蛋白八聚體由組蛋白H2A、H2B、H3和H4的各兩個亞基組成，由DNA包裹形成核小體。組蛋白亞基的N末端含有可進行翻譯后修飾的殘基。H3上的賴氨酸殘基K4可以單、二或三甲基化，分別形成H3K4me1、H3K4me2或H3K4me3。H3K4me1、H3K4me2和H3K4me3位于整個基因組的不同區(qū)域。H3K4me1修飾主要分布在活性增強子元件中；H3K4me2修飾主要分布在轉(zhuǎn)錄活躍基因的gene body區(qū)；而H3K4me3修飾主要分布在TSS附近的啟動子區(qū)并激活轉(zhuǎn)錄。

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圖片來源: PMID: 30616667

關(guān)于H3K4me1

H3K4me1是組蛋白H3蛋白的第4個賴氨酸殘基處的單甲基化，通常與基因增強子相關(guān)。H3K4me1富集在活性和primed增強子區(qū)域內(nèi)。增強子由組蛋白H3K4單/二甲基轉(zhuǎn)移酶MLL4引發(fā)，然后由組蛋白H3K27乙酰轉(zhuǎn)移酶p300激活。H3K4me1會微調(diào)增強子的活性和功能，而不是控制。具有MLL3/4的H3K4me1也可以作用于啟動子并抑制基因。H3K4me1修飾是真核細(xì)胞增強子的表觀遺傳學(xué)標(biāo)記，可用于增強子在基因組上定位。

EpiCypher H3K4me1抗體

EpiCypher在CUT&RUN和CUT&Tag實驗中篩選了數(shù)百種抗體，并通過獨-有的SNAP-Certification技術(shù)進行驗證，為研究者提供了可識別經(jīng)過修飾的組蛋白和相關(guān)細(xì)胞靶點的組蛋白PTM抗體。H3K4me1抗體是EpiCypher最新推出的SNAP-Certified™抗體之一，符合CUT&RUN和CUT&Tag應(yīng)用中特異性和有效靶標(biāo)富集的標(biāo)準(zhǔn)。

產(chǎn)品詳情

實例分析

圖1. CUT&RUN中SNAP特異性分析

圖2. CUT&Tag中SNAP特異性分析

使用SNAP-CUTANA™ K-MetStat Panel對H3K4me1抗體進行分析，其與相關(guān)組蛋白PTMs的交叉反應(yīng)性<20%。

圖3. CUT&RUN和CUT&Tag全基因組富集

H3K4me1抗體和H3K4me3陽性對照產(chǎn)生預(yù)期的富集效果，不同數(shù)量細(xì)胞核的結(jié)果保持一致。

500k和50k K562細(xì)胞CUT&RUN 峰圖

圖4. H3K4me1抗體CUT&RUN和CUT&Tag峰圖

H3K4me1抗體在CUT&RUN和CUT&Tag應(yīng)用中符合EpiCypher特定批次SNAP-Certified™標(biāo)準(zhǔn)，并且不同的細(xì)胞數(shù)量下，一致的基因組富集證實了高靶向效率。

關(guān)于EpiCypher

EpiCypher是一家成立于2012年的表觀遺傳學(xué)公司。從專有組蛋白肽陣列平臺EpiGold™開始，EpiCypher開發(fā)了一系列同類產(chǎn)品。同時，EpiCypher是重組核小體制造和開發(fā)的全球領(lǐng)-導(dǎo)-者。利用其獨-有技術(shù)，不斷添加高純度修飾重組核小體（dNucs™）產(chǎn)品。dNuc™多樣性的產(chǎn)品為破譯組蛋白編碼和加速藥物開發(fā)提供了強大的工具。

EpiCypher還將dNuc™技術(shù)廣泛的應(yīng)用于多種分析測定產(chǎn)品中，包括：SNAP-ChIP®Spike-in Controls（用于抗體分析和ChIP定量）， EpiDyne®底物（用于染色質(zhì)重塑和抑制劑篩選及開發(fā)），dCyher™測定（用于探究表觀遺傳蛋白質(zhì)-組蛋白PTM結(jié)合相互作用）。最近，EpiCypher還推出了針對ChIC、CUT&RUN和CUT&Tag的高靈敏度表觀基因組圖譜CUTANA™分析。

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