核酸染料是一種花青素染料,毒性低,使用安全,能有效保護實驗操作人員和環(huán)境。
1、無毒性。油性大分子特性使其無法穿透細胞膜進入細胞。Ames試驗結(jié)果也表明,這種染料的致突變性遠遠低于EB。
2、靈敏度高。適用于各種大小片段的電泳染色,對核酸遷移的影響小。
3、穩(wěn)定性高:核酸染料適用于用微波或其他加熱方法制備瓊脂糖凝膠;在室溫下的酸或堿緩沖液中極為穩(wěn)定,耐光性強。
4、信噪比好:樣品的熒光信號強,背景信號低,熒光強度是EB的十倍以上,亮度明顯強于EB。
5、操作簡單。與EB一樣,染料在預(yù)制凝膠和電泳過程中不會降解;電泳后的染色過程也只需30分鐘,無需脫色或洗滌,可直接用紫外凝膠透射儀觀察。
6、適用范圍廣??梢赃x擇電泳前染色(凝膠染色)或電泳后染色(氣泡染色);適用于瓊脂糖凝膠或聚丙烯酰胺凝膠電泳;可用于dsDNA、ssDNA或RNA的染色。
7、核酸染料具有理想的兼容性。具有與EB相同的光譜特性,不需要更換濾光片和觀察裝置:標準EB濾光片或SYBR濾光片都適用,可以用與EB觀察相同的普通紫外凝膠透射儀觀察,在300nm紫外光附近可以獲得最佳激發(fā)。但SuperRed不能*被488nm氬離子激光或類似波長的可見光激發(fā),所以不建議使用此類激發(fā)裝置的成像系統(tǒng)。
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