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1962年，下村修和約翰森從維多利亞多管水母（Aequorea victoria）中分離生物發(fā)光蛋白-水母素（aequorin）時，意外地得到了一個副產(chǎn)物。它在陽光下呈綠色、鎢絲下呈黃色、紫外光下發(fā)強(qiáng)烈綠色。其后他們仔細(xì)研究了其發(fā)光特性。1974年，他們得到了這個蛋白，當(dāng)時稱綠色蛋白、以后稱綠色熒光蛋白（GFP）。GFP在水母中之所以能發(fā)光，是因?yàn)樗杆睾虶FP之間發(fā)生了能量轉(zhuǎn)移。水母素在鈣刺激下發(fā)光，其能量可轉(zhuǎn)移到GFP，刺激GFP發(fā)光。這是物理化學(xué)中已知的熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)在生物中的發(fā)現(xiàn)。
熒光蛋白廣泛應(yīng)用于生物學(xué)研究。通過常規(guī)的基因操縱手段，將熒光蛋白用來標(biāo)記其他目標(biāo)蛋白，這樣可以觀察、跟蹤目標(biāo)蛋白的時間、空間變化，提供了以前不能達(dá)到的時間和空間分辨率，而且可以在活細(xì)胞、活體動物中觀察到一些分子。熒光蛋白技術(shù)也使得人們可以研究某些分子的活性，而不僅僅是其存在與否。
GFP熒光極其穩(wěn)定，在激發(fā)光照射下，GFP抗光漂白（Photobleaching）能力比熒光素（fluorescein）強(qiáng)，特別在450～490nm藍(lán)光波長下更穩(wěn)定。
GFP需要在氧化狀態(tài)下產(chǎn)生熒光，強(qiáng)還原劑能使GFP轉(zhuǎn)變?yōu)榉菬晒庑问剑坏┲匦卤┞对诳諝饣蜓鯕庵?，GFP熒光便立即得到恢復(fù)。而一些弱還原劑并不影響GFP熒光。中度氧化劑對GFP熒光影響也不大，如生物材料的固定、脫水劑戊二酸或甲醛等。
GFP融合蛋白的熒光靈敏度遠(yuǎn)比熒光素標(biāo)記的熒光抗體高，抗光漂白能力強(qiáng)，因此更適用于定量測定與分析。但因?yàn)镚FP不是酶，熒光信號沒有酶學(xué)放大效果，因此GFP靈敏度可能低于某些酶類報告蛋白。
由于GFP熒光是生物細(xì)胞的自主功能，熒光的產(chǎn)生不需要任何外源反應(yīng)底物，因此GFP作為一種廣泛應(yīng)用的活體報告蛋白，其作用是任何其它酶類報告蛋白無法比的。
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