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常用的方法是使用溶液法進(jìn)行蛋白質(zhì)提取（例如RIPA裂解物），但是在蛋白質(zhì)提取中通常會(huì)產(chǎn)生兩種不同的成分，即RIPA可溶性和RIPA不溶性成分。通常，RIPA不溶成分會(huì)被我們直接丟棄并忽略。但是有文章證實(shí)，丟棄的RIPA不溶成分中存在許多蛋白質(zhì)。換句話說(shuō)，通過(guò)溶液法提取的總蛋白質(zhì)不是完整的蛋白質(zhì)，而只是一些可溶性蛋白質(zhì)。
蛋白質(zhì)的溶液提取將人工激活caspase-3和caspase-7；它還會(huì)人為地激活某些激酶活性；影響磷酸化研究；影響細(xì)胞外基質(zhì)；影響定量，定性蛋白質(zhì)研究。目前，通過(guò)離心柱法提取蛋白質(zhì)可以解決上述問(wèn)題。只需通過(guò)柱子添加裂解物和離心機(jī)，而不會(huì)產(chǎn)生不溶成分，就可以提取出完整的總蛋白。
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