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mRNA結(jié)構(gòu)的保護(hù)傘——5’Cap

來(lái)源:愛(ài)必信(上海)生物科技有限公司   2022年05月06日 12:56  

mRNA的5’端的帽子結(jié)構(gòu)可以提高其結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性、增強(qiáng)翻譯效率以及降低mRNA在細(xì)胞中的免疫原性1。作為mRNA的重要組成部分,帽子結(jié)構(gòu)可以稱得上是mRNA結(jié)構(gòu)的保護(hù)傘。那么,接下來(lái)我們就來(lái)學(xué)習(xí)一下帽子結(jié)構(gòu)。

  • 帽子結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)介

帽子結(jié)構(gòu)的化學(xué)本質(zhì)是mRNA轉(zhuǎn)錄過(guò)程中發(fā)生修飾所形成的位于mRNA 5'端的一個(gè)特殊結(jié)構(gòu),即m7GPPPN結(jié)構(gòu),又稱甲基鳥(niǎo)苷帽子。它是在RNA三磷酸酶,鳥(niǎo)苷酰轉(zhuǎn)移酶,mRNA(鳥(niǎo)嘌呤-N7)甲基轉(zhuǎn)移酶和mRNA(核苷-2’)甲基轉(zhuǎn)移酶共同催化作用下形成的。甲基化程度的不同可形成3種帽子:CAP 0型、CAP 1型和CAP 2型(如圖1)。

 
圖1.不同位置甲基化形成的帽結(jié)構(gòu)2


帽子結(jié)構(gòu)是mRNA翻譯起始的必要結(jié)構(gòu),為核糖體識(shí)別mRNA提供了信號(hào),協(xié)助核糖體與mRNA結(jié)合,使翻譯從AUG開(kāi)始。同時(shí)帽子結(jié)構(gòu)可增加mRNA的穩(wěn)定性,保護(hù)mRNA免遭5’→3’核酸外切酶的攻擊。除去天然帽結(jié)構(gòu),體外轉(zhuǎn)錄過(guò)程中也多用帽結(jié)構(gòu)類似物提高mRNA結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性,常見(jiàn)的有ARCA和Cap 1結(jié)構(gòu)類似物等。

  • 加帽方式及對(duì)比

酶法加帽:使用加帽酶進(jìn)行轉(zhuǎn)錄后加帽,最常使用的是牛痘病毒加帽酶(VCE),該反應(yīng)過(guò)程中加帽酶的異源二聚體會(huì)導(dǎo)致產(chǎn)量較低,短期內(nèi)難以放大。特點(diǎn):先轉(zhuǎn)錄后加帽,由于增加質(zhì)控項(xiàng)目工序繁雜(如圖2),加帽率*,但各類酶成本較高。

共轉(zhuǎn)錄加帽:使用帽類似物進(jìn)行共轉(zhuǎn)錄加帽,目前常用的帽類似物有兩種ARCA(抗-反帽結(jié)構(gòu)類似物)和Cap1帽類似物。有研究表明Cap 1結(jié)構(gòu)能夠增強(qiáng)mRNA的翻譯效率,從而提高mRNA在轉(zhuǎn)染和顯微注射實(shí)驗(yàn)中的表達(dá)。且隨著帽子結(jié)構(gòu)的不斷優(yōu)化,加帽率大幅提升,成本逐漸降低,共轉(zhuǎn)錄加帽法越來(lái)越受各類學(xué)者青睞。特點(diǎn):一步法加帽,操作簡(jiǎn)單(如圖2),使用Cap 1結(jié)構(gòu)帽類似物,加帽率可達(dá)95%,隨著帽結(jié)構(gòu)優(yōu)化研究的深入,成本逐漸降低3

 
圖2. 兩種加帽方式對(duì)比

  • 三代帽子類似物及其對(duì)比


第二代帽結(jié)構(gòu)傳統(tǒng)帽類似物ARCA:Cap 0結(jié)構(gòu)非天然加帽,存在較強(qiáng)免疫原性,加帽率80%左右,轉(zhuǎn)錄產(chǎn)量低約1.5mg/ml,成本高。

第三代帽結(jié)構(gòu)Cap1帽類似物:  Cap 1結(jié)構(gòu)模仿天然加帽,免疫原性降低,加帽率95%左右,轉(zhuǎn)錄產(chǎn)量低約4mg/ml,成本約為ARCA帽類似物的三分之一。

  • 愛(ài)必信提供幾種類型CAP(AG/AU/GG)

 Cap1帽類似物  類型  貨號(hào)  特點(diǎn)
Cap AG abs60182 模仿天然加帽、 降低免疫原性、 加帽率97-99.5%
Cap AU abs60184
Cap GG abs60183

 

  • 帽結(jié)構(gòu)5月上新

除以上帽結(jié)構(gòu),5月初我們即將重磅推出新修飾Cap 1帽結(jié)構(gòu)以及Cap 2帽結(jié)構(gòu)類似物的相關(guān)產(chǎn)品,敬請(qǐng)期待。

 

 

【參考文獻(xiàn)】:

  • Fabian M, Nils M, Andrea R. Synthetic mRNA capping[J]. Beilstein Journal of Organic Chemistry, 2017, 13:2819-2832.

  • Chen, Yu & Guo, Deyin. (2016). Molecular mechanisms of coronavirus RNA capping and methylation. Virologica Sinica. 31. 10.1007/s12250-016-3726-4.

  • Henderson JM, Ujita A, Hill E, Yousif-Rosales S, Smith C, Ko N, McReynolds T, Cabral CR, Escamilla-Powers JR, Houston ME. Cap 1 Messenger RNA Synthesis with Co-transcriptional Clean Cap® Analog by In Vitro Transcription. Curr Protoc. 2021 Feb;1(2):e39. doi: 10.1002/cpz1.39. Erratum in: Curr Protoc. 2021 Dec;1(12):e336. PMID: 33524237.

 

 

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