāo)本,我們?yōu)槟瓿蒖NA抽提,cDNA制備,實(shí)時定量PCR,標(biāo)準(zhǔn)曲線制備及數(shù)據(jù)分析的所有步驟。
1、TaqMan探針方法
該技術(shù)以美國 ABI 公司為代表。 PCR 擴(kuò)增時,在加入一對引物的同時加入一個特異性的熒光探針。該探針為一直線型的寡核苷酸片斷,兩端分別標(biāo)記一個熒光報(bào)告基團(tuán)和一個熒光淬滅基團(tuán),在TaqMan探針法的定量PCR反應(yīng)體系中,包括一對PCR引物和一條探針。探針只與模板特異性地結(jié)合,其結(jié)合位點(diǎn)在兩條引物之間。探針的5′端標(biāo)記有報(bào)告基團(tuán)(Reporter, R),如FAM、VIC等,3′端標(biāo)記有熒光淬滅基團(tuán)(Quencher, Q),如TAMRA等。當(dāng)探針完整的時候,報(bào)告基團(tuán)所發(fā)射的熒光能量被淬滅基團(tuán)吸收,儀器檢測不到信號。隨著PCR的進(jìn)行,Taq酶在鏈延伸過程中遇到與模板結(jié)合的探針,其3′→5′外切核酸酶活性就會將探針切斷,報(bào)告基團(tuán)遠(yuǎn)離淬滅基團(tuán),其能量不能被吸收,即產(chǎn)生熒光信號(圖4)。所以,每經(jīng)過一個PCR循環(huán),熒光信號也和目的片段一樣,有一個同步指數(shù)增長的過程。信號的強(qiáng)度就代表了模板DNA的拷貝數(shù)。
2、SYBR Green I嵌合熒光法
SYBR Green I熒光染料技術(shù)原理:SYBR Green I是一種只與DNA雙鏈結(jié)合的熒光染料(圖2)。當(dāng)它與DNA雙鏈結(jié)合時,發(fā)出熒光;從DNA雙鏈上釋放出來時,熒光信號急劇減弱。因此,在一個體系內(nèi),其信號強(qiáng)度代表了雙鏈DNA分子的數(shù)量。SYBR Green熒光染料法定量PCR的基本過程是:1、開始反應(yīng),當(dāng)SYBR Green染料與DNA雙鏈結(jié)合時發(fā)出熒光。2、DNA變性時,SYBR Green染料釋放出來,熒光急劇減少。
3、在聚合延伸過程中,引物退火并形成PCR產(chǎn)物。
4、聚合完成后,SYBR Green染料與雙鏈產(chǎn)物結(jié)合,定量PCR系統(tǒng)檢測到熒光的凈增量加大。
SYBR Green I熒光染料能與所有的DNA雙鏈相結(jié)合,對DNA模板沒有選擇性,所以特異性不如TaqMan探針。要想用熒光染料法得到比較好的定量結(jié)果,對PCR引物設(shè)計(jì)的特異性和PCR反應(yīng)的質(zhì)量要求就比較高。在此前提下,本法是一種成本低廉的選擇。
二、服務(wù)項(xiàng)目
1、定性分析
PCR反應(yīng)結(jié)束后的PCR產(chǎn)物無需電泳檢測,可以通過Real Time PCR方法,簡單快速地對目的基因進(jìn)行高特異性、高靈敏度的檢測,同時閉管操作的實(shí)時檢測可以有效防止反應(yīng)產(chǎn)物的污染。本技術(shù)可以廣泛應(yīng)用于病毒、病原菌等致病微生物的檢測以及各種生物品種的鑒定等。
2、定量
定量首先必須構(gòu)建與檢測樣品目的基因具有相同序列的標(biāo)準(zhǔn)品。使用已知濃度的標(biāo)準(zhǔn)品制作5 個點(diǎn)以上的標(biāo)準(zhǔn)曲線后,可以使用標(biāo)準(zhǔn)曲線對未知濃度的檢測樣品進(jìn)行量(起始拷貝數(shù))分析。
3、相對定量(mRNA表達(dá)量分析)
基因表達(dá)的研究一般采用相對定量的方法。相對定量法必須對樣品的目的基因和參比基因內(nèi)標(biāo)同時分別進(jìn)行定量,然后求出對于參比基因的目的基因的相對量。通過對樣品間的目的基因的相對量進(jìn)行比較,可以對不同樣品間的mRNA進(jìn)行表達(dá)量分析。參比基因通常選用β-actin。通過同時對參比基因的實(shí)時檢測,可以對樣品之間由于起始細(xì)胞數(shù)不同、或RNA提取效率的不同等造成的RNA量誤差進(jìn)行校正,達(dá)到在嚴(yán)格意義上對樣品之間的mRNA表達(dá)量進(jìn)行分析之目的。
三、服務(wù)流程
1、客戶以或郵件形式告知公司要進(jìn)行的實(shí)驗(yàn)基因名稱和標(biāo)本數(shù)目;
2、公司派專業(yè)技術(shù)人員與您洽談實(shí)驗(yàn)費(fèi)用和熒光定量探針設(shè)計(jì)方案(序列和設(shè)計(jì)有公司負(fù)責(zé));
3、簽訂實(shí)驗(yàn)技術(shù)服務(wù)合同,交費(fèi)用的50%作為訂金(若實(shí)驗(yàn)沒有結(jié)果或結(jié)果未達(dá)到客戶要求,訂金不退);
4、公司合成熒光定量探針、派相關(guān)人員取回實(shí)驗(yàn)標(biāo)本;
5、進(jìn)行RNA抽提、鑒定、cDNA合成實(shí)驗(yàn);
6、進(jìn)行實(shí)時熒光定量PCR實(shí)驗(yàn)(每個標(biāo)本的每個基因均進(jìn)行3倍平行孔實(shí)驗(yàn),保證獲得準(zhǔn)確、*、客觀的樣品基因擴(kuò)增數(shù)據(jù));
7、通過統(tǒng)計(jì)分析軟件計(jì)算目的基因的mRNA表達(dá)數(shù)據(jù);
8、提供完整的實(shí)驗(yàn)報(bào)告(實(shí)時熒光擴(kuò)增曲線圖、分析數(shù)據(jù)、實(shí)驗(yàn)步驟、試劑儀器);
9、客戶交齊全額費(fèi)用。
四、服務(wù)要求
1、請認(rèn)真填寫Real Time PCR檢側(cè)技術(shù)服務(wù)委托單;
2、請您提供新鮮的且盡量多的材料(各種材料的 RNA 提取量請參照“總 RNA 的提取”),或直接提供純化好的總RNA(大于5μg/樣品);(各種材料的 DNA 提取量請參照“ D NA 的提取”),或直接提供純化好的DNA(大于5μg/樣品) ;
3、如果提供的材料為細(xì)胞或組織,應(yīng)保證材料新鮮:
細(xì)胞樣品:細(xì)胞培養(yǎng)至少達(dá)105以上,培養(yǎng)后細(xì)胞請勿做任何處理。
組織樣品:離體后30分鐘內(nèi)入液氮保存,動物組織為5mg以上。
血液樣品:分離白細(xì)胞后,-70℃保存。
4、請通過 提供已知的全長基因序列;
5、請?zhí)峁┍M可能詳細(xì)的背景資料: DNA/ RNA 來源、豐度等。
五、 配套服務(wù)項(xiàng)目:
1、引物(探針)設(shè)計(jì)和篩選:
根據(jù)您提供的基因序列,我們?yōu)槟峁┮铮ㄌ结槪┑脑O(shè)計(jì)和篩選服務(wù)。
2、基因組DNA提取組織:
新鮮樣品或-70℃保存樣品,避免反復(fù)凍融提供樣品量500mg以上,剩下歸還(無致病性,除脂肪組織、粘液狀組織以外)。
細(xì)胞:新鮮樣品或-70℃保存樣品,避免反復(fù)凍融提供樣品量105以上。
植物: 提供樣品量500mg以上(新鮮葉片,或4℃保存一周內(nèi)的葉片),剩下歸還(新鮮組織,植物干粉得率較低)。
原核生物:提供樣品量108CFU或者0.5個麥?zhǔn)蠁挝灰陨希ǚ侵虏⌒?,提供菌株和培養(yǎng)基信息;致病性,提供滅活菌液等)。
3、基因組RNA提取
組織:新鮮樣品或-70℃保存樣品,避免反復(fù)凍融提供樣品量500mg以上,剩下歸還(無致病性,除脂肪組織、粘液狀組織以外)。
細(xì)胞:新鮮樣品或-70℃保存樣品,避免反復(fù)凍融提供樣品量105以上。
植物:提供樣品量500mg以上(要新鮮葉片,或4℃保存一周內(nèi)的葉片),剩下歸還。
原核生物:提供樣品量108CFU或者0.5個麥?zhǔn)蠁挝灰陨稀?
4、質(zhì)粒構(gòu)建:
試驗(yàn)包括:PCR產(chǎn)物回收、連接轉(zhuǎn)化、克隆鑒定和質(zhì)粒提取。
5、RT-PCR反應(yīng)
請您按要求提供試驗(yàn)樣本(詳見基因組DNA提取、基因組RNA提取和反轉(zhuǎn)錄樣品要求);或提供純化好的DNA樣品5μg。
詳情請咨詢:
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