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BD單細胞測序聯(lián)合Absin多色,共同探索腦部腫瘤微環(huán)境

來源:愛必信(上海)生物科技有限公司   2022年12月15日 15:20  

腦惡性腫瘤又常稱為腦癌,分原發(fā)性和繼發(fā)性兩大類:原發(fā)性腦惡性腫瘤以腦膠質(zhì)瘤最多,是一種起源于腦神經(jīng)膠質(zhì)細胞的腫瘤;繼發(fā)性腫瘤主要是指其他部位的腫瘤轉移到腦內(nèi)形成的腦轉移性腫瘤,其發(fā)病率約是原發(fā)腫瘤的10倍,肺癌就是常見的原發(fā)癌種之一。

2022年11月6日,復旦大學腫瘤醫(yī)院金偉教授和曹依群教授團隊在Clin. Transl. Med(IF=8.554)上發(fā)表了題為“Single-cell RNA sequencing reveals cellular and molecular reprograming landscape of gliomas and lung cancer brain metastases”的文章,通過scRNA-seq技術(BD Rhapsody system)聯(lián)合多重熒光免疫組化(abs50015,Absin),解析了GM和LC細胞的異質(zhì)性,發(fā)現(xiàn)了一組具有特異性分子標記的干細胞樣細胞,對于肺癌腦轉移的免疫療法有重要的指導性意義。




取樣、測序、分析和組織原位驗證的全流程

研究中,科學家們發(fā)現(xiàn)一部分增殖巨噬細胞簇與不良預后相關。氣泡圖顯示了中樞神經(jīng)系統(tǒng)駐留小膠質(zhì)細胞(CNS)以及單核細胞來源的巨噬細胞(MDMs)表達TAMs相關基因的情況,其中CD163在MDMs高表達,而在CNS顯著低表達。通過小提琴圖分析可得,TOP2A基因在增殖巨噬細胞的分布(后兩列),中位值都比其他細胞更好。后續(xù)研究團隊通過對TOP2A和CD163進行多重免疫熒光染色在組織蛋白層面驗證了細胞群。


癌癥干細胞(CSCs)是會導致癌癥轉移和化療或放療耐藥性的細胞亞群。研究團隊通過拷貝數(shù)變異分析鑒定了惡性細胞并劃分為10個惡性上皮細胞亞群,基于CytoTRACE分析和擬時序分析顯示,惡性上皮細胞亞群中Mep_C3和C8分化程度較低,可能包含CSCs。為了證實Mep_C3和_C8在LC組織中的存在,團隊通過多重免疫組化檢測了主要標記物的表達(EPCAM/DKK1/TRIM29),發(fā)現(xiàn)DKK1和TRIM29在這些細胞中特異性富集。



總的來說,團隊的研究結果為小膠質(zhì)細胞、巨噬細胞、中性粒細胞、ECs和T細胞的特征提供了特別的見解,還發(fā)現(xiàn)了癌癥干細胞的一個子集,這將加深對大腦腫瘤微環(huán)境的理解,從而為精準醫(yī)療的患者管理提供一些改善思路。

 

多色小知識

多色即多重熒光免疫組化(mIHC),主要原理來自TSA技術,TSA即酪酰胺信號放大(Tyramide signal amplification)是一類利用辣根過氧化酶(HRP)對靶蛋白或核酸進行高密度原位標記的酶學檢測方法。該技術可與高性能染料Alexa Fluor®、傳統(tǒng)熒光染料和比色檢測系統(tǒng)相兼容。

TSA主要原理是利用酪胺Tyramide的過氧化物酶反應(酪胺鹽在HRP催化H2O2下形成共價鍵結合位點),產(chǎn)生大量的酶促產(chǎn)物,該產(chǎn)物能與周圍的蛋白殘基(包括色氨酸、組氨酸和酪氨酸殘基)結合,這樣在抗原-抗體結合部位就有大量的生物素沉積,與隨后加入的Streptavidin—HRP/熒光基團結合,經(jīng)幾次這樣的循環(huán)放大,可以結合大量的酶分子or熒光基團,結果使其檢測信號得到幾何級放大。

簡單來說,用這種方法做多重熒光染色是利用二抗上帶有的HRP(而不是直接偶聯(lián)熒光素),來催化后續(xù)添加入體系的非活性熒光素。該熒光素在HRP和過氧化氫的作用下被活化,跟臨近蛋白的酪氨酸殘基共價偶聯(lián),使得蛋白樣品與熒光素穩(wěn)定結合。然后進行微波處理,前一輪非共價結合的抗體被洗掉,共價結合的熒光素還留存在樣品上。再換個一抗來第二輪孵育,周而復始。等到所有抗體孵育結束,熒光素都結合好后,最后去檢測結果。



TSA多重熒光免疫組化染色示意圖

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四色多重熒光免疫組化染色試劑盒(鼠兔二抗)

20T/100T

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四色多重熒光免疫組化染色試劑盒(兔二抗)

20T/100T

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五色多重熒光免疫組化染色試劑盒(鼠兔二抗)

20T/100T

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五色多重熒光免疫組化染色試劑盒(兔二抗)

20T/100T

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六色多重熒光免疫組化染色試劑盒(鼠兔二抗)

20T/100T

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六色多重熒光免疫組化染色試劑盒(兔二抗)

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七色多重熒光免疫組化染色試劑盒(鼠兔二抗)

20T/100T

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abs50031

七色多重熒光免疫組化染色試劑盒(兔二抗)

20T/100T

現(xiàn)貨


個性化服務(先做預實驗,實驗有保障?。?/strong>



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種屬

六色  FLASH panel

應用

備注

panCK、CD3、CD19、CD68、CD56

常規(guī)腫瘤浸潤淋巴細胞panel,可評估腫瘤微環(huán)境冷熱,方便探究腫瘤抑制手段效果

可更換其他免疫細胞指標及腫瘤指標

小鼠

panCK、CD3、CD19、F4/80、NK1.1

CD4、CD8、LAG3、TIM-3、PD-1

涵蓋多熱門免疫檢查點

可替換其他染過的免疫檢查點指標

小鼠

CD4、CD8、LAG3、TIM-3、PD-1

種屬

五色  FLASH panel

應用

備注

CD3、CD4、CD8、FOXP3

T細胞分型panel

FOXP3可替換為TH1指標T-bet或者TH2指標GATA-3

小鼠

CD3、CD4、CD8、FOXP3

panCK、CD68、CD163、HLA-DR

腫瘤相關巨噬細胞TAM及分型panel

小鼠

panCK、F4/80、CD86、CD163

panCK、CD8、PD-1、PD-L1

經(jīng)典PD-1/PDL1可行性分析panel

種屬

四色  FLASH panel

應用

備注

a-SMA、panCK、VEGF

腫瘤相關成纖維及血管生成因子

可更換FAP、VIM、FGF等相關因子

小鼠

a-SMA、panCK、VEGF

CD8、ki-67、Granzyme B

T細胞活化及增殖panel

小鼠

CD8、ki-67、Granzyme B


參考文獻:

Sun HF, Li LD, Lao IW, Li X, Xu BJ, Cao YQ, Jin W. Single-cell RNA sequencing reveals cellular and molecular reprograming landscape of gliomas and lung cancer brain metastases. Clin Transl Med. 2022 Nov;12(11):e1101. doi: 10.1002/ctm2.1101. PMID: 36336787; PMCID: PMC9637666.


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