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只會半定量分析?來看WB的靈活運用吧

來源:愛必信(上海)生物科技有限公司   2020年04月09日 09:24  

WB實驗是我們平時經(jīng)常接觸到的實驗類型,也是經(jīng)典的免疫學實驗,每年寫WB實驗技巧的文章,真是讓人看花了眼,如果你厭倦了老生常談的實驗技巧,不如來看看我們今天的拓展,WB在半定量分析之外的妙用吧。

 

一、目標蛋白構象結合功能分析

WB 用于構象分析,主要基于其不同構象形式時分子量所發(fā)生的變化,比如不同的寡聚、翻譯后修飾、配體結合等情況。還原和非還原型電泳分析鏈間二硫鍵,并判斷蛋白聚合情況;

抗體表位分析法初步判斷蛋白空間結構;利用(N - 端或 C - 端)抗體研究蛋白異構體及翻譯后酶切修飾;更重要的是,WB 等方法獲得的是蛋白在寡聚、結合配體、底物、信號標簽等生理條件下,其分子量的動態(tài)變化,從而將蛋白結構研究與功能研究有機結合。

泛素化-蛋白酶體系統(tǒng)對于錯誤蛋白降解具有重要意義。上圖顯示 Nrf2 蛋白在泛素連接酶作用時間延長后,泛素化程度逐漸增加。若將各時間點的 Nrf2 蛋白結構解析,即可將該蛋白的結構研究與功能研究相結合。在 Virology 的這篇文獻中,作者發(fā)現(xiàn)蛋白酶體抑制劑 MG132 和 lactacystin 可顯著降低豬 II 型圓環(huán)病毒(PCV2)早期感染的滴度,并通過對泛素基因的沉默實驗,發(fā)現(xiàn)其也顯著降低 PCV2 滴度,由此推斷泛素 - 蛋白酶體系統(tǒng)是 PCV2 的早期復制所必須的。

 

二、磷酸化信號分析

磷酸化是細胞信號系統(tǒng)的重要調節(jié)方式,特異的磷酸化抗體可以用于:分析信號分子磷酸化水平,從而與其功能研究建立聯(lián)系;分析不同磷酸化位點對于信號分子功能的影響,比如 p53 總磷酸化水平與不同位點磷酸化水平對轉錄的調控,以及與癌癥發(fā)生發(fā)展之間的聯(lián)系。


Cai 等在JBC上發(fā)表的文章,揭示了微小RNA在腫瘤發(fā)生中的調節(jié)作用。研究發(fā)現(xiàn)微小RNA miR-17/20a 靶向抑制 p53 的核心激酶DAPK3(死亡相關蛋白激酶 3)的表達,去除這些微小 RNA 將導致依賴于 p53 的微小RNA轉錄抑制被去除,從而形成一個正反饋環(huán),促進腫瘤形成,它們被稱為原癌微小 RNA(oncomiRs)。C圖清楚顯示了當對 Hela 細胞轉入 miR-17、miR-20a 或 miR-17/20a 拮抗劑后,DAPK3 蛋白表達增加,雙鏈 DNA 不穩(wěn)定性的標志物 ATM(Ser-1981)、p53BP1(Ser-25/29)蛋白絲氨酸磷酸化程度增高,而各自總蛋白水平并沒有變化。D 圖進一步確認了這些磷酸化水平升高是由 DAPK3 表達量升高引起的。p53 磷酸化水平升高將導致其抑制原癌微小 RNA 轉錄的水平下降,進一步提高 DAPK3 激酶的表達。該研究補充了原有的通過 E2F 家族蛋白激活 miR-17/20a 的負反饋調節(jié)通路。

 

愛必信4月大促開啟!經(jīng)典產(chǎn)品6折團購,其中有兩款經(jīng)典的WB產(chǎn)品,ECL發(fā)光液(abs920)和marker(abs924、abs922

  貨號  品名  規(guī)格  *
   abs50001   Annexin V-FITC apoptosis assay kit   50T/100t   630/1102.80
   abs920   ECL化學發(fā)光檢測試劑盒   2*250ml   693
   abs922   預染蛋白marker, 10-180kDa  500ul   492
   abs924   預染蛋白marker, 10-180kDa  2×250ul   372
   abs923   預染蛋白marker  500ul/5*500ul   600/2400


※ECL發(fā)光液是持久型,有效延遲淬滅時間。愛必信彩虹marker,經(jīng)過與多種品牌對比驗證,結果如圖!

愛必信特色產(chǎn)品線全部現(xiàn)貨):二抗、標簽抗體、對照抗體;WB相關:ECL發(fā)光液、預染marker、預制膠;IHC相關:二抗試劑盒、組化筆;IP/CoIP試劑盒;細胞因子、信號通路調節(jié)劑;血清、BSA、蛋白酶K、CTB、TTX、CEE;凋亡試劑盒、呼吸爆發(fā)試劑盒;動植物提取物,定制服務(抗體/多肽/蛋白)...

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