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WB專欄——好的樣本制備是實(shí)驗(yàn)成功的一半

來源:愛必信(上海)生物科技有限公司   2021年08月23日 14:59  

一、蛋白提取 

樣本制備是WB實(shí)驗(yàn)的第一步也是最重要的一步,它的操作雖然并不復(fù)雜,卻有很多需要注意的細(xì)節(jié)。

根據(jù)實(shí)驗(yàn)需要的目標(biāo)蛋白的不同,大致可以分為三種:總蛋白、膜蛋白和核蛋白。總蛋白提取顧名思義就是把組織或細(xì)胞內(nèi)所有的蛋白全都提取出來;膜蛋白、核蛋白提取簡單來說就是把細(xì)胞膜、細(xì)胞核上的蛋白質(zhì)提取出來。


提取流程概覽

不同部位的蛋白要能夠提取分離,需要用到不同的提取試劑,看起來十分麻煩,愛必信的蛋白抽提試劑盒(abs9346)提供了一種比較簡單、方便的從培養(yǎng)細(xì)胞或新鮮組織中抽提細(xì)胞核蛋白、細(xì)胞漿蛋白、細(xì)胞膜蛋白與細(xì)胞骨架蛋白的方法。約90分鐘就可以完成培養(yǎng)細(xì)胞的細(xì)胞漿蛋白、細(xì)胞核蛋白、細(xì)胞膜蛋白與細(xì)胞骨架蛋白的分離。

 

貨號名稱組份
abs9346-50T蛋白抽提試劑盒胞漿蛋白提取液60mL 
胞核蛋白提取液10mL
膜蛋白提取液6mL 
結(jié)構(gòu)蛋白提取液6mL 
磷酸酶抑制劑II(50×)1mL 
PMSF(100×)

 

二、常見問題&解決策略


Q1 蛋白信號弱甚至無信號

在應(yīng)用裂解液進(jìn)行裂解的時候,除了釋放出目標(biāo)蛋白,也同時釋放出一些酶,這些酶可能會降解我們的目標(biāo)蛋白,所以需要對這部分酶進(jìn)行降解。

添加合適的蛋白酶抑制劑(abs9161)或磷酸酶抑制劑(abs9162),全程低溫操作,提前預(yù)冷PBS(abs961)、裂解液甚至槍頭等,從收集細(xì)胞開始一直到煮樣的全過程都應(yīng)該盡可能的保持在冰上操作。


蛋白酶/磷酸酶抑制劑推薦

 

貨號名稱推薦濃度規(guī)格
abs9161廣譜型蛋白酶抑制劑混合物 (不含EDTA,100×DMSO儲液)與樣品比例:1:1001ml
abs9162廣譜型磷酸酶抑制劑混合物 (100×儲液)(水)與樣品比例:1:1001ml 5*1ml

 

如果實(shí)驗(yàn)過程中需要這部分酶和一些小分子蛋白,在選擇裂解液的時候也要選擇沒有抑制劑的裂解液(abs9231和abs9239)


樣品中不含待測蛋白,有太多可能性,對蛋白定位不準(zhǔn)確,采用了錯誤的提取方法。

找準(zhǔn)蛋白定位,是否需要保留蛋白的天然結(jié)構(gòu),如果需要的話在選擇裂解液的時候要選擇不含去垢劑或者含少量Triton-X-100的裂解液(abs9230);不需要的話可能是RIPA試劑的濃度沒有調(diào)配好,或者選擇了不合適強(qiáng)度的RIPA。


常規(guī)裂解液對比表

 

產(chǎn)品貨號abs9229abs9231abs9228abs9230
產(chǎn)品名稱RIPA裂解液(強(qiáng))RIPA裂解液(強(qiáng))(不含抑制劑)RIPA裂解液(中)RIPA裂解液(弱)
有效成分1% Triton X-100,1%脫氧膽酸鈉,0.1% SDS1% Triton X-100,1%脫氧膽酸鈉,0.1% SDS1% NP-40,0.5%脫氧膽酸鈉,0.1% SDS1% NP-40,0.25%脫氧膽酸鈉
裂解強(qiáng)度強(qiáng)強(qiáng)溫和
對膜蛋白的提取優(yōu)秀優(yōu)秀良好一般
對胞漿蛋白的提取優(yōu)秀優(yōu)秀優(yōu)秀優(yōu)秀
對核蛋白的提取優(yōu)秀優(yōu)秀良好較好
胞漿磷酸化蛋白的提取優(yōu)秀優(yōu)秀優(yōu)秀優(yōu)秀
核轉(zhuǎn)錄因子的提取優(yōu)秀優(yōu)秀優(yōu)秀優(yōu)秀
蛋白酶抑制劑含有不含含有含有
磷酸酶抑制劑含有不含含有含有
主要用途WB,IPWB,IPWB,IPWB,IP,Co-IP

 

如果您覺得裂解液的選擇太麻煩,愛必信為您精心準(zhǔn)備了免疫印跡及免疫沉淀用裂解液(abs9116,abs9239{不含抑制劑}),這兩款產(chǎn)品的濃度是經(jīng)過大量的實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證調(diào)配出的最佳濃度,幾乎適用于90%的樣本制備,讓您的樣本制作更輕松。


裂解液推薦

 

貨號產(chǎn)品名稱強(qiáng)度蛋白定位規(guī)格
abs9116WB/IP細(xì)胞裂解液溫和全細(xì)胞/膜/核100ml
abs9239WB/IP細(xì)胞裂解液(無抑制劑)溫和全細(xì)胞/膜/核100ml

 

* 樣品蛋白含量低

* 去除高豐度蛋白,富集低豐度目的蛋白


Q2、蛋白成坨吸不上來,電泳條帶形狀不好

SDS LB不夠,樣品核酸、蛋白濃度過高

①再煮5min。常規(guī)煮樣時間3-5min,樣品過濃時就煮10min;
②如果10min煮樣后,仍然吸不起來,才適當(dāng)增加SDS LB,繼續(xù)煮;
③也可以對樣品進(jìn)行超聲。

煮樣不能過久,容易造成蛋白凝固,出現(xiàn)沉淀和水分離,只能丟棄。


Q3、出現(xiàn)多帶現(xiàn)象

* 細(xì)胞傳代次數(shù)過多,使其蛋白表達(dá)不同    
* 使用原始未傳代的細(xì)胞株,做對照實(shí)驗(yàn)
* 蛋白具有多種修飾形式,可能存在糖基化、磷酸化、羥基化
* 去磷酸化、去糖基化來驗(yàn)證翻譯后的修飾
* 蛋白樣本降解        
* 加抑制劑、冰上操作


蛋白樣品的制備是整個WB實(shí)驗(yàn)最初的一步也是最關(guān)鍵的一步,選對試劑找對方法至關(guān)重要,愛必信將不斷探索與開發(fā)優(yōu)良的試劑,為您的實(shí)驗(yàn)保駕護(hù)航。

Absin特色產(chǎn)品線(全部現(xiàn)貨):
WB相關(guān):ECL發(fā)光液、預(yù)染marker、預(yù)制膠;IHC相關(guān):二抗試劑盒、組化筆;IP/CoIP試劑盒;激動劑/抑制劑;血清、BSA、蛋白酶K、CTB、TTX、CEE;凋亡試劑盒;呼吸爆發(fā)試劑盒;ELISA試劑盒;重組蛋白;抗體: 二抗、標(biāo)簽抗體、對照抗體;定制服務(wù)(抗體/多肽/蛋白/標(biāo)記/檢測)...


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