酶免疫試驗(yàn)之所以能成為臨床免疫檢驗(yàn)中的主導(dǎo)技術(shù)，是與它的方法上的特異性和靈敏性、操作上的簡(jiǎn)便性以及試劑的穩(wěn)定性分不開(kāi)的，還有很重要的一點(diǎn)是，其對(duì)環(huán)境沒(méi)有污染威脅。
盡管如此，作為一項(xiàng)免疫檢驗(yàn)技術(shù)，酶免疫試驗(yàn)還是有其局限性的，不但所檢測(cè)的生物學(xué)體液樣本如血清中有可能存在各種干擾實(shí)驗(yàn)的因素，而且在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中，影響結(jié)果的因素也很多，尤其是進(jìn)行手工的ELISA測(cè)定時(shí)。

此外，在定性ELISA測(cè)定中，陽(yáng)性判定值（CUT-OFF）的建立，是在一定的統(tǒng)計(jì)學(xué)基礎(chǔ)上的，相對(duì)于某個(gè)具體的受檢者來(lái)說(shuō)，其有可能并不具備正確性。例如，使用ELISA方法檢測(cè)抗HCV及抗HIV或HBsAg，有時(shí)候，檢測(cè)所得的陽(yáng)性結(jié)也許并不是真正的陽(yáng)性，而需要使用其他方法如重組免疫印跡（recombinantimmunoblotas—say，RIBA）、蛋白印跡（Westernbl。t，WB）或中和試驗(yàn)來(lái)確認(rèn)，才能報(bào)告陽(yáng)性。這里抗HCV和抗HIV的檢測(cè)均使用病毒部分的基因工程抗原，其他一些病毒如流感病毒、腮腺炎病毒和水痘病毒等感染人體后，亦或一些自身抗體，也有可能會(huì)導(dǎo)致假陽(yáng)性反應(yīng)。

HBsAg的測(cè)定主要是弱陽(yáng)性的問(wèn)題，這與ELISA測(cè)定的“灰區(qū)”有關(guān)系，處于cut-off值周?chē)嗉?ldquo;灰區(qū)”的結(jié)果的可靠性通常較差，陽(yáng)性當(dāng)然需要確認(rèn)，陰性卻也未必是真，這一點(diǎn)在血站篩檢獻(xiàn)血員血液時(shí)是非常重要的，必須引起注意，并采取適當(dāng)?shù)拇胧?，防止此?lèi)嚴(yán)重影響人們健康的傳染性疾病經(jīng)輸血傳播，本書(shū)后面的有關(guān)章還會(huì)對(duì)此問(wèn)題做詳細(xì)論述。此外，免疫測(cè)定的基礎(chǔ)是抗原抗體的特異反應(yīng)，因此，如檢測(cè)抗原，除了要求抗體（單抗或多抗）是特異的外，還要求待測(cè)抗原上必須存在有能與所用抗體結(jié)合的抗原決定簇，如果因?yàn)榛蛲蛔儗?dǎo)致某些位點(diǎn)的不表達(dá)，或者結(jié)合位點(diǎn)因?yàn)槟承┰虮环忾]或阻斷，都會(huì)影響抗體與抗原的結(jié)合，造成假陰性結(jié)果。

如檢測(cè)抗體，則要求所用包被抗原應(yīng)盡可能包含所有的特異抗原決定簇，同時(shí)又盡可能不含有非特異的成分，這一點(diǎn)往往由于技術(shù)水平的限制而難以*做到，因此，從某種意義上來(lái)說(shuō)，假陽(yáng)性假陰性是不能*避免的，盡管通過(guò)努力，可以將其降至很低的程度。這也是建立臨床免疫檢驗(yàn)方法所努力的方向。