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環(huán)狀RNA研究利器—RNase R,助力環(huán)狀RNA加速發(fā)展!

來(lái)源:翌圣生物科技(上海)股份有限公司   2023年06月12日 14:28  

近年來(lái),mRNA疫苗/藥物逐漸走入大眾的視野。mRNA疫苗/藥物具有設(shè)計(jì)快速、成本低和易于規(guī)?;a(chǎn)的優(yōu)點(diǎn),但由于mRNA本身易降解,目前主要通過(guò)加帽加尾的方式提高mRNA制劑的穩(wěn)定性,并輔助mRNA的翻譯。近年來(lái),研究者們?cè)诙喾N生物中發(fā)現(xiàn)了一種新型RNA——環(huán)狀RNA(circular RNA, circRNA),此類RNA呈共價(jià)閉合環(huán)狀結(jié)構(gòu),不易被核酸外切酶降解,較mRNA更加穩(wěn)定,且可以實(shí)現(xiàn)非帽依賴蛋白質(zhì)翻譯。因此circRNA的發(fā)現(xiàn)為開(kāi)發(fā)新一代生產(chǎn)工藝更簡(jiǎn)單、穩(wěn)定性更好和時(shí)效更長(zhǎng)的RNA疫苗及藥物提供可能。


 

圖1 :RNA疫苗作用過(guò)程[1]

 

circRNA生產(chǎn)過(guò)程包括:模板制備、體外轉(zhuǎn)錄、DNA模板去除、環(huán)化和純化。在RNA環(huán)化后需要用核糖核酸酶R (Ribonuclease R, RNase R)對(duì)未環(huán)化的RNA進(jìn)行消化,達(dá)到富集circRNA的目的。當(dāng)前主流使用的RNase R主要為進(jìn)口品牌,存在價(jià)格高、貨期久等問(wèn)題,不適合用于大批量生產(chǎn)。翌圣擁有雙向分子酶理性設(shè)計(jì)與定向進(jìn)化平臺(tái)和專門為GMP級(jí)別產(chǎn)品打造的分子酶生產(chǎn)基地,從硬件和軟件上同時(shí)保證產(chǎn)品的品質(zhì)。經(jīng)過(guò)對(duì)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)進(jìn)行理性設(shè)計(jì)和基于超高通量單細(xì)胞分選技術(shù)的定向進(jìn)化,翌圣研發(fā)團(tuán)隊(duì)成功開(kāi)發(fā)出一款純度高、消化活性強(qiáng)的RNase R產(chǎn)品,為新一代RNA疫苗/藥物上市提供助力!

 

 

翌圣RNase R
 

翌圣生物RNase R(Cat#14606ES)是一種來(lái)源于大腸桿菌的Mg2+依賴性3'→5'核糖核酸外切酶,它能消化所有的線性RNA,不易消化circRNA、套索RNA或3’端突出末端少于7 個(gè)核苷酸的雙鏈RNA分子,常用于去除線性RNA分子,實(shí)現(xiàn)富集circRNA和套索RNA等非線性RNA的目的。

 

 

產(chǎn)品特點(diǎn)
 
  • 蛋白純度(SDS-PAGE)≥95%;

  • 無(wú)核酸外切酶殘留;

  • 與A進(jìn)口品牌RNase R產(chǎn)品消化線性RNA能力相當(dāng);

  • 與A進(jìn)口品牌RNase R產(chǎn)品對(duì)circRNA富集作用相當(dāng)。

 

 

性能展示
 

 

蛋白純度(SDS-PAGE)≥95%

 

圖2:蛋白純度檢測(cè):使用SDS-PAGE技術(shù)檢測(cè)產(chǎn)品的蛋白純度,從左到右依次為相同產(chǎn)品濃度下不同體積(1 μL,2 μL,3 μL)的結(jié)果,結(jié)果表明翌圣RNase R(Cat#14606ES)產(chǎn)品蛋白純度≥95%。

 

無(wú)核酸外切酶殘留

 

圖3:核酸外切酶殘留檢測(cè):將20 U 翌圣RNase R加入到 0.5 μg λDNA- Hind Ⅲ digest中,于37℃孵育4小時(shí),之后進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳 ,結(jié)果顯示DNA 條帶未發(fā)生變化,說(shuō)明翌圣RNase R(Cat#14606ES)產(chǎn)品無(wú)核酸外切酶殘留。

 

與A進(jìn)口品牌RNase R產(chǎn)品消化線性RNA能力相當(dāng)

 

圖4:翌圣RNase R(Cat#14606ES)產(chǎn)品與A進(jìn)口廠家RNase R產(chǎn)品消化線性RNA能力比較:將翌圣RNase R(Cat#14606ES)產(chǎn)品與A進(jìn)口廠家RNase R產(chǎn)品分別投入含有線性RNA底物的反應(yīng)體系中進(jìn)行反應(yīng),結(jié)果顯示當(dāng)RNase R產(chǎn)品的投入量達(dá)到2-4 U時(shí),可觀察到RNA條帶變微弱甚至消失,表明RNase R對(duì)線性RNA分子具有消化作用,且翌圣RNase R(Cat#14606ES)產(chǎn)品與A進(jìn)口廠家RNase R產(chǎn)品對(duì)線性RNA分子的消化能力相當(dāng)。

 

與A進(jìn)口品牌RNase R產(chǎn)品對(duì)circRNA富集作用相當(dāng)

 

圖5:翌圣RNase R(Cat#14606ES)產(chǎn)品與A進(jìn)口廠家RNase R產(chǎn)品對(duì)circRNA的富集作用比較:將翌圣(Cat#14606ES)產(chǎn)品與A進(jìn)口廠家RNase R產(chǎn)品分別投入含有circRNA底物的反應(yīng)體系中進(jìn)行反應(yīng),結(jié)果顯示經(jīng)過(guò)翌圣RNase R(Cat#14606ES)產(chǎn)品與A進(jìn)口廠家RNase R產(chǎn)品處理后的RNA條帶亮度基本無(wú)差別,表明circRNA能耐受RNase R的消化。以上結(jié)果證實(shí)翌圣(Cat#14606ES)產(chǎn)品與A進(jìn)口廠家RNase R產(chǎn)品均能有效用于circRNA富集。

 

 

客戶反饋
 

 

翌圣RNase R對(duì)線性RNA的切割效果優(yōu)于其他品牌

 

圖6:翌圣(Cat#14606ES)產(chǎn)品與廠家A和B的RNase R消化線性mRNA分子效果比較:將翌圣RNase R(Cat#14606ES)產(chǎn)品與廠家A和B的RNase R產(chǎn)品分別投入含有1 μg 線性mRNA底物的反應(yīng)體系中進(jìn)行反應(yīng),結(jié)果顯示翌圣RNase R(Cat#14606ES)產(chǎn)品對(duì)線性RNA的消化效果優(yōu)于廠家A和B的RNase R。(數(shù)據(jù)來(lái)源于深圳**客戶)

 

 

YEASEN體外轉(zhuǎn)錄相關(guān)產(chǎn)品
 

 

產(chǎn)品名稱

產(chǎn)品貨號(hào)

產(chǎn)品規(guī)格

RNase R (20 U/μL)

14606ES

250U/2500U/10000U

T7 RNA Polymerase GMP-grade (50 U/μL)

10624ES

5000U/50000U

T7 RNA Polymerase GMP-grade (250 U/μL)

10625ES

10KU/100KU/2500KU/100MU

mRNA Vaccinia Capping Enzyme GMP-grade (10 U/μL)

10614ES

2000U/10000U/100000U/5MU

mRNA Cap 2′-O-Methyltransferase GMP-grade (50 U/μl)

10612ES

10KU/50KU/250KU/20MU

Pyrophosphatase, Inorganic GMP-grade (1 U/μL)

10620ES

10 U/100U/1000U/40KU

Deoxyribonuclease I (DNase I) GMP-grade (2 U/μL)

10611ES

500U/2000U/10000U

Murine RNase inhibitor GMP-grade (40 U/μL)

10621ES

10KU/20KU/100KU/1MU

 

參考文獻(xiàn):

  1. Qu L, Yi Z, Shen Y, et al. Circular RNA vaccines against SARS-CoV-2 and emerging variants. Cell. 2022;185(10):1728-1744.e16. doi:10.1016/j.cell.2022.03.044

  2. Chen L, Wang C, Sun H, et al. The bioinformatics toolbox for circRNA discovery and analysis. Brief Bioinform. 2021;22(2):1706-1728. doi:10.1093/bib/bbaa001



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