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雙判定標(biāo)準(zhǔn)判定qPCR擴(kuò)增特異性,提升Ct值真實(shí)性

來源:翌圣生物科技(上海)股份有限公司   2020年04月09日 14:46  

 

qPCR實(shí)驗(yàn)易做,但數(shù)據(jù)分析并非想象中的那么容易!數(shù)據(jù)分析的好與壞,極大程度上依賴于qPCR原始結(jié)果的質(zhì)量。

qPCR結(jié)果的評(píng)價(jià)指標(biāo)


•溶解曲線,是qPCR結(jié)果判定的第—要素。它的作用是判定目的基因是否得到擴(kuò)增。理論上,當(dāng)反應(yīng)體系中僅是目標(biāo)基因的擴(kuò)增,才是有效擴(kuò)增。
•標(biāo)準(zhǔn)曲線,是qPCR結(jié)果判定的金標(biāo)準(zhǔn)。(在溶解曲線判定為特異性擴(kuò)增后)它的作用是測(cè)定引物的擴(kuò)增效率及試劑的檢測(cè)上下限。根據(jù)文章發(fā)表對(duì)于qPCR數(shù)據(jù)的要求,擴(kuò)增效率應(yīng)在90-110%。
•擴(kuò)增曲線,是直接生成qPCR定量的數(shù)據(jù),即Ct值。從試劑對(duì)比角度而言,Ct值大小常被用于判定試劑擴(kuò)增效率的高低。

產(chǎn)品描述


Hieff Unicon® Power qPCR SYBR Green Master Mix,這是一款旨在解決諸多qPCR實(shí)驗(yàn)常見疑難問題的qPCR試劑:
•它減少了大量引物驗(yàn)證的預(yù)實(shí)驗(yàn)工作,是一款具備強(qiáng)引物兼容性的Mix,
•它明確了qPCR溶解曲線峰型的標(biāo)準(zhǔn)——“單峰的形狀”,對(duì)于“什么溶解曲線是好的溶解曲線”的解讀具有參考意義,
•它讓時(shí)間不再碎片化,1次體系配制,24 h時(shí)間自由支配

產(chǎn)品特點(diǎn)


□引物兼容性強(qiáng):針對(duì)遵循qPCR引物設(shè)計(jì)原則設(shè)計(jì)的引物,使用Hieff Unicon® Power 引物使用率可達(dá)97%;
□模板加入量靈活:可檢測(cè)10-107個(gè)拷貝個(gè)數(shù)的基因片段;
□特異性高:標(biāo)準(zhǔn)溶解曲線峰型,有效避免“胖”峰、“多”峰的出現(xiàn);
□穩(wěn)定性強(qiáng):產(chǎn)品經(jīng)50次反復(fù)凍融驗(yàn)證,擴(kuò)增性能無變化;
□操作靈活:配制好的qPCR反應(yīng)液4℃保存24 h,擴(kuò)增性能無變化;
□擴(kuò)增時(shí)間短:每個(gè)擴(kuò)增循環(huán)中,退火、延伸一步完成,用時(shí)15 sec。

產(chǎn)品性能展示


1. 超高特異性,簡(jiǎn)化了qPCR實(shí)驗(yàn)的引物設(shè)計(jì)


圖1. Hieff® Unicon Power預(yù)混液實(shí)現(xiàn)了引物的高特異性擴(kuò)增  以293T細(xì)胞cDNA為模板,利用Prime5軟件設(shè)計(jì)200bp擴(kuò)增長(zhǎng)度的片段(GC含量:30%-70%)的引物共1000對(duì),隨機(jī)挑選88對(duì),使用Hieff Unicon® Power預(yù)混液測(cè)定引物的擴(kuò)增特異性。通過溶解曲線分析,88個(gè)檢測(cè)片段中有86個(gè)(97.7%)目標(biāo)片段有效擴(kuò)增,說明Hieff Unicon® Power預(yù)混液引物兼容性強(qiáng),具備高特異性擴(kuò)增、高檢出率的特點(diǎn)。

2. 超高特異性,保證了Ct值的真實(shí)性

圖2. Hieff® Unicon Power預(yù)混液擴(kuò)增高度特異,Ct值結(jié)果可信度高  以1 ng人gDNA為模板,使用不同品牌預(yù)混液按照標(biāo)準(zhǔn)擴(kuò)增程序,擴(kuò)增5個(gè)目的基因片段,經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳分析擴(kuò)增產(chǎn)物情況。結(jié)果顯示Hieff Unicon® Power預(yù)混液針對(duì)不同靶標(biāo)基因均可以高特異性擴(kuò)增,得到可信的靶標(biāo)片段Ct值。

3. 檢測(cè)范圍寬廣,模板添加不再糾結(jié)
    
圖3. Hieff® Unicon Power預(yù)混液可有效檢測(cè)6個(gè)數(shù)量級(jí)范圍的模板量  以質(zhì)粒DNA為模板,10倍梯度稀釋(107-101 拷貝/μl),擴(kuò)增IL23R基因。結(jié)果顯示Hieff Unicon® Power預(yù)混液擴(kuò)增特異,線性相關(guān)性高,可在寬廣的定量區(qū)域內(nèi)獲得良好的線性關(guān)系。

4. 良好的穩(wěn)定性,讓體系配制更加靈活:
 

凍融次數(shù)0次10次30次50次
Ct均值22.9722.8722.9922.84
△Ct--0.090.02-0.12

 

4℃保存時(shí)間0 h24 h48 h72 h
Ct均值22.8322.8923.0523.16
△Ct-0.060.220.33


圖4. Hieff® Unicon Power預(yù)混液及其配制體系穩(wěn)定性俱佳  以1 ng 人gDNA為模板,使用Hieff Unicon® Power預(yù)混液在不同凍融次數(shù)或體系配制后4℃放置不同時(shí)間條件下,檢測(cè)TFRC基因擴(kuò)增情況。結(jié)果顯示Hieff Unicon® Power預(yù)混液經(jīng)50次反復(fù)凍融或體系配制后4℃保存24h,擴(kuò)增性能無變化(溶解曲線圖數(shù)據(jù)未做展示)。

5. 兼容快速程序與標(biāo)準(zhǔn)程序:
 

 30%GC-1號(hào)30%GC-2號(hào)50%GC-1號(hào)50%GC-2號(hào)70%GC-1號(hào)70%GC-2號(hào)
標(biāo)準(zhǔn)程序23.422.7923.7923.5223.2323.60
快速程序23.2923.0423.823.5723.4823.52
△Ct0.110.250.010.050.150.08


標(biāo)準(zhǔn)程序                                                快速程序

95℃         5 min                                       95℃         30 sec   
95℃         10 sec                                     95℃         10 sec
60℃         30 sec     40 Cycles                  60℃         15 sec    40 Cycles

圖6. Hieff® Unicon Power預(yù)混液讓擴(kuò)增時(shí)間大大縮短 以1 ng人gDNA為模板,擴(kuò)增不同GC基因片段(30-70%),比較Hieff Unicon® Power預(yù)混液在標(biāo)準(zhǔn)程序和快速程序下的擴(kuò)增效果。結(jié)果顯示Hieff Unicon® Power預(yù)混液可兼容快速擴(kuò)增程序和標(biāo)準(zhǔn)擴(kuò)增程序,使用快速程序可縮短擴(kuò)增時(shí)間。

常見問題


Q:如何選擇產(chǎn)品?
A:

產(chǎn)品名稱貨號(hào)特異性擴(kuò)增效率靈敏度性價(jià)比
Hieff UNICON® Power qPCR SYBR Green Master Mix11195ES★★★★★★★★★☆★★★☆☆★★★☆☆
Hieff UNICON® qPCR SYBR Green Master Mix 11198ES★★★★☆★★★★☆★★★★☆★★★★☆
Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix11201ES★★★★☆★★★★★★★★☆☆★★★★★


Q:Hieff UNICON® Power qPCR SYBR Green Master Mix產(chǎn)品可應(yīng)用于哪些實(shí)驗(yàn)?
A:可用于對(duì)特異性要求比較高或較難實(shí)現(xiàn)特異性擴(kuò)增的基因片段。這款產(chǎn)品極大程度上避免了引物二聚體、非特異性擴(kuò)增的出現(xiàn),特別適合于引物中有單個(gè)堿基不同的擴(kuò)增。

Q:建議的模板加入量?
A:20 μL反應(yīng)體系,未經(jīng)稀釋的cDNA加入量建議不超過2 μL。

Q:試劑如何儲(chǔ)存及保質(zhì)期?
A:建議-20℃保存,有效期1年。

訂購(gòu)信息

產(chǎn)品名稱貨號(hào)規(guī)格價(jià)格(元)*(元)
Hieff UNICON® Power qPCR SYBR Green Master Mix (抗體法,No Rox)11195ES085ml1653.00663.00
Hieff UNICON® Power qPCR SYBR Green Master Mix (抗體法,Low Rox)11196ES085ml1653.00663.00
Hieff UNICON® Power qPCR SYBR Green Master Mix (抗體法,High Rox)11197ES085ml1653.00663.00


相關(guān)產(chǎn)品

 

產(chǎn)品名稱貨號(hào)規(guī)格價(jià)格(元)*(元)
Hifair® II 1st Strand cDNA Synthesis SuperMix for qPCR(gDNA digester plus)11123ES60100T955.00 
Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix (No Rox )11201ES085 ml740.00498.00
Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix (Low Rox Plus)11202ES085 ml740.00498.00
Hieff® qPCR SYBR® Green Master Mix (High Rox Plus)11203ES085 ml740.00498.00

HB190306

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