GelRed是一種穩(wěn)定、安全、靈敏的核酸熒光染料，通過靜電及電荷相互作用結(jié)合到核酸上，可直接替代劇毒的溴化乙錠（EB），且靈敏度遠(yuǎn)高于EB，常用于瓊脂糖凝膠或聚丙烯酰胺凝膠中dsDNA（雙鏈DNA）、ssDNA（單鏈DNA）或RNA的染色。GelRed結(jié)合單鏈DNA和RNA熒光信號約是結(jié)合雙鏈DNA的一半左右。

經(jīng)過一系列的測試，GelRed對于手套和細(xì)胞膜都是不能穿透的。在濃度遠(yuǎn)高于凝膠染色工作濃度的情況下，染料也是無細(xì)胞毒性和非誘變性的。

GelRed 是如何工作的？

與溴化乙錠一樣，GelRed 是一種嵌入 DNA 的核酸染料。GelRed 僅通過嵌入結(jié)合。

當(dāng)顯示紫外光時，嵌入的 GelRed 會發(fā)出熒光，產(chǎn)生明亮的橙色光。 兩種產(chǎn)品的光譜幾乎相同； 然而，GelRed 被認(rèn)為是比 EtBr 更安全的替代品，而且更敏感。 GelRed 的另一個好處是它能夠與 dsDNA、ssDNA 和 RNA 一起工作，而對于 dsDNA，它的靈敏度是 ssDNA 和 RNA 的兩倍。

比較GelRed和溴化乙錠（EB）在1％瓊脂糖預(yù)制凝膠（TBE緩沖溶液）中的染色效果。使用1kb Plus DNA Ladder樣品兩倍梯度稀釋上樣，各泳道上樣量從左到右依次為200ng，100ng，50ng和25ng。使用300nm激發(fā)的凝膠成像系統(tǒng)和EB濾光片成像并使用Polaroid 667黑白打印 

如果 GelRed 是一種嵌入劑，為什么它沒有與溴化乙錠相同的風(fēng)險？

如果它仍然要直接與 DNA 結(jié)合，想知道它如何才能真正安全似乎是合乎邏輯的。 雖然 GelRed 和 EtBr 都嵌入 DNA，但 GelRed 的創(chuàng)建使其不會穿透細(xì)胞膜。 因為它不能穿透細(xì)胞膜，所以 GelRedTM 對活細(xì)胞沒有毒性。

GelRed：用于聚丙烯酰胺凝膠（PAGE）的核酸凝膠染色劑

原始的GelRed®染料的安全性部分得益于其較大的分子尺寸，這使得該染料對于細(xì)胞膜具有不可滲透性。然而，這種大分子尺寸也會降低GelRed® 染料進入密集的聚丙烯酰胺凝膠的能力。為了解決這個問題，Biotium采用了一種新方法，使得新版本的PAGE GelRed®染料具有細(xì)胞膜不可滲透性，而不會使其分子尺寸過大

PAGE GelRed®核酸凝膠染料：

• 一種安全而敏感的聚丙烯酰胺凝膠染料

• 在AMES試驗中無毒性和無致突變性

• 水基配方，不滲透乳膠和丁腈手套

• 對水生生物無毒，可由EPA Title 22危險廢物測試進行排放處置。

為什么 GelRed 會改變 DNA 的遷移？

GelRedTM 影響 DNA 遷移的原因有很多。 請記住，所有核酸染料都會對 DNA 的移動方式產(chǎn)生一定的影響。 GelRedTM 是一種比 EtBr 重得多的染料，GelRed 對 DNA 的親和力意味著凝膠中加載的 DNA 越多，GelRedTM 與 DNA 結(jié)合并扭曲該片段的運動的次數(shù)就越多。

一些防止或最小化 GelRed對遷移影響的建議是： 將其用作后染色劑（我們對此再強調(diào)不過分）。 確保您的 GelRed 儲備溶液已適當(dāng)稀釋。 您可能還需要減少您使用的 DNA 量，以盡量減少遷移干擾的影響。

GelRed 和 GelGreen 有什么區(qū)別？

1.每種產(chǎn)品的熒光。 如您所料，GelRed 會發(fā)出類似于溴化乙錠的紅色熒光。GelGreen 會發(fā)出與 SYBR Green 非常相似的綠色熒光。 任何一種產(chǎn)品都可以與紫外線透射儀一起使用。

2.染色敏感性。 GelRed 是一種比 GelGreen 更敏感的染色劑（靈敏度大約是 GelGreenTM 的五倍），尤其是對于單鏈核酸。

3.在應(yīng)用方面，GelRed與聚丙烯酰胺凝膠兼容，但不推薦用于 GelGreen。

4.使用 GelGreen 的一個優(yōu)點是它與藍(lán)光透射儀的兼容性，如果您想避免紫外線照射，這將很有幫助