(1)產前篩查和產前診斷:靶向區(qū)域基因組測序、大范圍基因組測序、染色體非整倍性檢測
(2)遺傳病診斷
(3)腫瘤診斷與治療
(4)植入前胚胎遺傳學診斷
(5)病原微Th物檢測
……
根據(jù)《體外診斷試劑注冊管理辦法》(試行),體外診斷試劑可分為I類、II類、III類,其中II類、III類要求進行性能驗證,國內現(xiàn)有的個體戶診斷項目絕大多數(shù)屬于此類。
性能驗證的內容包括:精密度或重復性(定性和定量)、準確度(定性為方法學比較或與標準樣品盤比較)、線性(定量)、可報告范圍(定量)、檢出限(定性)、參考區(qū)間(定量)、抗*力等。
· 免疫組織化學參考品
· 融合基因參考品(DNA層面、RNA層面、蛋白層面)
· 基因重排參考品(DNA層面、RNA層面、蛋白層面)
· 基因突變參考品(SNV、Indel)
· CNV參考品
· 低甲基化水平參考品
· 基因組不穩(wěn)定參考品
(1)表征問題:標準品是否具有代表性,如何更具有代表性
(2)穩(wěn)定性問題:是否滿足批次內和批次間穩(wěn)定性需求
(3)來源問題:獲取途徑的穩(wěn)定性、可追溯性、可控性及可操作性
(4)成本問題:成本的可控性
(1)原始材料來源:臨床樣品;原始細胞株
(2)基因修飾材料來源
(3)不同標準品模型之間的比較
(1)隨機修飾:VIRUS-FreeTM基因導入系統(tǒng)
優(yōu)勢:流程短,無需病毒包裝;插入片段大小不受限制;表型穩(wěn)定
劣勢:需要高效的轉導方式
案例:人結直腸癌細胞HCT116/GFP穩(wěn)轉細胞株
轉染24h 藥篩3天后的熒光圖片
(2)定點修飾:基于CRISPR介導的基因編輯技術;適用于基因的定點缺失Del、定點插入Ins、定點突變SNV、拷貝數(shù)變異CNV和基因重排等。
案例:293T細胞EGFR基因V769_D770insASV點突變
(1)混合克隆 → 單克隆
(2)高代次細胞株 → 低代次細胞株
(3)病毒法 → VIRUS-FreeTM基因導入系統(tǒng)
(4)隨機插入 → 定點修飾
(5)單獨構建 → All in one
海星生物Hycyte基因檢測標準品特點
可再生 有類似檢測樣本的基因組復雜結構(異質性) 有明確的拷貝數(shù)和等位基因數(shù) 質量高度穩(wěn)定、均一性好 具有臨床標本和腫瘤細胞的特性 無倫理風險
海星生物專注細胞基因編輯(基因敲除\敲入\突變\過表達)十年:為基因檢測提供參考品細胞株開發(fā),已經和多家基因診斷公司建立合作。海星生物可以提供診斷試劑盒標準品定制化服務,為客戶定制拷貝數(shù)固定(或高突變頻率)的單核苷酸變異(SNV)、堿基缺失(Deletion)、堿基插入(Insertion)、基因融合(Fusion)、拷貝數(shù)變異(CNV)等各種變異類型的標準品細胞株,可應用于基因檢測的上游試劑盒研發(fā)、企業(yè)參考盤注冊申報、生產質檢,下游ICL的日常質控、EQA支持。解決臨床樣本有限,稀有突變難獲得的問題。還可以訂制開發(fā)IHC(免疫組化)標準品細胞株,解決細胞系表達豐度不穩(wěn)定,染色深淺不一的問題。此外針對腫瘤早篩甲基化檢測試劑盒,海星生物可以提供低甲基化水平DNA參考物質。

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