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微生物快速鑒定質(zhì)譜技術(shù)作為強(qiáng)大的技術(shù)分析，在生物醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域已有較長(zhǎng)的應(yīng)用歷史。由于這些技術(shù)靈敏度高、特異性強(qiáng)、且能夠同時(shí)檢測(cè)多種化合物的特點(diǎn)，在西方國家的臨床診斷應(yīng)用研究工作中得到了十分快速的發(fā)展，為疾病的診斷、預(yù)后和治療以及人體健康的評(píng)估等做出了*而重要的貢獻(xiàn)。
微生物快速鑒定質(zhì)譜儀的性能包括分辨率、敏感度或探測(cè)極限和準(zhǔn)確性等，這些性能都與質(zhì)譜儀的類型、采用的離子化方法和掃描能力有關(guān)。不過沒有哪一個(gè)儀器能同時(shí)在上述所有方面都占優(yōu)，在選擇儀器的時(shí)候要根據(jù)實(shí)驗(yàn)需要進(jìn)行相應(yīng)的取舍。
質(zhì)譜儀通常使用的都是離子模式來鑒定蛋白質(zhì)的氨基酸序列。目前所有的MS/MS質(zhì)譜儀都具有該功能。不過其它特殊的質(zhì)譜儀也具有MS/MS功能。如果要發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)中的某個(gè)功能基團(tuán)則需要用到母離子掃描功能或者中性丟失掃描功能。
而這就要用到三重四級(jí)桿質(zhì)譜儀，或四級(jí)桿離子阱質(zhì)譜儀，比如復(fù)雜混合物里的蛋白質(zhì)磷酸化位點(diǎn)和糖基化位點(diǎn)就都可以用這種方法（在碰撞池中產(chǎn)生特殊的報(bào)告離子，通過它來進(jìn)行特殊的功能檢測(cè)）檢測(cè)出來。
在一個(gè)典型的質(zhì)譜檢測(cè)試驗(yàn)中，首先先用母離子掃描或中性丟失掃描都能發(fā)現(xiàn)目標(biāo)組分，然后再用傳統(tǒng)的MS/MS方法鑒定蛋白質(zhì)的氨基酸序列以及定位修飾位點(diǎn)。
已知的或未知的分析物都以高的敏感度和選擇性能被定量檢測(cè)出來。這種高選擇性得益于質(zhì)譜儀能夠?qū)Υ硪粋€(gè)肽段的一對(duì)母離子和片段裂解物離子進(jìn)行實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)。
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